18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3430 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3430  hypothetical protein  100 
 
 
122 aa  252  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2282  hypothetical protein  75 
 
 
132 aa  201  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00820926  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2333  hypothetical protein  52.68 
 
 
125 aa  136  8.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0607058  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2852  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.23 
 
 
126 aa  113  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3702  Cupin 2 conserved barrel domain protein  52.43 
 
 
120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3019  hypothetical protein  45.13 
 
 
124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.122791 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0500  hypothetical protein  45.19 
 
 
126 aa  95.9  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3001  hypothetical protein  42.11 
 
 
122 aa  94  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00623326  decreased coverage  0.0000358597 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6212  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.13 
 
 
121 aa  93.2  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0947476  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1290  hypothetical protein  41.35 
 
 
119 aa  92  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00531364  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1363  cupin 2 domain-containing protein  38.79 
 
 
118 aa  85.9  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1637  cupin 2 domain-containing protein  36.21 
 
 
137 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.316087  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0528  hypothetical protein  36.61 
 
 
124 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0331265  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1574  hypothetical protein  38.46 
 
 
120 aa  79.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2641  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.05 
 
 
123 aa  78.6  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.17261 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2431  hypothetical protein  39.58 
 
 
239 aa  76.3  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0800028  normal  0.133087 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2480  hypothetical protein  41.18 
 
 
125 aa  73.6  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.289333 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_18632  predicted protein  30.34 
 
 
267 aa  52.8  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  unclonable  0.000481195 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>