131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_R0057 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010830  Aasi_R0057  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0065  tRNA-Arg  93.44 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000631385  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19600  tRNA-Arg  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0108959  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0042  tRNA-Arg  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0022  tRNA-Arg  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193997 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0055  tRNA-Arg  93.62 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000183529  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0023  tRNA-Arg  93.62 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.2030600000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0021  tRNA-Lys  93.62 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0160361  normal  0.0210498 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0016  tRNA-Lys  93.62 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000293232  hitchhiker  0.00358578 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  93.48 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000104692  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0044  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.959306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0075  tRNA-Arg  88.24 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000307133  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tArg02  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0064  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0050  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0023  tRNA-Arg  92.86 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.601001  normal  0.725234 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0019  tRNA-Lys  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.475559  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4297  tRNA-Arg  87.69 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.801361  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0016  tRNA-Arg  87.69 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.448611  normal  0.584402 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0034  tRNA-Arg  94.59 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.9068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0024  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0064  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00190165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0067  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0050  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0020  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.732276  normal  0.397145 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0035  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0064  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0047  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.67913  normal  0.0842935 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0016  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.625219  normal  0.104037 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0049  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0844  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 79 bp  56  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.998646  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0012  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0409907  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0029  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t13  tRNA-Lys  89.36 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0029  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.179908  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0057  tRNA-Arg  89.36 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0015  tRNA-Arg  89.36 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000291538  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0009  tRNA-Lys  89.36 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000774106  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAArgVIMSS1309097  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAArgVIMSS1309129  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.751283  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAArgVIMSS1309209  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAArgVIMSS1309268  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.292305 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAArgVIMSS1309170  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.269731  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0028  tRNA-Arg  89.36 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221183 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAArgVIMSS1309379  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0734599  normal  0.0320984 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0020  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0247478  normal  0.430055 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0020  tRNA-Lys  89.36 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000489329  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0027  tRNA-Arg  89.36 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000775321  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0015  tRNA-Lys  89.36 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0122197  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0033  tRNA-Arg  87.04 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000397698  normal  0.298215 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0039  tRNA-Lys  89.13 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0030  tRNA-Lys  89.13 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0471674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0025  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0023  tRNA-Arg  87.72 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000416946  unclonable  9.7747e-19 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0018  tRNA-Arg  87.72 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330043  normal  0.24905 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1467  tRNA-Arg  91.11 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0007  tRNA-Arg  87.72 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.688543  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  90.91 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.578717  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1714  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.22026  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2749  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0009  tRNA-Thr  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000000517155  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1329  tRNA-Thr  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0434534  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1682  tRNA-Arg  90.91 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.788721  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0017  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1748  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0337298  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1760  tRNA-Arg  90.91 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0024  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1514  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1545  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0924  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.154841  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2039  tRNA-Arg  90.91 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.000000359807  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2138  tRNA-Arg  90.91 
 
 		 79 bp  48.1  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0224464  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2213  tRNA-Arg  90.91 
 
 		 79 bp  48.1  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.140545  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0021  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.489181  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0049  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0167609  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0028  tRNA-Lys  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0127265  normal  0.289894 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0695  tRNA-Thr  88.37 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0040  tRNA-Arg  86.44 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0025  tRNA-Arg  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0135178  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0035  tRNA-Arg  86.27 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262035  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tArg04  tRNA-Arg  93.55 
 
 		 80 bp  46.1  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0364203  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0040  tRNA-Arg  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.435782  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0038  tRNA-Arg  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00706583  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0032  tRNA-Arg  86.27 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.51737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0029  tRNA-Arg  86.27 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.403719 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0016  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0047026  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0046  tRNA-Arg  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000649566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0027  tRNA-Arg  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.005  hitchhiker  0.000281231 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0016  tRNA-Arg  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000516971  normal  0.0942255 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0040  tRNA-Arg  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0606  tRNA-Arg  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0764025 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0664  tRNA-Arg  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.294078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0599  tRNA-Arg  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000676837 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0049  tRNA-Arg  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000247527  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0041  tRNA-Arg  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000701691  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0057  tRNA-Arg  86.27 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0771  tRNA-Arg  87.23 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>