30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0888 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0888  fimbrial assembly family protein  100 
 
 		 350 aa  654    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000454237  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1521  Fimbrial assembly family protein  37.21 
 
 		 332 aa  117  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0573904  normal  0.217678 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1121  general secretion pathway protein l, putative  27.78 
 
 		 372 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0758  general secretion pathway protein L  32.44 
 
 		 373 aa  92.8  7e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0966219  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2176  fimbrial assembly family protein  32.47 
 
 		 346 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1285  putative general secretion pathway protein L, GspL  30.57 
 
 		 357 aa  61.6  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.442557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3002  fimbrial assembly  29.24 
 
 		 356 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  0.0109704 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2619  putative general secretion pathway protein L  37.14 
 
 		 365 aa  58.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0734  fimbrial assembly  29.85 
 
 		 352 aa  56.6  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0675563  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3310  general secretion pathway protein L, putative  23.81 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0863  general secretory pathway protein L  27.82 
 
 		 378 aa  55.1  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00948557  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3144  fimbrial assembly  23.23 
 
 		 364 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.366648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0776  fimbrial assembly family protein  27.76 
 
 		 378 aa  53.5  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0393461  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0553  Fimbrial assembly family protein  30.71 
 
 		 379 aa  52.8  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0642076 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2114  fimbrial assembly family protein  36.84 
 
 		 359 aa  51.2  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0463917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1306  fimbrial assembly family protein  27.63 
 
 		 351 aa  49.7  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.838759  decreased coverage  0.00904381 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02683  general secretion pathway protein L  30.17 
 
 		 373 aa  48.9  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3660  fimbrial assembly family protein  25.33 
 
 		 509 aa  49.3  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0675  type IV pilus assembly protein PilM  25.53 
 
 		 352 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0675  type IV pilus assembly protein PilM  25.53 
 
 		 352 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0641  type IV pilus assembly protein PilM  26.21 
 
 		 352 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2095  fimbrial assembly family protein  24.53 
 
 		 345 aa  46.6  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0807472  normal  0.408205 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06050  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  20.83 
 
 		 352 aa  45.4  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2032  type IV pilus biogenesis protein PilM  23.53 
 
 		 351 aa  45.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0917  Fimbrial assembly family protein  32 
 
 		 377 aa  44.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.51351 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0992  type IV pilus assembly protein PilM  25 
 
 		 351 aa  44.3  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1546  type IV pilus assembly protein PilM  26.04 
 
 		 350 aa  44.3  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1788  Fimbrial assembly family protein  31.06 
 
 		 355 aa  44.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0126663  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2669  type IV pilus assembly protein PilM  26.04 
 
 		 350 aa  44.7  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000583624 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1810  type IV pilus assembly protein PilM  23.81 
 
 		 350 aa  43.9  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>