12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0087 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0087  hypothetical protein  100 
 
 
78 aa  149  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0141  hypothetical protein  60 
 
 
110 aa  78.2  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0661216  hitchhiker  0.0044409 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3992  hypothetical protein  50 
 
 
80 aa  65.5  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.024968  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6410  hypothetical protein  37.8 
 
 
97 aa  56.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0087  hypothetical protein  43.94 
 
 
89 aa  54.7  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0299124 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0090  hypothetical protein  42.42 
 
 
89 aa  53.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0302  hypothetical protein  42.5 
 
 
85 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8968  hypothetical protein  36.71 
 
 
74 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0178  hypothetical protein  37.66 
 
 
74 aa  47.8  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00461639 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0528  hypothetical protein  41.25 
 
 
85 aa  44.3  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0924  hypothetical protein  40.74 
 
 
157 aa  42.7  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.111035  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3561  hypothetical protein  42.86 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.278294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>