19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0077 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0077  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  251  3e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.825117  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3046  JAMM-like protein. metallo peptidase. MEROPS family M67B  45.45 
 
 		 131 aa  110  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.208196  normal  0.597749 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0623  JAMM-like protein. metallo peptidase. MEROPS family M67B  45.3 
 
 		 135 aa  104  4e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.64489  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0792  Mov34 family protein  43.09 
 
 		 124 aa  98.2  3e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2297  hypothetical protein  36.67 
 
 		 123 aa  96.3  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2405  hypothetical protein  35.61 
 
 		 173 aa  94.7  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.600019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0311  hypothetical protein  38.84 
 
 		 123 aa  94  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.734999  normal  0.454808 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0620  hypothetical protein  36.36 
 
 		 164 aa  93.6  7e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2403  hypothetical protein  37.19 
 
 		 149 aa  93.6  9e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0210  hypothetical protein  40.83 
 
 		 123 aa  92.4  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2117  metal-dependent protease of the PAD1/JAB1 superfamily-like protein  35.61 
 
 		 164 aa  90.1  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1908  proteasome Rpn11 subunit JAMM motif protein  34.62 
 
 		 163 aa  89.4  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.117708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0716  proteasome Rpn11 subunit JAMM motif protein  39.82 
 
 		 169 aa  82  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0407  hypothetical protein  38.46 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.167584  hitchhiker  0.00520945 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0715  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  32.5 
 
 		 133 aa  50.1  0.000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02940  DNA repair protein RadC  32.5 
 
 		 224 aa  41.2  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1909  DNA repair protein RadC  36.07 
 
 		 249 aa  40.4  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1246  DNA repair protein RadC  36.07 
 
 		 246 aa  40.4  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.114408  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1283  DNA repair protein RadC  36.07 
 
 		 249 aa  40.4  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0949779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>