13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1610 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_1610  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  317  3.9999999999999996e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.305831 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3852  hypothetical protein  32.26 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.753191  hitchhiker  0.0000000217039 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1668  gp65  33.33 
 
 		 159 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000431261  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1027  gp65  33.33 
 
 		 159 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.47636  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1756  transcriptional regulator CII, putative  33.33 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.812409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3981  hypothetical protein  29.33 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000690616  normal  0.122233 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2453  hypothetical protein  33.58 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.000141524  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1621  transcriptional regulator CII, putative  30.95 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0886442  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3420  hypothetical protein  29.23 
 
 		 199 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00999602  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4692  hypothetical protein  33.11 
 
 		 178 aa  47.8  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2262  hypothetical protein  30.08 
 
 		 176 aa  44.3  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.416085  normal  0.844705 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2172  hypothetical protein  39.06 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1404  hypothetical protein  25.98 
 
 		 150 aa  40.4  0.009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000291349  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>