More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0836 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0836  hypothetical protein  100 
 
 
336 aa  674    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0341852 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  47.47 
 
 
329 aa  291  9e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  46.8 
 
 
356 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3530  hypothetical protein  44.78 
 
 
321 aa  255  6e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  43.69 
 
 
323 aa  255  8e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  40.27 
 
 
331 aa  239  5.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  38.48 
 
 
327 aa  239  6.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  41.61 
 
 
344 aa  236  4e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  39.88 
 
 
335 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  41 
 
 
328 aa  235  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  41.02 
 
 
327 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  43.29 
 
 
324 aa  231  9e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2783  hypothetical protein  40.47 
 
 
324 aa  231  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  39.8 
 
 
328 aa  231  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  39.27 
 
 
339 aa  229  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3789  extra-cytoplasmic solute receptor  40.13 
 
 
326 aa  229  5e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  41.1 
 
 
328 aa  229  6e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  38.38 
 
 
336 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  37.09 
 
 
336 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  40.68 
 
 
325 aa  228  2e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  39.86 
 
 
339 aa  228  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  38.46 
 
 
339 aa  226  6e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  38.08 
 
 
331 aa  225  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  39.46 
 
 
331 aa  223  3e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  40.27 
 
 
328 aa  223  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  41.1 
 
 
325 aa  223  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  40.07 
 
 
324 aa  223  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  37.33 
 
 
330 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  37.33 
 
 
330 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  37.97 
 
 
328 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  37.97 
 
 
328 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  38.36 
 
 
324 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  38.58 
 
 
334 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  41.16 
 
 
358 aa  220  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  39.34 
 
 
330 aa  219  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  40.96 
 
 
326 aa  219  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  38.18 
 
 
325 aa  219  6e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3745  hypothetical protein  42.21 
 
 
330 aa  219  7e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0812255  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  40.83 
 
 
323 aa  218  7.999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  38.7 
 
 
322 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  37.33 
 
 
330 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1797  hypothetical protein  40.88 
 
 
334 aa  218  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0211033  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  38 
 
 
318 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0255  hypothetical protein  42.24 
 
 
332 aa  217  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459081  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  38.46 
 
 
325 aa  216  4e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0231  hypothetical protein  37.23 
 
 
329 aa  216  4e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  36.54 
 
 
334 aa  216  4e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  36.91 
 
 
344 aa  216  4e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  38.56 
 
 
333 aa  216  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  38.08 
 
 
336 aa  216  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4433  extra-cytoplasmic solute receptor  38.62 
 
 
327 aa  216  5.9999999999999996e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.318216 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  37.67 
 
 
339 aa  215  7e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  36.99 
 
 
325 aa  215  7e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  37.08 
 
 
330 aa  215  9e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4563  hypothetical protein  36.15 
 
 
329 aa  215  9e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.011816  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  36.5 
 
 
328 aa  215  9e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  37.46 
 
 
360 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  40.41 
 
 
327 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  36.94 
 
 
327 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  37.33 
 
 
335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3785  hypothetical protein  41.29 
 
 
362 aa  214  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0141562  normal  0.251227 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3135  hypothetical protein  39.24 
 
 
326 aa  213  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82433  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1427  twin-arginine translocation pathway signal  39.64 
 
 
334 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  35.95 
 
 
328 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  37.5 
 
 
351 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1818  hypothetical protein  39.46 
 
 
326 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00429449 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1997  hypothetical protein  40.57 
 
 
334 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.02937  normal  0.517294 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  36.25 
 
 
327 aa  213  4.9999999999999996e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  39.38 
 
 
349 aa  212  5.999999999999999e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  39.53 
 
 
339 aa  212  7e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4820  hypothetical protein  37.29 
 
 
322 aa  212  7.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6068  hypothetical protein  37.12 
 
 
324 aa  212  9e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  38.05 
 
 
330 aa  211  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6021  hypothetical protein  39.13 
 
 
338 aa  211  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  38.05 
 
 
330 aa  211  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2820  hypothetical protein  37.84 
 
 
359 aa  211  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.407557  normal  0.294179 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  36.59 
 
 
332 aa  211  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1295  hypothetical protein  40.34 
 
 
324 aa  211  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.356601  normal  0.17145 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  38.49 
 
 
322 aa  210  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  35.79 
 
 
345 aa  210  3e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  35.79 
 
 
345 aa  210  3e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  37.67 
 
 
326 aa  210  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4520  hypothetical protein  38.64 
 
 
326 aa  209  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  38.05 
 
 
341 aa  209  4e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  35.4 
 
 
334 aa  209  5e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  38.98 
 
 
323 aa  209  5e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  37.92 
 
 
338 aa  209  5e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  37.33 
 
 
337 aa  209  6e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  37.5 
 
 
325 aa  208  8e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  37.5 
 
 
327 aa  209  8e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  40.81 
 
 
348 aa  208  9e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  35.76 
 
 
332 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3883  hypothetical protein  36.75 
 
 
328 aa  208  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0436516  normal  0.492905 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3156  hypothetical protein  36.75 
 
 
328 aa  208  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.368147  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  40.07 
 
 
322 aa  207  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0288  hypothetical protein  36.97 
 
 
325 aa  208  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  37.99 
 
 
334 aa  208  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  35.82 
 
 
332 aa  208  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0533  hypothetical protein  35.55 
 
 
344 aa  208  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396923 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  35.91 
 
 
335 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>