More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4581 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2656  pyruvate kinase  70.17 
 
 
478 aa  647    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.610216  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0572  pyruvate kinase  71.85 
 
 
479 aa  652    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0460  pyruvate kinase  70.17 
 
 
478 aa  664    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31073  normal  0.427557 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3305  pyruvate kinase  91.4 
 
 
478 aa  877    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2427  pyruvate kinase  69.96 
 
 
478 aa  667    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.637493  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0835  pyruvate kinase  69.96 
 
 
478 aa  667    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0298  pyruvate kinase  69.96 
 
 
478 aa  667    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0676132  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0558  pyruvate kinase  72.69 
 
 
478 aa  667    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0671  pyruvate kinase  69.96 
 
 
478 aa  646    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0290  pyruvate kinase  77.52 
 
 
478 aa  749    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0208405 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3276  pyruvate kinase  70.8 
 
 
478 aa  674    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.376428  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0996  pyruvate kinase  69.96 
 
 
478 aa  667    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.384757  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5958  pyruvate kinase  69.96 
 
 
478 aa  645    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.169405 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0930  pyruvate kinase  88.24 
 
 
478 aa  856    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0664  pyruvate kinase  70.17 
 
 
564 aa  666    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.873714  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0205  pyruvate kinase  81.61 
 
 
476 aa  791    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0360  pyruvate kinase  77.12 
 
 
476 aa  728    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00195757 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4634  pyruvate kinase  85.17 
 
 
477 aa  819    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0690  pyruvate kinase  70.59 
 
 
478 aa  671    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.280221 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0502  pyruvate kinase  73.11 
 
 
479 aa  661    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2547  pyruvate kinase  70.17 
 
 
478 aa  647    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.138922  normal  0.914992 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2016  pyruvate kinase  70.17 
 
 
478 aa  647    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0840  pyruvate kinase  69.96 
 
 
478 aa  667    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0039  pyruvate kinase  69.96 
 
 
478 aa  667    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2674  pyruvate kinase  70.38 
 
 
478 aa  650    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5100  pyruvate kinase  85.65 
 
 
482 aa  837    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2627  pyruvate kinase  70.17 
 
 
478 aa  647    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.326659  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0479  pyruvate kinase  72.9 
 
 
479 aa  658    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0492  pyruvate kinase  72.9 
 
 
479 aa  657    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4581  pyruvate kinase  100 
 
 
478 aa  973    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3873  pyruvate kinase  85.84 
 
 
477 aa  822    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3956  pyruvate kinase  90.99 
 
 
478 aa  858    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179966  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0593  pyruvate kinase  69.96 
 
 
478 aa  667    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0196  pyruvate kinase  87.16 
 
 
496 aa  803    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1490  pyruvate kinase  65.05 
 
 
484 aa  596  1e-169  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.262532  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1531  pyruvate kinase  62.37 
 
 
478 aa  582  1.0000000000000001e-165  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3595  pyruvate kinase  63.16 
 
 
477 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000103054 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1816  pyruvate kinase  61.47 
 
 
478 aa  573  1.0000000000000001e-162  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0923913  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0162  pyruvate kinase  58.32 
 
 
477 aa  535  1e-151  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.158793 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2244  pyruvate kinase  55.16 
 
 
480 aa  511  1e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0168966 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0385  pyruvate kinase  55.25 
 
 
484 aa  496  1e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0406  pyruvate kinase  54.79 
 
 
491 aa  491  9.999999999999999e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3249  pyruvate kinase II  55.46 
 
 
479 aa  485  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.152379  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2850  pyruvate kinase  55.46 
 
 
479 aa  485  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2890  Pyruvate kinase  53.36 
 
 
480 aa  479  1e-134  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2387  pyruvate kinase  54.83 
 
 
476 aa  477  1e-133  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0280741 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1078  pyruvate kinase  52.5 
 
 
482 aa  477  1e-133  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.346201  hitchhiker  0.000000814857 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2805  pyruvate kinase  53.24 
 
 
483 aa  473  1e-132  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2597  pyruvate kinase  54.07 
 
 
488 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.384426  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1308  pyruvate kinase  51.55 
 
