108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_R0086 on replicon NC_011879
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011879  Achl_R0086  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0010  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.552541  hitchhiker  0.000550393 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0023  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0049  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0012  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.592098  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0011  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03370  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0047  tRNA-His  90.57 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0048  tRNA-Leu  89.29 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.223448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0010  tRNA-Arg  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0004  tRNA-Arg  87.72 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0638149 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0004  tRNA-Arg  88.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.468205  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0041  tRNA-Arg  88.46 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.225323  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0007  tRNA-Arg  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.35256e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0048  tRNA-Arg  86.44 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.195029  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0004  tRNA-Arg  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000356411  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0048  tRNA-Arg  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.759858 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0038  tRNA-Trp  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.23193 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0046  tRNA-Trp  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.590376 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0050  tRNA-Arg  86.44 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0050  tRNA-Arg  86.44 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0048  tRNA-Arg  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.544929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0025  tRNA-Met  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.810324  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0060  tRNA-Arg  88 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000322774  normal  0.330331 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0017  tRNA-Arg  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAArgVIMSS1309273  tRNA-Arg  85.96 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0019  tRNA-Arg  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000464578  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0019  tRNA-Arg  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230793  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1350  tRNA-Arg  100 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0283084 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1364  tRNA-Arg  100 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.618401  normal  0.347437 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1334  tRNA-Arg  100 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.29476 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1935  tRNA-Arg  100 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285528  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2119  tRNA-Arg  100 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144958 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0053  tRNA-Arg  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0023  tRNA-His  86.54 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.794961  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0038  tRNA-Arg  86.54 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.111435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0040  tRNA-Trp  96.43 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0487601  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0054  tRNA-Arg  86.54 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.403688  hitchhiker  0.000271304 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0024  tRNA-Arg  86.54 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00738285 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0055  tRNA-Arg  86.54 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0773774  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0005  tRNA-Arg  86.54 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0003  tRNA-Arg  86.54 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0003  tRNA-Arg  86.54 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000538631 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0017  tRNA-Arg  86.54 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0314744  normal  0.604641 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0009  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Trp-1  tRNA-Trp  86.27 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0487653  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0015  tRNA-Trp  93.55 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256719  normal  0.0109238 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0008  tRNA-Trp  86.27 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000769382 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0031  tRNA-Trp  86.44 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.214568  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1767  tRNA-Met  85.45 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0084  tRNA-Arg  84.75 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000200461  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0016  tRNA-Trp  84.75 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0018  tRNA-Trp  86.44 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848824 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0004  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.710859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0065  tRNA-Trp  84.75 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0927155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0003  tRNA-Trp  84.75 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.7715 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0051  tRNA-Trp  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128882  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0051  tRNA-Trp  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00000000551326  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0068  tRNA-Trp  84.75 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.865421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0019  tRNA-Trp  86.27 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0117064  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0019  tRNA-Trp  84.75 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.77581 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0039  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0069  tRNA-Trp  84.75 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0018  tRNA-Trp  84.75 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0871425  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0013  tRNA-Trp  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.863904 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0025  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000303691 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0045  tRNA-Arg  86.44 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0029  tRNA-Pro  100 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0008  tRNA-Trp  86.44 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0064  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00190165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0028  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00528012  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0003  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.972856  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0015  tRNA-His  86 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.956741  normal  0.235739 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0051  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0064  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0021  tRNA-His  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000077385  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0013  tRNA-Trp  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0020  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.732276  normal  0.397145 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0035  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0064  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA30  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.179401 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0051  tRNA-Arg  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230121 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0019  tRNA-Arg  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0771272  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6003  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.126047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0005  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000127143  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0047  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.67913  normal  0.0842935 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0044  tRNA-His  88.1 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0016  tRNA-Trp  86.96 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.825811  normal  0.984478 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna7  tRNA-Trp  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.387032  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0044  tRNA-His  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000342103  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0041  tRNA-His  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0113138  normal  0.890079 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0028  tRNA-His  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.252923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0018  tRNA-Trp  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000348317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0016  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.625219  normal  0.104037 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0048  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0017  tRNA-Trp  86.96 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119473 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0844  tRNA-Arg  100 
 
 		 79 bp  44.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.998646  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0042  tRNA-Trp  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0024  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0029  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.323491  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>