241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0686 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0686  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 
345 aa  677    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4086  ribokinase-like domain-containing protein  38.58 
 
 
346 aa  194  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319245  normal  0.450618 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1034  ribokinase-like domain-containing protein  31.83 
 
 
337 aa  144  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.347997 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5595  PfkB domain protein  31.41 
 
 
333 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4101  PfkB family kinase  29.73 
 
 
335 aa  137  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0130  ribokinase-like domain-containing protein  30.13 
 
 
335 aa  136  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.964935  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4025  PfkB family kinase  30.13 
 
 
335 aa  136  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0268  PfkB domain protein  31.58 
 
 
350 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0284  ribokinase-like domain-containing protein  30.41 
 
 
334 aa  128  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0679012 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0297  PfkB domain protein  31.66 
 
 
352 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.27721  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0752  ribokinase-like domain-containing protein  27.53 
 
 
310 aa  72.4  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5895  sugar kinase, putative  28.9 
 
 
304 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal  0.0122717 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  26.81 
 
 
304 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0078  PfkB  32.77 
 
 
318 aa  68.6  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  26.86 
 
 
302 aa  66.2  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2370  putative sugar kinase  26.18 
 
 
316 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.976267  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1030  ribokinase-like domain-containing protein  26.18 
 
 
316 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.791095 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  29.47 
 
 
302 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3998  ribokinase-like domain-containing protein  32.73 
 
 
308 aa  63.9  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0662614  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  29.37 
 
 
302 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  25 
 
 
308 aa  63.9  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5137  PfkB domain protein  27.8 
 
 
319 aa  63.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0692  carbohydrate kinase  29.68 
 
 
304 aa  62.8  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.19709  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1366  ribokinase-like domain-containing protein  24.58 
 
 
320 aa  62  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2720  PfkB domain protein  27.16 
 
 
313 aa  61.2  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4060  ribokinase-like domain-containing protein  25.8 
 
 
314 aa  61.6  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288269  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  27.74 
 
 
313 aa  61.6  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4542  PfkB domain protein  27.39 
 
 
317 aa  60.5  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  26.86 
 
 
305 aa  59.7  0.00000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2306  PfkB family kinase  25.47 
 
 
319 aa  59.7  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1676  ribokinase-like domain-containing protein  29.15 
 
 
635 aa  59.7  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  28.42 
 
 
302 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2014  PfkB domain protein  25.62 
 
 
324 aa  58.9  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  27.5 
 
 
310 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  28.97 
 
 
308 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4169  ribokinase-like domain-containing protein  23.99 
 
 
320 aa  58.9  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0662  PfkB domain-containing protein  27.73 
 
 
327 aa  57.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.478793  normal  0.638402 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2764  PfkB domain protein  32.29 
 
 
289 aa  58.2  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.11778  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2407  ribokinase-like domain-containing protein  25.16 
 
 
319 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  28.97 
 
 
308 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  28.49 
 
 
645 aa  57.4  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0147  ribokinase-like domain-containing protein  24.3 
 
 
318 aa  57  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.719935  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  24.56 
 
 
338 aa  56.6  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3837  ribokinase-like domain-containing protein  27.5 
 
 
633 aa  56.6  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27619  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3334  PfkB domain protein  30.23 
 
 
647 aa  56.6  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2838  fructokinase  25.81 
 
 
324 aa  56.2  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.050359  normal  0.34699 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1268  PfkB domain protein  29.62 
 
 
333 aa  55.8  0.0000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.63046  normal  0.760626 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  28.87 
 
 
339 aa  55.8  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  28.93 
 
 
329 aa  55.5  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  26.14 
 
 
304 aa  55.5  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  28.83 
 
 
301 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4013  ribokinase-like domain-containing protein  28.93 
 
 
315 aa  55.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5186  PfkB domain protein  27.88 
 
 
337 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.430634  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  27.74 
 
 
309 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1706  PfkB domain protein  25.37 
 
 
319 aa  55.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1010  ribokinase-like domain-containing protein  27.68 
 
 
290 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3547  ribokinase-like domain-containing protein  28.15 
 
 
646 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50040  myo-inositol catabolism protein IolC  29.12 
 
 
647 aa  54.3  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2533  PfkB domain protein  26.42 
 
 
379 aa  53.9  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  26.67 
 
 
302 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  26 
 
 
305 aa  53.5  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  28.18 
 
 
337 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  28.18 
 
 
337 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3274  carbohydrate kinase, PfkB  27.55 
 
 
645 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0475711  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2291  PfkB domain protein  25.51 
 
 
329 aa  52.8  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3500  iolC protein  27.89 
 
 
645 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.782212  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7803  PfkB domain protein  29.87 
 
 
640 aa  52  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  28.01 
 
 
312 aa  52.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  26.21 
 
 
309 aa  52.4  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01440  sugar kinase, ribokinase  29.82 
 
 
315 aa  51.2  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4660  ribokinase-like domain-containing protein  28.57 
 
 
642 aa  51.6  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  26.85 
 
 
306 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3738  carbohydrate kinase  28.53 
 
 
315 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0822309  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7727  ribokinase-like domain-containing protein  36.54 
 
 
314 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1282  putative ribokinase  27.5 
 
 
345 aa  51.6  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.331017 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2452  PfkB  25.82 
 
 
330 aa  51.6  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826037  normal  0.155331 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0820  ribokinase-like domain-containing protein  26.75 
 
 
364 aa  52  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.501006  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3470  ribokinase  28.53 
 
 
315 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.973567  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3857  PfkB domain protein  28.1 
 
 
373 aa  51.2  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  28.97 
 
 
311 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2598  PfkB  27.25 
 
 
382 aa  51.2  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.098069  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2297  ribokinase  27.16 
 
 
309 aa  50.8  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0434925  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  26.28 
 
 
331 aa  50.4  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  28.71 
 
 
324 aa  50.4  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2725  ribokinase-like domain-containing protein  26.67 
 
 
363 aa  50.4  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000788266 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2413  PfkB domain protein  28.52 
 
 
642 aa  50.4  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2164  PfkB domain protein  26.35 
 
 
313 aa  50.1  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  27.59 
 
 
308 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2315  ribokinase-like domain-containing protein  27.16 
 
 
636 aa  50.1  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3109  1-phosphofructokinase  28.88 
 
 
318 aa  50.1  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  28.62 
 
 
311 aa  49.7  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  31.38 
 
 
304 aa  49.7  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  28.62 
 
 
311 aa  49.7  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1278  PfkB domain-containing protein  29.41 
 
 
317 aa  49.7  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  27.83 
 
 
309 aa  49.7  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2334  PfkB domain protein  28.39 
 
 
314 aa  49.7  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0161012  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  26.53 
 
 
310 aa  49.7  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2996  Protein of unknown function DUF2090  27.81 
 
 
634 aa  49.3  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  26.09 
 
 
315 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0722  PfkB domain protein  30.61 
 
 
363 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.140829 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>