15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0084 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0084  response regulator receiver protein  100 
 
 		 241 aa  497  1e-140  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3093  type IV pilus assembly PilZ  37.62 
 
 		 220 aa  118  9e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3019  type IV pilus assembly PilZ  31.8 
 
 		 248 aa  106  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0728144 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2859  response regulator receiver protein  29.17 
 
 		 232 aa  93.6  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4279  response regulator receiver protein  24.14 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.254527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0642  putative PAS/PAC sensor protein  31.37 
 
 		 401 aa  47.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201186  normal  0.0191068 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0795  putative PAS/PAC sensor protein  34.62 
 
 		 458 aa  47.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0670898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1949  putative PAS/PAC sensor protein  31.37 
 
 		 461 aa  47.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.724461 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1372  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.59 
 
 		 1362 aa  44.3  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1910  type IV pilus assembly PilZ  32.05 
 
 		 143 aa  43.5  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.060873 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1245  putative PAS/PAC sensor protein  35.29 
 
 		 400 aa  43.1  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 		 789 aa  42.7  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.377648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0264  response regulator receiver domain-containing protein  27.64 
 
 		 178 aa  42.7  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3160  response regulator receiver domain-containing protein  28.57 
 
 		 131 aa  41.6  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4246  histidine kinase  25.17 
 
 		 1280 aa  41.6  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.921248  normal  0.11404 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>