140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1234 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1234  50S ribosomal protein L29P  100 
 
 		 91 aa  176  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.521287  hitchhiker  0.000757473 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3750  ribosomal protein L29  49.21 
 
 		 77 aa  63.9  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.775863  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0118  50S ribosomal protein L29  48.44 
 
 		 74 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000370217  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0114  50S ribosomal protein L29  48.44 
 
 		 74 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.02215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0112  50S ribosomal protein L29  48.44 
 
 		 74 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108927  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0118  50S ribosomal protein L29  48.44 
 
 		 66 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000549386  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0118  50S ribosomal protein L29  48.44 
 
 		 66 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392079  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0112  50S ribosomal protein L29  48.44 
 
 		 66 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000225905  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0149  50S ribosomal protein L29  48.44 
 
 		 66 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829957  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0139  50S ribosomal protein L29  48.44 
 
 		 66 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5187  50S ribosomal protein L29  48.44 
 
 		 66 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000115107  unclonable  8.22707e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0130  50S ribosomal protein L29  48.44 
 
 		 66 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0314  50S ribosomal protein L29P  54.84 
 
 		 77 aa  63.5  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171364 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04060  LSU ribosomal protein L29P  45.07 
 
 		 83 aa  60.8  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0113  50S ribosomal protein L29  46.88 
 
 		 66 aa  60.8  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000302541  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01250  ribosomal protein L29  50 
 
 		 71 aa  60.5  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.774041  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10723  50S ribosomal protein L29  50.82 
 
 		 77 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.698267  normal  0.159756 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0202  LSU ribosomal protein L29P  46.03 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.131015 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3427  ribosomal protein L29  43.28 
 
 		 76 aa  59.3  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.93339  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6041  50S ribosomal protein L29  38.27 
 
 		 83 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.127214 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2703  ribosomal protein L29  46.03 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859678  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3320  50S ribosomal protein L29  46.55 
 
 		 62 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000288023 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0875  50S ribosomal protein L29  48.39 
 
 		 69 aa  58.9  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00116598  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4313  ribosomal protein L29  45.83 
 
 		 84 aa  58.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.883928  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0294  50S ribosomal protein L29  41.79 
 
 		 69 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154259  normal  0.0637097 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0941  50S ribosomal protein L29  46.55 
 
 		 62 aa  58.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00256084  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3897  50S ribosomal protein L29P  47.69 
 
 		 80 aa  57.8  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1021  50S ribosomal protein L29  44.78 
 
 		 77 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.086261  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1038  50S ribosomal protein L29  44.78 
 
 		 77 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0463053  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1048  50S ribosomal protein L29  44.78 
 
 		 77 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1475  50S ribosomal protein L29  43.94 
 
 		 68 aa  57.4  0.00000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000032863  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0115  50S ribosomal protein L29  45.9 
 
 		 66 aa  57.4  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0590  50S ribosomal protein L29  45.45 
 
 		 88 aa  57  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0204  50S ribosomal protein L29  46.03 
 
 		 68 aa  57  0.00000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1823  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 69 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.340193  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3135  ribosomal protein L29  43.24 
 
 		 79 aa  56.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4499  ribosomal protein L29  42.86 
 
 		 77 aa  56.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2325  50S ribosomal protein L29  42.19 
 
 		 70 aa  56.6  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000880792  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1313  50S ribosomal protein L29  47.54 
 
 		 77 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668661  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2269  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 69 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000389369  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2310  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 69 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372663  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0119  50S ribosomal protein L29  44.26 
 
 		 68 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.217136  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3987  ribosomal protein L29  45.16 
 
 		 63 aa  56.2  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0223  50S ribosomal protein L29  42.37 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5041  50S ribosomal protein L29  45.9 
 
 		 77 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0723534  normal  0.108147 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1177  50S ribosomal protein L29  46.77 
 
 		 71 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.267445  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0782  ribosomal protein L29  44.26 
 
 		 66 aa  55.8  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23730  LSU ribosomal protein L29P  46.77 
 
 		 77 aa  55.5  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0241795  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2651  ribosomal protein L29  42.67 
 
 		 78 aa  55.5  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0233  50S ribosomal protein L29  44.07 
 
 		 67 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4018  50S ribosomal protein L29  45.16 
 
