164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2520 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2520  Ku domain-containing protein  100 
 
 		 375 aa  757    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1335  Ku protein  75.43 
 
 		 347 aa  451  1.0000000000000001e-126  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.326458  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2524  Ku domain-containing protein  75.78 
 
 		 347 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000225561 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4340  Ku protein  68.4 
 
 		 325 aa  410  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00918042 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3002  hypothetical protein  64.77 
 
 		 311 aa  369  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0841521  normal  0.430535 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2246  putative Ku-like DNA-end-binding protein  56.88 
 
 		 299 aa  366  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1176  Ku  57.19 
 
 		 320 aa  362  4e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.336283  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0497  Ku protein  62.27 
 
 		 341 aa  357  9.999999999999999e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1894  Ku domain-containing protein  58.63 
 
 		 310 aa  340  2e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.566888 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2329  Ku-domain-containing protein  53.63 
 
 		 335 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831159  normal  0.209111 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1857  Ku domain protein  54.31 
 
 		 333 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.170046  normal  0.195497 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3216  Ku domain-containing protein  56.46 
 
 		 283 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.437219 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0502  Ku protein  54.62 
 
 		 304 aa  301  2e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0488801 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3246  Ku  54.83 
 
 		 301 aa  299  4e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.208031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36760  KU domain-containing protein  53.77 
 
 		 293 aa  297  2e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.648282 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3465  KU domain protein  54.79 
 
 		 299 aa  296  3e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.674832  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0980  Ku protein  53.64 
 
 		 324 aa  296  3e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2613  Ku  55.17 
 
 		 286 aa  296  4e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54306 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0489  Ku protein  54.23 
 
 		 304 aa  296  5e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.288787 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3156  Ku protein  55.19 
 
 		 295 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.119299  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1347  Ku domain-containing protein  51.77 
 
 		 339 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0473966  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6482  Ku domain-containing protein  51.77 
 
 		 339 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6341  Ku protein  52.67 
 
 		 335 aa  288  9e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.198926 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5611  Ku domain-containing protein  53.05 
 
 		 335 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.542393 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5475  Ku protein  51.24 
 
 		 347 aa  287  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110297 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6072  Ku protein  51.67 
 
 		 339 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0823424 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3255  hypothetical protein  50.76 
 
 		 273 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0605236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2640  Ku protein  51.35 
 
 		 273 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.536145  normal  0.612342 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2656  Ku protein  51.34 
 
 		 282 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.677604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2506  Ku family containing protein  50.76 
 
 		 273 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1337  Ku70/Ku80 beta-barrel domain-containing protein  49.06 
 
 		 367 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3113  Ku protein  49.06 
 
 		 368 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2989  Ku protein  49.06 
 
 		 368 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0677507  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5082  Ku  40.75 
 
 		 334 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0189  hypothetical DNA-binding protein  41.54 
 
 		 284 aa  224  2e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2134  Ku protein  41.15 
 
 		 274 aa  220  3e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2838  hypothetical protein  40.45 
 
 		 259 aa  206  6e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3084  Ku protein  40.66 
 
 		 284 aa  199  6e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3304  Ku domain-containing protein  37.45 
 
 		 259 aa  193  3e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.418406  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0025  Ku protein  36.53 
 
 		 301 aa  193  4e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.520285  hitchhiker  0.00000000787139 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0045  Ku domainn containing protein  37.07 
 
 		 278 aa  189  9e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661126  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0997  Ku protein  40.71 
 
 		 264 aa  188  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0141  Ku protein  37.69 
 
 		 259 aa  187  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0124  Ku protein  36.94 
 
 		 259 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0953  Ku domain-containing protein  35.56 
 
 		 270 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01770  Ku protein  35.56 
 
 		 346 aa  181  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1712  Ku protein  39.65 
 
 		 254 aa  178  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.817891  hitchhiker  0.000191736 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0594  Ku domain-containing protein  38.49 
 
 		 283 aa  177  3e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1122  hypothetical protein  35.36 
 
 		 276 aa  177  4e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0364  Ku protein  33.08 
 
 		 312 aa  172  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.135034  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1489  DNA end-binding protein Ku  34.42 
 