 
480 aa  466  9.999999999999999e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0412594 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1559  pyruvate kinase  53.73 
 
 
489 aa  466  9.999999999999999e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.33744  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0227  pyruvate kinase  51.05 
 
 
484 aa  462  1e-129  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.930918  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1978  pyruvate kinase  51.05 
 
 
484 aa  462  1e-129  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.65271  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0968  pyruvate kinase  51.89 
 
 
487 aa  463  1e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.797845  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2843  pyruvate kinase  51.88 
 
 
484 aa  462  1e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003011  pyruvate kinase  51.36 
 
 
480 aa  464  1e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22190  Pyruvate kinase  53.1 
 
 
481 aa  462  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01242  pyruvate kinase II  51.68 
 
 
478 aa  458  9.999999999999999e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.01193  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43370  Pyruvate kinase  52.89 
 
 
481 aa  461  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.692487  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27240  Pyruvate kinase  52.9 
 
 
481 aa  456  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02874  pyruvate kinase II  50.94 
 
 
518 aa  456  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51360  Pyruvate kinase  52.69 
 
 
481 aa  457  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1594  pyruvate kinase II  51.67 
 
 
481 aa  458  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0247  pyruvate kinase  51.26 
 
 
480 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000162471  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2246  pyruvate kinase  51.67 
 
 
480 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.556116  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1831  pyruvate kinase  50.42 
 
 
482 aa  455  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49990  Pyruvate kinase  52.27 
 
 
481 aa  451  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2770  pyruvate kinase  52.08 
 
 
480 aa  451  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00459379  hitchhiker  0.00854909 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2081  pyruvate kinase  50.94 
 
 
479 aa  449  1e-125  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1830  pyruvate kinase  52.08 
 
 
480 aa  450  1e-125  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0906108  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2114  pyruvate kinase  52.08 
 
 
480 aa  451  1e-125  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.482744  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1849  pyruvate kinase  51.24 
 
 
489 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0292343 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1040  pyruvate kinase  51.16 
 
 
478 aa  449  1e-125  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4452  pyruvate kinase  50.93 
 
 
484 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0972834  hitchhiker  0.00114079 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1362  pyruvate kinase  50.52 
 
 
484 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.195831 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2138  pyruvate kinase  51.25 
 
 
480 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0047703  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1002  pyruvate kinase  50.72 
 
 
484 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.614648  hitchhiker  0.00000000209752 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4362  pyruvate kinase  50.52 
 
 
484 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0914278  normal  0.0371458 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0579  pyruvate kinase II  50.94 
 
 
481 aa  442  1e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1890  pyruvate kinase  50.73 
 
 
479 aa  442  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2136  pyruvate kinase  51.67 
 
 
480 aa  444  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2414  pyruvate kinase  51.67 
 
 
480 aa  444  1e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000465691  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2024  pyruvate kinase  51.67 
 
 
480 aa  444  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0139067  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01825  pyruvate kinase  51.26 
 
 
480 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000225917  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1786  pyruvate kinase  51.26 
 
 
480 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00016701  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01813  hypothetical protein  51.26 
 
 
480 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000183599  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1360  pyruvate kinase  51.05 
 
 
480 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106873 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1236  pyruvate kinase  51.05 
 
 
480 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0173546  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2047  pyruvate kinase  51.05 
 
 
480 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.203446 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2042  pyruvate kinase  51.05 
 
 
480 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1332  pyruvate kinase  51.26 
 
 
480 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0207404  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38410  pyruvate kinase  50.21 
 
 
483 aa  440  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2084  pyruvate kinase  51.26 
 
 
480 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00593722  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1778  pyruvate kinase  51.26 
 
 
480 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.077358  normal  0.39747 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2590  pyruvate kinase  51.05 
 
 
480 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153756  normal  0.679884 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2102  pyruvate kinase  51.05 
 
 
480 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.590561 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2130  pyruvate kinase  51.26 
 
 
480 aa  441  9.999999999999999e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1814  pyruvate kinase  50.73 
 
 
479 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000221923  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1947  pyruvate kinase  51.26 
 
 
480 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.327094  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2050  pyruvate kinase  50.31 
 
 
479 aa  435  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000311706  normal  0.406012 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>