More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3769 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3769  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 
215 aa  406  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3990  lysine exporter protein LysE/YggA  75.12 
 
 
216 aa  301  4.0000000000000003e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7985  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.89 
 
 
209 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3736  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.63 
 
 
206 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0182  amino acid transporter LysE  43.28 
 
 
205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3513  lysine exporter protein LysE/YggA  40.78 
 
 
205 aa  124  7e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0702628  normal  0.457979 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46450  Transporter, LysE family  38.35 
 
 
205 aa  122  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0428  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.03 
 
 
204 aa  118  7e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3659  lysine exporter protein LysE/YggA  37.62 
 
 
233 aa  116  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0070  lysine exporter protein LysE/YggA  39.52 
 
 
207 aa  111  8.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2077  lysine exporter protein LysE/YggA  41 
 
 
204 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3653  amino acid transporter LysE  40.1 
 
 
204 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.709674  normal  0.0898299 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2254  lysine exporter protein LysE/YggA  38.65 
 
 
204 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.675856 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2250  lysine exporter protein LysE/YggA  40 
 
 
204 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.233575  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  35.15 
 
 
203 aa  86.3  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  31.78 
 
 
217 aa  81.6  0.000000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0088  lysine exporter protein LysE/YggA  32.14 
 
 
219 aa  80.9  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.55 
 
 
209 aa  79.7  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0074  LysE family amino acid efflux protein  33.53 
 
 
274 aa  79  0.00000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  31.31 
 
 
217 aa  78.2  0.00000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.16 
 
 
208 aa  77.8  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2925  amino acid transporter LysE  33.12 
 
 
209 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0920317  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1031  hypothetical protein  32.37 
 
 
212 aa  76.6  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.332162  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02476  hypothetical protein  29.95 
 
 
211 aa  75.9  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4247  putative homoserine/threonine efflux protein  26.19 
 
 
208 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000239469 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1611  lysine exporter protein LysE/YggA  27.98 
 
 
207 aa  75.9  0.0000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0311017  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0836  lysine exporter protein LysE/YggA  32.2 
 
 
207 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.82 
 
 
209 aa  74.3  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4362  lysine exporter protein LysE/YggA  40.85 
 
 
211 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.815141  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1730  amino acid transporter LysE  26.19 
 
 
208 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000126843  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4942  lysine exporter protein LysE/YggA  36.41 
 
 
208 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.20679 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3040  lysine exporter protein LysE/YggA  36.41 
 
 
208 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.408857  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5326  lysine exporter protein LysE/YggA  36.41 
 
 
208 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.692371  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0589  lysine exporter protein LysE/YggA  33.16 
 
 
212 aa  73.2  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.332846  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6784  LysE family amino acid efflux protein  34.65 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0400664 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4520  lysine exporter protein LysE/YggA  40.37 
 
 
211 aa  72.8  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286419  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0867  lysine exporter protein LysE/YggA  32.26 
 
 
207 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.627781  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0494  LysE family protein  34.34 
 
 
204 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1363  LysE family translocator protein  29.53 
 
 
213 aa  72.4  0.000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.640513  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003627  putative threonine efflux protein  29.13 
 
 
231 aa  72.4  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0589  LysE family translocator protein  32.32 
 
 
204 aa  72  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.327685  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0774  LysE type translocator  32.32 
 
 
204 aa  72  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1333  lysine exporter protein LysE/YggA  30.37 
 
 
212 aa  71.6  0.000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2456  lysine exporter protein LysE/YggA  34.83 
 
 
205 aa  71.6  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010294  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3980  lysine exporter protein LysE/YggA  36.02 
 
 
205 aa  71.2  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3105  lysine exporter protein LysE/YggA  32.72 
 
 
207 aa  71.2  0.000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0322  lysine exporter protein LysE/YggA  35.61 
 
 
209 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279488  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2862  lysine exporter protein LysE/YggA  30.57 
 
 
213 aa  70.9  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0605  LysE family translocator protein  32.32 
 
 
204 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0051  amino acid transporter LysE  27.54 
 
 
210 aa  70.1  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4318  lysine exporter protein LysE/YggA  35.03 
 
 
203 aa  70.5  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0592644  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2358  putative lysine exporter protein  34.78 
 
 
215 aa  70.5  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5636  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.25 
 
 
211 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0625165 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3099  LysE family protein  32.32 
 
 
194 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6543  lysine exporter protein LysE/YggA  37.72 
 
 
207 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.259984 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1345  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.96 
 
 
208 aa  70.5  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.123136  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2950  LysE family protein  32.32 
 
 
194 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0914  amino acid efflux protein, putative  35.93 
 
 
209 aa  70.5  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.996112 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1238  lysine exporter protein LysE/YggA  35.93 
 
 
212 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0801686  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4405  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.51 
 
 
215 aa  70.1  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4137  lysine exporter protein LysE/YggA  36.02 
 
 
205 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0038  lysine exporter protein LysE/YggA  32.67 
 
 
211 aa  70.9  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0068  LysE family protein  32.32 
 
 
194 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1522  LysE family protein  32.32 
 
 
194 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4807  lysine exporter protein LysE/YggA  34.2 
 
 
210 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0152252  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2465  lysine exporter protein LysE/YggA  37.02 
 
 
214 aa  70.1  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.19798  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3360  lysine exporter protein LysE/YggA  34.2 
 
 
210 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4164  RhtB family transporter  29.81 
 
 
213 aa  70.1  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4719  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.32 
 
 
212 aa  69.7  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1925  putative homoserine/threonine efflux protein  25.24 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82308e-38 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1701  amino acid transporter LysE  25.24 
 
 
208 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0912104  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3077  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.42 
 
 
206 aa  69.3  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1714  lysine exporter protein LysE/YggA  31.9 
 
 
238 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1476  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.76 
 
 
205 aa  69.3  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.779186  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3172  lysine exporter protein LysE/YggA  34.43 
 
 
211 aa  69.3  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2169  lysine exporter protein LysE/YggA  32.61 
 
 
227 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0971  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28 
 
 
211 aa  69.3  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2783  lysine exporter protein LysE/YggA  32.61 
 
 
204 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407704  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.65 
 
 
211 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2107  lysine exporter protein LysE/YggA  33.73 
 
 
210 aa  68.9  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.314049 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6113  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
204 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4824  lysine exporter protein LysE/YggA  31.75 
 
 
210 aa  68.9  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.322328  normal  0.389501 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  31.16 
 
 
211 aa  68.9  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3282  lysine exporter protein LysE/YggA  34.48 
 
 
210 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.541526 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  28.64 
 
 
205 aa  68.9  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  34.48 
 
 
208 aa  68.9  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5140  lysine exporter protein LysE/YggA  33.82 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2895  lysine exporter protein LysE/YggA  33.5 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1754  lysine exporter protein LysE/YggA  30.52 
 
 
211 aa  68.6  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.335434  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.74 
 
 
204 aa  68.6  0.00000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4155  lysine exporter protein LysE/YggA  33.99 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646483  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0532  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
204 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.101376  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2794  lysine exporter protein LysE/YggA  32.61 
 
 
204 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.31715 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1744  lysine exporter protein LysE/YggA  28.28 
 
 
208 aa  68.2  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0257251  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
204 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  28.5 
 
 
217 aa  68.2  0.00000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3206  lysine exporter protein LysE/YggA  31.71 
 
 
208 aa  67.4  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.84476  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1078  lysine exporter protein LysE/YggA  28.57 
 
 
204 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1798  amino acid transport protein, LysE type  29.33 
 
 
213 aa  67.8  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2843  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
204 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>