 		 277 aa  170  4e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0652  Ku protein  33.44 
 
 		 295 aa  169  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2119  Ku protein  36.53 
 
 		 343 aa  166  8e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0642435  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0127  Ku protein  32.84 
 
 		 317 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1814  Ku protein  38.64 
 
 		 300 aa  165  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0552397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4108  Ku family containing protein  40.34 
 
 		 391 aa  160  3e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.337422 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1902  Ku protein  35.21 
 
 		 330 aa  159  1e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1234  DNA end-binding protein Ku  33.45 
 
 		 331 aa  157  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2003  Ku domain-containing protein  32.83 
 
 		 280 aa  157  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1728  Ku protein  31.54 
 
 		 257 aa  155  9e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.738787  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0137  Ku protein  33.46 
 
 		 259 aa  154  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00395823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1599  Ku protein  33.46 
 
 		 274 aa  153  4e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000232487 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0921  Ku family containing protein  30.75 
 
 		 318 aa  153  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.4753  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3719  Ku protein  30.58 
 
 		 285 aa  150  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000216795  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2607  DNA end-binding protein Ku  33.72 
 
 		 290 aa  150  4e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03400  Ku family containing protein  33.21 
 
 		 273 aa  149  6e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5247  Ku protein  33.58 
 
 		 347 aa  149  9e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0342675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0521  Ku protein  30.64 
 
 		 393 aa  149  9e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2990  Ku protein  34.87 
 
 		 286 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.575135  normal  0.987869 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1650  Ku protein  33.46 
 
 		 274 aa  145  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.475711  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13080  DNA end-binding protein Ku  33.52 
 
 		 332 aa  145  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.467677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1008  Ku family containing protein  33.2 
 
 		 299 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.140174  hitchhiker  0.00609843 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4531  Ku protein  30.29 
 
 		 316 aa  143  4e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.452627  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4423  Ku  32.84 
 
 		 301 aa  142  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238667  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2978  Ku domain-containing protein  32.68 
 
 		 307 aa  142  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.180009  normal  0.23611 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3981  Ku family containing protein  31.85 
 
 		 285 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.288761 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4361  DNA end-binding protein Ku  33.21 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.511078  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4447  DNA end-binding protein Ku  33.21 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28682  normal  0.0562745 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4741  DNA end-binding protein Ku  33.21 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.079051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0295  DNA end-binding protein Ku  33.33 
 
 		 346 aa  140  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3805  DNA end-binding protein Ku  33.48 
 
 		 396 aa  139  6e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.683793  normal  0.320133 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1826  Ku domain-containing protein  31.87 
 
 		 328 aa  138  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1694  Ku protein  31.46 
 
 		 285 aa  138  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0306892  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0154  hypothetical protein  29.25 
 
 		 328 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4917  Ku domain-containing protein  31.5 
 
 		 306 aa  138  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.833698  normal  0.128777 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1209  Ku protein  32.74 
 
 		 273 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.580217  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3324  hypothetical protein  31.8 
 
 		 310 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1021  Ku protein  33.19 
 
 		 296 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0311227  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0963  DNA end-binding protein Ku  33.62 
 
 		 296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3969  Ku domain-containing protein  30.63 
 
 		 344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.490752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4353  Ku family containing protein  31.03 
 
 		 344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.618075 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1024  Ku protein  33.33 
 
 		 296 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1426  Ku family containing protein  30.9 
 
 		 294 aa  133  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198791  hitchhiker  0.00133741 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0202  Ku protein  30.7 
 
 		 278 aa  132  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0376424  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3065  hypothetical protein  28.35 
 
 		 321 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.012759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2229  Ku protein  32.6 
 
 		 274 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2434  Ku domain-containing protein  31.44 
 
 		 264 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.359133  normal  0.109903 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0900  hypothetical protein  28.06 
 
 		 270 aa  129  6e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.116189  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1427  Ku family containing protein  29.81 
 
 		 271 aa  129  8.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.213972  hitchhiker  0.00131417 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0706  hypothetical protein  29.5 
 
 		 270 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00186853  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>