More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3403 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3403  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  100 
 
 		 299 aa  602  1.0000000000000001e-171  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391114 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3397  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  78.97 
 
 		 275 aa  382  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.056672  normal  0.0184534 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2095  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  76.11 
 
 		 247 aa  379  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00531734  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2695  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  73.46 
 
 		 264 aa  370  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.467837  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1726  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  73.71 
 
 		 260 aa  365  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0402438 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1988  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  64.77 
 
 		 284 aa  329  4e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.337161  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2047  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  66.06 
 
 		 277 aa  323  2e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.442557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1349  hypothetical protein  63.75 
 
 		 258 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1940  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  59.59 
 
 		 262 aa  275  7e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.333296 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1014  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  64.5 
 
 		 330 aa  256  4e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2615  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  50 
 
 		 285 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2486  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  49.63 
 
 		 285 aa  242  6e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.184998 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5899  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  51.13 
 
 		 285 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2591  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  51.13 
 
 		 285 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3220  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  49.63 
 
 		 285 aa  238  9e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0656  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  50 
 
 		 255 aa  238  1e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0742  ThiF family protein  49.63 
 
 		 285 aa  237  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.441652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1956  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  50.75 
 
 		 285 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.3958  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2567  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  50.75 
 
 		 285 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450041  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0729  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  49.24 
 
 		 285 aa  236  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0515  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.76 
 
 		 286 aa  236  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.632456  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0660  HesA/MoeB/ThiF family protein  51.57 
 
 		 288 aa  233  3e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0996044  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0360  HesA/MoeB/ThiF family protein  51.57 
 
 		 288 aa  233  3e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00356091  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0905  HesA/MoeB/ThiF family protein  51.57 
 
 		 288 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.386795  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2495  HesA/MoeB/ThiF family protein  51.57 
 
 		 288 aa  233  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.1313  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0108  HesA/MoeB/ThiF family protein  51.57 
 
 		 288 aa  233  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00087346  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1062  HesA/MoeB/ThiF family protein  51.57 
 
 		 341 aa  232  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.251408  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0902  HesA/MoeB/ThiF family protein  51.57 
 
 		 288 aa  232  5e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0718  HesA/MoeB/ThiF family protein  50.79 
 
 		 288 aa  228  8e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0036619  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4459  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.9 
 
 		 259 aa  228  1e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000135994 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0870  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  47.73 
 
 		 267 aa  223  3e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.049758 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1014  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  47.73 
 
 		 267 aa  223  3e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0318516 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1791  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  44.66 
 
 		 263 aa  223  4e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1898  HesA/MoeB/ThiF family protein  43.36 
 
 		 273 aa  222  7e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2639  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold-containing protein  48.5 
 
 		 302 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002691  HesA/MoeB/ThiF family protein  43.48 
 
 		 269 aa  216  4e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0818  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  48.51 
 
 		 295 aa  215  8e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412635  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03292  hypothetical protein  42.58 
 
 		 269 aa  213  2.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3305  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  50.95 
 
 		 274 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1525  ThiF family protein  44.79 
 
 		 276 aa  210  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.822958  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01865  HesA/MoeB/ThiF family protein  47.04 
 
 		 258 aa  204  1e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.385357  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0774  hypothetical protein  41.58 
 
 		 300 aa  204  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.22156  decreased coverage  0.00314195 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3213  ThiF family protein  43.7 
 
 		 268 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3150  ThiF family protein  43.7 
 
 		 268 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3199  ThiF family protein  43.7 
 
 		 268 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3133  ThiF family protein  43.7 
 
 		 268 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.852277  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3313  ThiF family protein  43.7 
 
 		 268 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.223246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3224  hypothetical protein  42.91 
 
 		 275 aa  202  4e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0137809  normal  0.551633 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1048  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.91 
 
 		 275 aa  203  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0792  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.91 
 
 		 300 aa  202  5e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.15291 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0546  HesA/MoeB/ThiF family protein  42.8 
 
 		 277 aa  202  6e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0491251  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2212  thiF family protein  41.42 
 
 		 272 aa  202  7e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.261926  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2953  ThiF family protein  42.91 
 
 		 266 aa  202  7e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0973303  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02663  hypothetical protein  42.91 
 
 		 268 aa  202  8e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0876  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.91 
 
 		 268 aa  202  8e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.995076  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0722  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.91 
 
 		 300 aa  202  8e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0900  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.91 
 
 		 268 aa  202  8e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2956  ThiF family protein  42.91 
 
 		 268 aa  202  8e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00132  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02624  hypothetical protein  42.91 
 
 		 268 aa  202  8e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3118  ThiF family protein  42.91 
 
 		 268 aa  202  8e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00141325  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0996  thiF family protein  42.52 
 
 		 275 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0511396  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3058  ThiF family protein  42.91 
 
 		 268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0969752  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1255  hypothetical protein  38.43 
 
 		 255 aa  199  3e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000298288  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0073  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.47 
 
 		 264 aa  198  7.999999999999999e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000480961  normal  0.411412 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2998  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.29 
 
 		 275 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0852  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.01 
 
 		 261 aa  198  1.0000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3381  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.9 
 
 		 272 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.383516  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0923  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.9 
 
 		 270 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.145938  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0688  hypothetical protein  43.41 
 
 		 271 aa  196  3e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0324843  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4077  ThiF family protein  42.52 
 
 		 266 aa  195  6e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.152819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3809  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.9 
 
 		 268 aa  195  9e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000533838  hitchhiker  0.000000527658 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3182  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.29 
 
 		 277 aa  194  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3226  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.48 
 
 		 272 aa  191  9e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0542286  hitchhiker  0.000000483539 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1333  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  45.17 
 
 		 276 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.100552 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0735  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.48 
 
 		 277 aa  190  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.349045  decreased coverage  0.0000365596 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0542  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  39.85 
 
 		 264 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0791  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.57 
 
 		 269 aa  189  7e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.456786  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0816  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.57 
 
 		 269 aa  189  7e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.859159  hitchhiker  0.000000000117233 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3568  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.57 
 
 		 269 aa  189  7e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.187067  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39130  ThiF-/MoeB-like protein  45.77 
 
 		 270 aa  188  8e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.107651  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0823  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.57 
 
 		 269 aa  188  8e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.65754  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3895  HesA/MoeB/ThiF family protein  42.91 
 
 		 267 aa  188  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0763  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.11 
 
 		 272 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.568059  unclonable  0.0000213544 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1090  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  44.44 
 
 		 270 aa  186  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0780  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45 
 
 		 270 aa  186  5e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000405798  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0512  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.03 
 
 		 268 aa  185  7e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.515692  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2895  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  49.41 
 
 		 274 aa  185  7e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4150  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.46 
 
 		 271 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0818457  normal  0.243283 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3064  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.85 
 
 		 269 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3258  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.31 
 
 		 268 aa  182  6e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4007  UBA/ThiF-type NAD/FAD binding protein  42.38 
 
 		 271 aa  179  4e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.751788  hitchhiker  0.0000000536443 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0591  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.25 
 
 		 266 aa  179  7e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.266567  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4197  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.4 
 
 		 269 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.489561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4216  hypothetical protein  45.49 
 
 		 270 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4092  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.63 
 
 		 269 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1527  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.63 
 
 		 271 aa  175  9e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0678963  normal  0.117289 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1136  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.63 
 
 		 269 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.761745 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49350  hypothetical protein  44.31 
 
 		 270 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0144415  normal  0.0686942 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0504  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.85 
 
 		 267 aa  171  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.568309  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1681  HesA/MoeB/ThiF family protein  42.74 
 
 		 296 aa  171  2e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>