135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1250 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1250  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  387  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.000000121941  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1273  YceI-like family protein  33.09 
 
 		 187 aa  67  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7381  YceI  32.35 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.398085  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2382  YceI-like family protein  32.35 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.946039  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3377  YceI-like family protein  32.35 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0298  hypothetical protein  32.35 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1160  YceI-like family protein  32.35 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3333  YceI  32.35 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3367  hypothetical protein  32.35 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2568  hypothetical protein  32.35 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3804  hypothetical protein  31.62 
 
 		 211 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0232  YceI  31.62 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.145864  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0716  YceI family protein  31.62 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.943663  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0683  YceI family protein  31.62 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2530  YceI family protein  31.45 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2669  YceI family protein  31.62 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.115653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4183  YceI family protein  27.44 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0631  YceI family protein  30.88 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2066  hypothetical protein  30.58 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0648985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2953  hypothetical protein  28.57 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.386991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0607  YceI family protein  30.15 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2816  YceI  30.53 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  26.78 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5860  YceI family protein  30.58 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  29.21 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  29.21 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  28.57 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2961  YceI family protein  32.23 
 
 		 198 aa  57.8  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  30.9 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  26.55 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  30.9 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0704  YceI family protein  31.4 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203879  normal  0.494453 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4409  YceI family protein  27.52 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5071  YceI-like family protein  30.65 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0457  hypothetical protein  30.65 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2551  YceI family protein  31.4 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.277477  normal  0.298445 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0457  YceI family protein  24.55 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2817  YceI  27.5 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5030  hypothetical protein  30.65 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3995  hypothetical protein  27.22 
 
 		 189 aa  54.3  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0645736  normal  0.347265 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1782  YceI  28 
 
 		 204 aa  53.9  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0100028 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  30.19 
 
 		 191 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  30.19 
 
 		 191 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  30.19 
 
 		 191 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  30.19 
 
 		 191 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  30.19 
 
 		 191 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  30.19 
 
 		 191 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  30.19 
 
 		 191 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0484  hypothetical protein  29.84 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.611751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  30.19 
 
 		 191 aa  53.1  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  30.19 
 
 		 191 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4981  hypothetical protein  29.03 
 
 		 204 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4854  hypothetical protein  29.03 
 
 		 192 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393068  normal  0.0523451 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1570  hypothetical protein  28.93 
 
 		 192 aa  51.6  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.599107 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3505  YceI family protein  29.75 
 
 		 191 aa  51.2  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.781833 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1092  YceI family protein  23.78 
 
 		 195 aa  50.4  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00011726  normal  0.0389048 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1150  periplasmic protein  29.37 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.138125  normal  0.79265 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2451  YceI family protein  25.68 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  23.66 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1314  hypothetical protein  28.91 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0185349  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1519  YceI family protein  26.67 
 
 		 191 aa  49.7  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01689  YceI like family  25.5 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2717  signal peptide protein  28.93 
 
 		 198 aa  49.3  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.999831  normal  0.128957 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2216  hypothetical protein  29.82 
 
 		 191 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933696  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2032  hypothetical protein  29.82 
 
 		 191 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1253  hypothetical protein  29.82 
 
 		 191 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.845086 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1268  hypothetical protein  29.82 
 
 		 191 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1224  hypothetical protein  29.82 
 
 		 191 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.984654  normal  0.418516 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  26.45 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1848  YceI  24.63 
 
 		 200 aa  48.9  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.735332 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3992  YceI family protein  25.52 
 
 		 188 aa  48.5  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4023  YceI family protein  24.85 
 
 		 242 aa  48.5  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0890  YceI  25.14 
 
 		 220 aa  47.4  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  26.57 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3257  YceI family protein  26.67 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5284  hypothetical protein  26.77 
 
 		 208 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.547725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0815  hypothetical protein  24.83 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.090251 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1721  YceI family protein  26.37 
 
 		 188 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.292781 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2505  YceI family protein  27.15 
 
 		 179 aa  47  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0958427 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1738  YceI family protein  26.23 
 
 		 188 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1536  YceI family protein  26.23 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  25.62 
 
 		 183 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4627  YceI family protein  27.52 
 
 		 175 aa  45.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0780  hypothetical protein  30.59 
 
 		 196 aa  45.4  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.263048  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1199  YceI family protein  26.14 
 
 		 183 aa  45.4  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144393  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  27.01 
 
 		 202 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1735  hypothetical protein  26.92 
 
 		 188 aa  45.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1799  hypothetical protein  26.75 
 
 		 188 aa  45.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2283  YceI family protein  30.07 
 
 		 189 aa  45.1  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3325  YceI family protein  27.03 
 
 		 178 aa  44.7  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106411 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4031  YceI  25 
 
 		 182 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4106  YceI family protein  25 
 
 		 182 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4261  YceI family protein  25 
 
 		 182 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651401  normal  0.0270494 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1028  YceI family protein  25.62 
 
 		 191 aa  44.7  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2184  putative cytochrome B561  25.45 
 
 		 400 aa  44.7  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1859  YceI family protein  25.19 
 
 		 192 aa  44.7  0.0009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4591  YceI family protein  25.99 
 
 		 190 aa  43.9  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3690  YceI family protein  25.66 
 
 		 190 aa  44.7  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.442684  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0715  YceI family protein  26.96 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2670  YceI family protein  28.18 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.415789  normal  0.822376 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>