82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2190 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2190  TspO and MBR like protein  100 
 
 
180 aa  342  1e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000136433 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0769  TspO and MBR like proteins  45.25 
 
 
183 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.843937  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0884  TspO and MBR like protein  45.14 
 
 
181 aa  132  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3615  TspO and MBR like proteins  53.85 
 
 
133 aa  123  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4445  TspO and MBR like protein  38 
 
 
162 aa  89.7  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534957  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1018  TspO and MBR like protein  39.84 
 
 
169 aa  71.6  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.244988  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0012  TspO and MBR like protein  38.52 
 
 
173 aa  70.5  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1687  TspO and MBR like protein  35.43 
 
 
158 aa  68.9  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0406  TspO-and MBR-like protein  40.62 
 
 
167 aa  68.2  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.512456 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2411  TspO and MBR like proteins  37.98 
 
 
150 aa  67.8  0.00000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.16205  hitchhiker  0.00252248 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1341  tryptophan-rich sensory protein  27.52 
 
 
159 aa  67  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.256422  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0177  TspO and MBR like protein  36.43 
 
 
166 aa  65.5  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.215544 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1911  peripheral-type benzodiazepine receptor  35.43 
 
 
157 aa  65.1  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.436126  normal  0.681293 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0268  TspO and MBR like proteins  40.71 
 
 
163 aa  64.7  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.357825 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1415  TspO and MBR like protein  35.07 
 
 
170 aa  64.7  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.491497  normal  0.102946 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1962  TspO and MBR like protein  34.42 
 
 
161 aa  62  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0355654 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0950  TspO and MBR like protein  28.03 
 
 
155 aa  62  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00346634  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4155  TspO and MBR like protein  37.07 
 
 
169 aa  62  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0168  TspO and MBR like proteins  33.55 
 
 
165 aa  61.6  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106601  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1390  TspO and MBR like protein  33.08 
 
 
158 aa  61.2  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.251676  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2041  TspO or MBR like protein  39.37 
 
 
162 aa  60.5  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3966  TspO and MBR like protein  37.07 
 
 
181 aa  60.5  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295778  normal  0.266571 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2272  TspO and MBR related proteins  36.8 
 
 
188 aa  60.5  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.344115  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0587  TspO and MBR like proteins  36.89 
 
 
164 aa  60.5  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0264  TspO and MBR like protein  31.75 
 
 
170 aa  60.5  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.547457  normal  0.537343 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0333  TspO and MBR like protein  37.19 
 
 
170 aa  60.5  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0562  TspO and MBR like protein  35 
 
 
159 aa  60.1  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1272  TspO/MBR family protein  32.03 
 
 
157 aa  60.1  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.207373  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0628  TspO and MBR like protein  32.58 
 
 
172 aa  59.3  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3722  TspO and MBR like protein  35.43 
 
 
166 aa  58.9  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0501  TspO and MBR like protein  34.88 
 
 
159 aa  58.9  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0352  TspO and MBR like proteins  30.23 
 
 
157 aa  58.2  0.00000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.454759  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1521  hypothetical protein  32.45 
 
 
163 aa  58.2  0.00000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0975957  normal  0.473043 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3586  TspO/MBR family protein  35.54 
 
 
172 aa  57.8  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.544999  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6800  TspO and MBR like protein  35.77 
 
 
152 aa  57  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000256464  decreased coverage  0.0000000665741 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04610  integral membrane protein  33.33 
 
 
158 aa  57  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2668  TspO and MBR like proteins  34.78 
 
 
184 aa  57.4  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.336522  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1688  TspO and MBR like protein  39.66 
 
 
159 aa  56.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0662  TspO and MBR like protein  32.03 
 
 
158 aa  56.2  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1082  TspO and MBR like protein  26.85 
 
 
171 aa  56.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1202  TspO and MBR like protein  35.29 
 
 
165 aa  55.8  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0544  TspO and MBR like proteins  35.94 
 
 
159 aa  55.8  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1348  TspO and MBR like protein  33.09 
 
 
158 aa  55.5  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.984068  normal  0.0919239 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1952  TspO/MBR family protein  29.46 
 
 
165 aa  55.5  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.354121  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2694  tryptophan-rich sensory protein  31.58 
 
 
137 aa  55.5  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.360878 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0158  CrtK protein  32.28 
 
 
158 aa  55.1  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0976779  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1638  CrtK protein  34.38 
 
 
160 aa  55.5  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4469  TspO and MBR like protein  38.21 
 
 
185 aa  55.1  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.855391  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1197  TspO and MBR like protein  34.13 
 
 
168 aa  54.3  0.0000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.143406  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2240  TspO/MBR family protein  29.46 
 
 
165 aa  53.9  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0361912  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1905  TspO and MBR like protein  27.1 
 
 
162 aa  53.5  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5100  TspO and MBR like protein  32.45 
 
 
172 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.924689  normal  0.219885 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1855  TspO and MBR like protein  34.13 
 
 
165 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.250306 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2163  TspO and MBR like protein  32 
 
 
168 aa  51.6  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.53524  normal  0.553393 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0547  TspO and MBR like protein  32.54 
 
 
158 aa  51.6  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3510  tryptophan rich sensory protein  33.6 
 
 
160 aa  50.4  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2859  TspO/MBR family protein  31.34 
 
 
171 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.268273  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3085  TspO and MBR like protein  31.34 
 
 
171 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.424495  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1526  TspO and MBR like protein  36.52 
 
 
165 aa  48.5  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0420  TspO and MBR-like protein  38.52 
 
 
180 aa  48.1  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0278663  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1951  TspO and MBR like protein  33.1 
 
 
178 aa  47.8  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.515006 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2778  tryptophan-rich sensory protein  30.08 
 
 
163 aa  47.4  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4187  TspO/MBR family protein  35.25 
 
 
180 aa  47.4  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2977  TspO and MBR like protein  29.85 
 
 
171 aa  47  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0210  TspO and MBR like protein  33.6 
 
 
155 aa  45.8  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.77975  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1026  TspO and MBR like protein  28.78 
 
 
159 aa  46.2  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0041  TspO and MBR like proteins  29.27 
 
 
183 aa  45.8  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.195212  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1937  TspO and MBR like proteins  30.23 
 
 
164 aa  45.8  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0269  tryptophan rich sensory protein  28.78 
 
 
158 aa  45.1  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0619  TspO and MBR like protein  28.41 
 
 
199 aa  45.1  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3520  TspO and MBR like protein  27.52 
 
 
177 aa  45.1  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.756349  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1912  TspO and MBR like proteins  28.78 
 
 
159 aa  44.7  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.360227 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5702  TspO and MBR like protein  26.45 
 
 
153 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.232514 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4212  hypothetical protein  26.67 
 
 
156 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.345862 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0330  tryptophan-rich sensory protein  29.2 
 
 
154 aa  42.4  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.58959  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_49987  predicted protein  30.95 
 
 
284 aa  42.7  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.418354  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2064  TspO and MBR like protein  26.82 
 
 
173 aa  42.7  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.200523 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4823  TspO/MBR family protein  28.89 
 
 
169 aa  42.7  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.212375  normal  0.0256226 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0035  TspO and MBR like proteins  32.79 
 
 
156 aa  42.4  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2811  TspO and MBR like proteins  24.52 
 
 
152 aa  41.2  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5290  TspO and MBR like protein  28.15 
 
 
165 aa  40.8  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.772753  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1652  TspO and MBR like protein  28.57 
 
 
135 aa  40.8  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>