53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1203 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_1203    100 
 
 		 965 bp  1913    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.451865  decreased coverage  0.00500241 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3251  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  83.69 
 
 		 1026 bp  575  1.0000000000000001e-162  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61058  normal  0.330404 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2604  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  83.45 
 
 		 1026 bp  559  1e-157  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.224021  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5250  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  80.76 
 
 		 1083 bp  345  1e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.395511  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0676  diguanylate cyclase  94.87 
 
 		 1167 bp  61.9  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5435  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  100 
 
 		 2028 bp  61.9  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.620529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5712  diguanylate cyclase  90.2 
 
 		 951 bp  61.9  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.54195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2123  diguanylate cyclase  92.86 
 
 		 1908 bp  60  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00833547 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1246  diguanylate cyclase  92.68 
 
 		 1323 bp  58  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3557  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  92.5 
 
 		 969 bp  56  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.457648  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0638  diguanylate cyclase  94.44 
 
 		 1575 bp  56  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0484455 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1787  diguanylate cyclase  96.88 
 
 		 819 bp  56  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0160657 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0111  diguanylate cyclase  96.88 
 
 		 687 bp  56  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.645262 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2914  two component transcriptional regulator  94.29 
 
 		 717 bp  54  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0277  two component transcriptional regulator  90.7 
 
 		 708 bp  54  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.344057 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0318  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  94.29 
 
 		 1839 bp  54  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0698  diguanylate cyclase  94.29 
 
 		 1167 bp  54  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.814063  hitchhiker  0.00133482 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2886  response regulator receiver  94.29 
 
 		 702 bp  54  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1309  GGDEF  92.11 
 
 		 1005 bp  52  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365402 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2178  diguanylate cyclase  100 
 
 		 1221 bp  52  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.988519 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0691  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  92.11 
 
 		 2061 bp  52  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.343759  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1525  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  96.67 
 
 		 3504 bp  52  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3507  diguanylate cyclase  96.67 
 
 		 1464 bp  52  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0123  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 726 bp  50.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4616  two component transcriptional regulator  96.55 
 
 		 675 bp  50.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.055256 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1879  two component transcriptional regulator  93.94 
 
 		 705 bp  50.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0517303 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1002  diguanylate cyclase  96.55 
 
 		 2094 bp  50.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3752  two component transcriptional regulator  96.55 
 
 		 675 bp  50.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4429  diguanylate cyclase  88.89 
 
 		 1155 bp  50.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.901289 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4493  diguanylate cyclase  100 
 
 		 1215 bp  50.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.605021  normal  0.0319626 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5688  two component transcriptional regulator  96.55 
 
 		 675 bp  50.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0612982 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0943    96.55 
 
 		 3399 bp  50.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0130  diguanylate cyclase  96.43 
 
 		 1179 bp  48.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.922006  normal  0.941747 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1066  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  93.75 
 
 		 1830 bp  48.1  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.94417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2375  diguanylate cyclase  91.67 
 
 		 2295 bp  48.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0031  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 705 bp  48.1  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1564  two component transcriptional regulator, winged helix family  90 
 
 		 672 bp  48.1  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194978  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8064  response regulator of citrate/malate metabolism  100 
 
 		 675 bp  48.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2176  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 717 bp  48.1  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7254  response regulator receiver protein  93.75 
 
 		 678 bp  48.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.122444 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2287  diguanylate cyclase  91.67 
 
 		 2295 bp  48.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0148  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  93.75 
 
 		 3147 bp  48.1  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.872071 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02019  Putative signal protein with GGDEF domain  83.82 
 
 		 1485 bp  48.1  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1063  diguanylate cyclase  96.43 
 
 		 1101 bp  48.1  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3348  GGDEF domain-containing protein  90 
 
 		 1146 bp  48.1  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0219  histidine kinase  100 
 
 		 3501 bp  48.1  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.803779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0178  diguanylate cyclase  96.43 
 
 		 1566 bp  48.1  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.776824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2033  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 717 bp  48.1  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.649752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3689  diguanylate cyclase  96.43 
 
 		 2808 bp  48.1  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3460  GGDEF domain-containing protein  93.75 
 
 		 1935 bp  48.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0284505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3473  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  90 
 
 		 1056 bp  48.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1576  diguanylate cyclase  91.67 
 
 		 2295 bp  48.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3143  hypothetical protein  84.38 
 
 		 1380 bp  48.1  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>