More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0988 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0988  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
286 aa  562  1.0000000000000001e-159  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.52691  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2314  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.99 
 
 
278 aa  306  3e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8402  choline ABC transporter, permease protein  56.58 
 
 
285 aa  304  9.000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.144264  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.27 
 
 
281 aa  302  3.0000000000000004e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.542152 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0852  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.09 
 
 
284 aa  301  8.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.147655  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2180  ABC glycine betaine/L-proline transporter, inner membrane subunit  53.09 
 
 
284 aa  300  3e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0320  choline ABC transporter, permease protein  53.85 
 
 
281 aa  299  4e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0295  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  53.48 
 
 
281 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.698088  hitchhiker  0.0000339096 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.48 
 
 
281 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.247617  normal  0.0422792 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4913  choline ABC transporter, permease protein  53.48 
 
 
281 aa  297  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00412098 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06177  glycine betaine/L-proline ABC transporter permease protein  55.2 
 
 
280 aa  296  2e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4710  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  53.82 
 
 
281 aa  296  3e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1580  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein, putative  54.87 
 
 
278 aa  294  9e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0463  glycine/betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  53.45 
 
 
281 aa  293  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1525  putative glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  54.87 
 
 
278 aa  293  2e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.68 
 
 
278 aa  293  3e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.202095  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2074  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  52.84 
 
 
291 aa  292  4e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.728826  normal  0.746604 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5239  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  52.54 
 
 
287 aa  288  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.659983  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.97 
 
 
281 aa  287  2e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.568603  normal  0.226426 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1900  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.07 
 
 
283 aa  286  2.9999999999999996e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.327714 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000362  L-proline Glycine Betaine ABC transport system permease protein proW  56.49 
 
 
266 aa  285  5e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.620061  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3282  ABC transporter membrane spanning protein (proline/glycine betaine)  54.04 
 
 
281 aa  283  2.0000000000000002e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3093  choline ABC transporter, permease protein  52.71 
 
 
285 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.499951  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2824  choline ABC transporter, permease protein  53.07 
 
 
281 aa  278  8e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.730549  normal  0.134346 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71020  putative BC-type proline/glycine betaine transport system, permease component  55.72 
 
 
279 aa  276  3e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6162  choline ABC transporter permease  55.72 
 
 
279 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.47 
 
 
327 aa  261  1e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00444085  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2584  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.47 
 
 
293 aa  238  1e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00518726  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0691  putative glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  46.36 
 
 
299 aa  232  4.0000000000000004e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.18849  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0739  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein, putative  46.36 
 
 
301 aa  232  5e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.483672  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2377  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  46.97 
 
 
274 aa  232  5e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.336492 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5091  choline ABC transporter, permease protein  43.07 
 
 
298 aa  230  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.674099 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4566  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.07 
 
 
298 aa  230  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.669781 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5108  choline ABC transporter, permease protein  43.07 
 
 
298 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0502  ABC glycine betaine/L-proline transporter, inner membrane subunit  44.32 
 
 
276 aa  229  3e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.819479  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3196  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.07 
 
 
298 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5171  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.07 
 
 
298 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00870989  normal  0.647601 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0456  ABC glycine betaine/L-proline transporter, inner membrane subunit  43.07 
 
 
298 aa  229  5e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.424903  normal  0.0286043 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0967  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein, putative  43.07 
 
 
300 aa  229  5e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24580  ABC-type proline/glycine betaine transport system, permease component  46.56 
 
 
303 aa  229  6e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0193054  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3888  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.36 
 
 
301 aa  229  6e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3486  choline ABC transporter, permease protein  43.07 
 
 
298 aa  228  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.180465 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1615  ABC proline/glycine betaine transporter, inner membrane subunit  45.69 
 
 
300 aa  227  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.23 
 
 
294 aa  226  3e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0565  putative glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  42.7 
 
 
300 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.120464  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0902  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  42.7 
 
 
300 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0449  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  42.7 
 
 
300 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1869  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  42.7 
 
 
300 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2026  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  42.7 
 
 
300 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1932  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  42.7 
 
 
300 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738925  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3449  choline ABC transporter, permease protein  42.32 
 
 
301 aa  226  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2764  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.94 
 
 
278 aa  225  5.0000000000000005e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0116658  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2309  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.91 
 
 
279 aa  224  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0079247  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.63 
 
 
278 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0667053  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4810  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.32 
 
 
298 aa  223  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5041  choline ABC transporter, permease protein  45.32 
 
 
300 aa  222  7e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.503755 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.94 
 
 
294 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.81 
 
 
292 aa  219  5e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.679353  normal  0.0162357 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1796  amino acid ABC transporter, permease protein  41.26 
 
 
575 aa  218  6e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.135141  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1907  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.25 
 
 
279 aa  218  8.999999999999998e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423644  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02042  transmembrane ABC transporter protein  42.7 
 
 
298 aa  218  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2530  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.91 
 
 
289 aa  218  1e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.74 
 
 
283 aa  217  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.158267  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5761  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.68 
 
 
295 aa  215  5e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21500  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.12 
 
 
272 aa  215  7e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2075  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.36 
 
 
283 aa  215  8e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.260591  normal  0.31699 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.66 
 
 
283 aa  215  8e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000687252  normal  0.263014 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.36 
 
 
283 aa  214  9e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0151467  normal  0.023955 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.36 
 
 
283 aa  214  9e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2027  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.36 
 
 
283 aa  214  9e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.127459  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1061  hypothetical protein  43.56 
 
 
280 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.49 
 
 
278 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5465  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.87 
 
 
281 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.112319 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2548  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  44.12 
 
 
278 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000537684  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.3 
 
 
278 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.177643  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2795  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  43.75 
 
 
278 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159834  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2815  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  44.12 
 
 
278 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0040082  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01120  ABC-type proline/glycine betaine transport system, permease component  41.83 
 
 
298 aa  212  7e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.96 
 
 
278 aa  211  1e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000001583  hitchhiker  0.0000000544844 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2596  glycine betaine/L-proline ABC transporter permease  43.75 
 
 
278 aa  210  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2515  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  43.75 
 
 
278 aa  210  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.328738  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2785  glycine betaine/L-proline ABC transporter permease protein  43.75 
 
 
278 aa  210  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.79114  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2837  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  44.12 
 
 
278 aa  210  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.148231  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2792  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  43.75 
 
 
278 aa  210  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0105765 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2497  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  43.75 
 
 
278 aa  210  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0773919  normal  0.709864 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09190  ABC-type proline/glycine betaine transport system, permease component  44.74 
 
 
294 aa  210  3e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.041544  normal  0.326272 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2272  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.66 
 
 
279 aa  209  3e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4060  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.26 
 
 
290 aa  209  4e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0808444  normal  0.400177 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1556  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.42 
 
 
288 aa  209  4e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4830  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.42 
 
 
283 aa  209  6e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.865615 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26210  ABC-type proline/glycine betaine transport system, permease component  46.77 
 
 
310 aa  209  6e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67280  ABC transporter permease  43.24 
 
 
283 aa  208  8e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5272  histidine ABC transporter, permease protein, putative  41.04 
 
 
283 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5829  ABC transporter permease  42.86 
 
 
283 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0823  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.28 
 
 
280 aa  206  3e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.54971  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0733  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.73 
 
 
282 aa  206  3e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0234  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.99 
 
 
376 aa  204  1e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.197638  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0674  glycine/betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  45.93 
 
 
279 aa  204  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000586111  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0363  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.64 
 
 
283 aa  203  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.26 
 
 
283 aa  203  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>