 		 66 aa  55.1  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.186553  hitchhiker  0.00000457744 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2679  ribosomal protein L29  44.74 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1516  ribosomal protein L29  44.26 
 
 		 69 aa  54.3  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.380444  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1131  ribosomal protein L29  44.26 
 
 		 80 aa  54.7  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1300  50S ribosomal protein L29  45.31 
 
 		 66 aa  54.3  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000050767  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1386  50S ribosomal protein L29  45.31 
 
 		 66 aa  54.3  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000247048  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1094  50S ribosomal protein L29  46.27 
 
 		 78 aa  54.3  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0502685 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6606  ribosomal protein L29  50 
 
 		 82 aa  53.9  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5132  ribosomal protein L29  44.44 
 
 		 83 aa  53.9  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.76527 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0299  50S ribosomal protein L29  45.9 
 
 		 69 aa  53.5  0.0000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  6.39149e-29 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29660  LSU ribosomal protein L29P  41.33 
 
 		 79 aa  53.5  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.942606  normal  0.510247 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1737  50S ribosomal protein L29  45 
 
 		 72 aa  52.8  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000140424  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2638  50S ribosomal protein L29P  43.59 
 
 		 85 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.137123  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4500  50S ribosomal protein L29  49.09 
 
 		 62 aa  52.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00015602  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0635  ribosomal protein L29  41.43 
 
 		 78 aa  52.4  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0570  50S ribosomal protein L29  54.35 
 
 		 78 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2452  50S ribosomal protein L29  43.33 
 
 		 67 aa  51.2  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.206737 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0939  50S ribosomal protein L29  43.08 
 
 		 74 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17080  LSU ribosomal protein L29P  43.64 
 
 		 89 aa  51.6  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00253403  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1193  50S ribosomal protein L29  39.68 
 
 		 79 aa  50.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0737458 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2967  50S ribosomal protein L29P  55.77 
 
 		 109 aa  50.8  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.115661  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2849  50S ribosomal protein L29  43.1 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.851445  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0961  50S ribosomal protein L29  42.19 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00226195  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0696  ribosomal protein L29  39.19 
 
 		 83 aa  49.7  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.66436 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1354  50S ribosomal protein L29  43.86 
 
 		 62 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.121784  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1715  50S ribosomal protein L29  37.97 
 
 		 83 aa  49.3  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0766  50S ribosomal protein L29  45 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346597  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0430  50S ribosomal protein L29  43.55 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000570253  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20790  LSU ribosomal protein L29P  42.19 
 
 		 78 aa  48.9  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.888777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1176  ribosomal protein L29  42.37 
 
 		 71 aa  48.1  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00096654  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2706  50S ribosomal protein L29  42.37 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2391  50S ribosomal protein L29  42.37 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0262  ribosomal protein L29  39.06 
 
 		 83 aa  48.1  0.00004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0595  ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 79 aa  48.1  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.275335  normal  0.978354 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0688  50S ribosomal protein L29  41.82 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.273143  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2394  50S ribosomal protein L29  45.61 
 
 		 69 aa  46.6  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000853986  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0709  ribosomal protein L29  44.83 
 
 		 62 aa  45.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000196069  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0066  50S ribosomal protein L29  39.68 
 
 		 68 aa  45.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.09375  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl131  50S ribosomal protein L29  40.32 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1372  50S ribosomal protein L29  38.18 
 
 		 68 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.232248  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0634  50S ribosomal protein L29  36.21 
 
 		 62 aa  45.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169135  hitchhiker  0.00000000334263 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1566  ribosomal protein L29  33.33 
 
 		 68 aa  45.1  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00135889  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2911  50S ribosomal protein L29  47.62 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2744  ribosomal protein L29  37.93 
 
 		 68 aa  45.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0416079  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1622  50S ribosomal protein L29  43.64 
 
 		 64 aa  45.1  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173705  normal  0.463697 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1899  50S ribosomal protein L29  44.44 
 
 		 68 aa  44.7  0.0005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.012705  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3915  50S ribosomal protein L29  43.48 
 
 		 78 aa  44.7  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4307  50S ribosomal protein L29  43.48 
 
 		 78 aa  44.7  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.243874  normal  0.0100959 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2974  50S ribosomal protein L29  41.82 
 
 		 79 aa  44.3  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.997663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1553  50S ribosomal protein L29  36.36 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>