72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3789 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_4004  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  70.59 
 
 
657 aa  780    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.852778  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1219  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  61.55 
 
 
660 aa  685    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3789  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  100 
 
 
676 aa  1349    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5589  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  62.62 
 
 
658 aa  682    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3164  phosphoenolpyruvate-dependent sugar phosphotransferase system, EIIA 2  58.27 
 
 
668 aa  630  1e-179  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4768  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  63.02 
 
 
508 aa  596  1e-169  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0054  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  63.25 
 
 
512 aa  595  1e-168  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4447  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  53.77 
 
 
635 aa  569  1e-161  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4165  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  53.77 
 
 
635 aa  567  1e-160  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2813  PTS system, mannitol-specific EIICBA component  52.74 
 
 
650 aa  559  1e-158  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0196  PTS system, mannitol-specific IIABC component  52.05 
 
 
649 aa  553  1e-156  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001632  phosphotransferase system mannitol-specific  50.17 
 
 
650 aa  550  1e-155  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00834  PTS system, mannitol-specific II ABC component  50.17 
 
 
650 aa  549  1e-155  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0136  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  52.05 
 
 
636 aa  546  1e-154  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03405  hypothetical protein  52.65 
 
 
637 aa  543  1e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0052  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  52.77 
 
 
635 aa  543  1e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.408793  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4969  PTS system, mannitol-specific IIABC component  52.32 
 
 
637 aa  543  1e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.873696  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07060  phosphotransferase system, mannitol-specific IIBC component  53.67 
 
 
687 aa  545  1e-153  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4016  PTS system, mannitol-specific IIABC component  52.32 
 
 
637 aa  544  1e-153  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.659103  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03454  fused mannitol-specific PTS enzymes: IIA components/IIB components/IIC components  52.65 
 
 
637 aa  543  1e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3932  PTS system, mannitol-specific IIABC component  52.49 
 
 
637 aa  545  1e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.754882 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0113  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  52.32 
 
 
637 aa  544  1e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4098  PTS system, mannitol-specific IIABC component  52.32 
 
 
637 aa  544  1e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0107  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  52.65 
 
 
637 aa  543  1e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3806  PTS system, mannitol-specific IIABC component  52.65 
 
 
637 aa  543  1e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0072  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  52.68 
 
 
639 aa  539  9.999999999999999e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.337525  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4070  PTS system mannitol-specific transporter subunit EIICBA  51.79 
 
 
638 aa  532  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.293886  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3901  pts system mannitol-specific eiicba component  51.79 
 
 
638 aa  532  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3885  pts system mannitol-specific eiicba component  51.79 
 
 
638 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.816196  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4008  PTS system mannitol-specific eiicba component  51.79 
 
 
638 aa  532  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.32191 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3963  PTS system mannitol-specific transporter subunit EIICBA  51.79 
 
 
638 aa  532  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.303673  normal  0.484856 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3780  PTS system mannitol-specific transporter subunit IIABC  52.41 
 
 
643 aa  532  1e-150  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4128  PTS system, mannitol-specific EIICBA component  52.41 
 
 
643 aa  532  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0026  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  52.41 
 
 
643 aa  532  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1252  mannitol-specific IIABC component, PTS system  50 
 
 
625 aa  520  1e-146  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000146575  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0088  PTS system, mannitol-specific IIABC protein  49.4 
 
 
628 aa  507  9.999999999999999e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.15272  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2226  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  52.35 
 
 
512 aa  507  9.999999999999999e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2188  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  52.35 
 
 
512 aa  507  9.999999999999999e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0985  PTS system, mannitol-specific IIABC protein  55.97 
 
 
469 aa  505  1e-141  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.150194 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0268  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  55.31 
 
 
481 aa  495  9.999999999999999e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0220  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  51.12 
 
 
486 aa  470  1.0000000000000001e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3834  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  48.36 
 
 
478 aa  461  9.999999999999999e-129  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.826504  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1845  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  48.33 
 
 
467 aa  442  9.999999999999999e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0027  phosphotransferase system, mannitol-specific IIBC component  47.98 
 
 
607 aa  437  1e-121  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.03795  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4234  PTS system, mannitol-specific cryptic EIICB component  48.12 
 
 
462 aa  421  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02726  hypothetical protein  48.12 
 
 
462 aa  421  1e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0761  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  48.12 
 
 
462 aa  421  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02763  predicted fused mannitol-specific PTS enzymes: IIB component/IIC component  48.12 
 
 
462 aa  421  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3365  PTS system, mannitol-specific cryptic EIICB component  48.12 
 
 
462 aa  421  1e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3267  PTS system, mannitol-specific cryptic EIICB component  48.12 
 
 
462 aa  421  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0778  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  48.12 
 
 
462 aa  421  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0229075 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3253  pts system mannitol-specific eiicba component  48.53 
 
 
459 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3320  PTS system mannitol-specific transporter subunit EIICBA  48.53 
 
 
459 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0659  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  44.54 
 
 
436 aa  398  1e-109  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4224  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  55.53 
 
 
368 aa  391  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110658  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001413  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIBC subunit  50.36 
 
 
420 aa  383  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.259327  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1525  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  57.22 
 
 
356 aa  382  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.003101  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2143  PTS systemmannitol-specific transporter subunit IIC  46.99 
 
 
490 aa  381  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.678571  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7073  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  54.21 
 
 
391 aa  382  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5271  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  59.27 
 
 
397 aa  379  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161219  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3090  PTS system, mannitol-specific cryptic EIICB component, truncation  47.58 
 
 
407 aa  363  8e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4849  protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  52 
 
 
406 aa  343  5.999999999999999e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0104917 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0458  PTS system, mannitol-specific IIBC component  33.85 
 
 
525 aa  281  3e-74  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.646775  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0028  PTS system, mannitol-specific IIBC component, putative  32.44 
 
 
517 aa  271  2.9999999999999997e-71  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1526  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  29 
 
 
106 aa  59.3  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.022737  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5270  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  33.63 
 
 
102 aa  55.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4848  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  34.02 
 
 
102 aa  52.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00818505 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7072  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  34.07 
 
 
102 aa  48.1  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4223  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  30.85 
 
 
102 aa  47  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.112058  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4769  phosphoenolpyruvate-dependent sugar phosphotransferase system EIIA 2  45.28 
 
 
145 aa  45.8  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0055  phosphoenolpyruvate-dependent sugar phosphotransferase system EIIA 2  46.15 
 
 
145 aa  45.4  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2795  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  45.45 
 
 
147 aa  45.1  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>