70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3232 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3232  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  300  5.000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106365  normal  0.37909 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1692  protein of unknown function DUF779  78.77 
 
 
133 aa  229  1e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1888  hypothetical protein  78.29 
 
 
126 aa  202  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0009  hypothetical protein  78.07 
 
 
130 aa  191  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.860087  normal  0.0144121 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2727  hypothetical protein  71.79 
 
 
126 aa  184  5e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3513  hypothetical protein  72.17 
 
 
128 aa  182  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0598577  normal  0.262419 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4442  hypothetical protein  73.68 
 
 
131 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.958078  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0023  protein of unknown function DUF779  74.56 
 
 
131 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.722181  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3676  hypothetical protein  67.77 
 
 
136 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0218676  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3297  protein of unknown function DUF779  68.22 
 
 
119 aa  167  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1994  hypothetical protein  60.68 
 
 
124 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00400004  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3146  protein of unknown function DUF779  66.67 
 
 
112 aa  161  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1158  hypothetical protein  59.84 
 
 
130 aa  159  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2851  hypothetical protein  62.18 
 
 
124 aa  157  4e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7560  protein of unknown function DUF779  59.65 
 
 
121 aa  154  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4151  protein of unknown function DUF779  62.83 
 
 
120 aa  155  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.213784 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0073  protein of unknown function DUF779  61.54 
 
 
121 aa  155  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.466603 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3416  protein of unknown function DUF779  54.07 
 
 
146 aa  154  4e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1780  protein of unknown function DUF779  54.29 
 
 
148 aa  154  4e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00396827  normal  0.10554 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2335  protein of unknown function DUF779  60.71 
 
 
129 aa  154  5.0000000000000005e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0142786  normal  0.683952 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6812  hypothetical protein  59.65 
 
 
121 aa  154  6e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178282  normal  0.281119 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0151  hypothetical protein  52.59 
 
 
141 aa  153  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.10554 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2915  hypothetical protein  51.67 
 
 
129 aa  149  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.878639  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3221  hypothetical protein  51.43 
 
 
146 aa  149  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.728273  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0702  hypothetical protein  61.29 
 
 
129 aa  149  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.575226  normal  0.0343834 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3545  protein of unknown function DUF779  51.43 
 
 
146 aa  149  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0335617  normal  0.308833 
 
 
-
 
NC_004310  BR0204  hypothetical protein  64.42 
 
 
110 aa  148  3e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0196  hypothetical protein  64.42 
 
 
110 aa  148  3e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1090  protein of unknown function DUF779  61.54 
 
 
124 aa  147  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.92121  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3507  protein of unknown function DUF779  60.18 
 
 
130 aa  146  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5651  hypothetical protein  57.39 
 
 
124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.21953  hitchhiker  0.00918042 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3016  hypothetical protein  56.03 
 
 
121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3802  protein of unknown function DUF779  56.2 
 
 
130 aa  144  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.46071  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1324  protein of unknown function DUF779  60.18 
 
 
123 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0273  hypothetical protein  61.54 
 
 
119 aa  142  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2871  protein of unknown function DUF779  60.34 
 
 
126 aa  142  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.996732  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1191  hypothetical protein  61.54 
 
 
108 aa  142  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.996913  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1742  hypothetical protein  59.26 
 
 
120 aa  142  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.582598  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3179  hypothetical protein  58.49 
 
 
125 aa  141  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1007  hypothetical protein  57.63 
 
 
123 aa  141  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2259  hypothetical protein  59.43 
 
 
126 aa  140  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4884  protein of unknown function DUF779  58.87 
 
 
129 aa  140  6e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0598  hypothetical protein  57.89 
 
 
127 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0241572  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1613  hypothetical protein  58.65 
 
 
108 aa  137  3e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1743  hypothetical protein  55.26 
 
 
123 aa  134  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.685132  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0914  protein of unknown function DUF779  57.26 
 
 
130 aa  134  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.327144  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13400  hypothetical protein  52.46 
 
 
143 aa  133  7.000000000000001e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0793172  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1845  hypothetical protein  57.69 
 
 
108 aa  133  9e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.724228 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28640  hypothetical protein  57.89 
 
 
159 aa  132  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0628  hypothetical protein  52.76 
 
 
164 aa  131  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.113219  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0621  hypothetical protein  52.76 
 
 
164 aa  131  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188869  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21460  hypothetical protein  52.24 
 
 
145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0791  hypothetical protein  51.94 
 
 
161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.320423  normal  0.850639 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0641  hypothetical protein  52.76 
 
 
164 aa  131  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2786  protein of unknown function DUF779  57.52 
 
 
135 aa  131  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0104363 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2368  hypothetical protein  60.58 
 
 
118 aa  131  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.777752 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1783  hypothetical protein  52.89 
 
 
125 aa  131  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0894  hypothetical protein  59.63 
 
 
114 aa  130  6e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.750468  normal  0.376283 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2105  hypothetical protein  56.52 
 
 
122 aa  130  6e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4526  protein of unknown function DUF779  52.5 
 
 
154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.163674 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0956  hypothetical protein  57.52 
 
 
132 aa  128  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.387626 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0122  hypothetical protein  54.95 
 
 
158 aa  127  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.940827  normal  0.229372 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10466  hypothetical protein  56.86 
 
 
163 aa  127  7.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0110  protein of unknown function DUF779  49.61 
 
 
141 aa  126  8.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0186278  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3086  hypothetical protein  53.1 
 
 
135 aa  125  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3271  protein of unknown function DUF779  54.87 
 
 
119 aa  125  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.849625  normal  0.131748 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24910  hypothetical protein  46.81 
 
 
186 aa  114  3.9999999999999997e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4061  protein of unknown function DUF779  46.96 
 
 
125 aa  110  6e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0313  protein of unknown function DUF779  45.45 
 
 
115 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2966  hypothetical protein  40 
 
 
124 aa  98.2  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.807327  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>