33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_R0013 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_R0013  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0052  tRNA-Met  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.959791  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0010  tRNA-Met  94.92 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159974  normal  0.242309 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0047  tRNA-Met  91.53 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.921613  normal  0.522755 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0016  tRNA-Met  91.38 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0010  tRNA-Met  89.19 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.373592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0010  tRNA-Met  87.84 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0051  tRNA-Met  95.92 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0014  tRNA-Met  91.53 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0720319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0072  tRNA-Met  95.24 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.916606  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_R0067  tRNA-Met  93.88 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.268357  normal  0.588554 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0068  tRNA-Met  90.57 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0053  tRNA-Met  89.83 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.796609 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0051  tRNA-Met  89.83 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0018  tRNA-Met  89.83 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0014  tRNA-Met  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000000605229  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03520  tRNA-Met  93.33 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.673814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0042  tRNA-Met  86.15 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.231974 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0056  tRNA-Met  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.764712  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0032  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0033  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0016  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319335  normal  0.075677 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0035  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.211477  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0039  tRNA-Cys  100 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00256025  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0042  tRNA-Cys  100 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000509201  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0039  tRNA-Cys  100 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259846  hitchhiker  0.000510746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0042  tRNA-Cys  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0178543  normal  0.586426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0045  tRNA-Cys  100 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0629972  normal  0.01712 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0035  tRNA-Cys  100 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.81784  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0024  tRNA-Cys  100 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500819  normal  0.307833 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0028  tRNA-Cys  100 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0259946  normal  0.0657688 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0031  tRNA-Cys  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.541634 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0031  tRNA-Cys  100 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>