38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_R0051 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010830  Aasi_R0051  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0053  tRNA-Arg  86.57 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0223382  normal  0.521756 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0099  tRNA-Arg  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.108565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0041  tRNA-Arg  86.67 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0001  tRNA-Arg  86.44 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383152  normal  0.0513953 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0052  tRNA-Arg  86.89 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.483727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0008  tRNA-Arg  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0056  tRNA-Arg  85.25 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000119061  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0044  tRNA-Arg  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0009  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.29751  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0040  tRNA-Arg  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.589748  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0045  tRNA-Arg  86.54 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000178577  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0066  tRNA-Arg  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.171209  normal  0.834586 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0014  tRNA-Arg  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.434333 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0045  tRNA-Arg  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0044  tRNA-Trp  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.910228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0005  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02200  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0008  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.56031  normal  0.0314068 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0007  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.866395  normal  0.129572 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27060  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.14879  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0057  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.921424  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0017  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.33811 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0009  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0026  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.200362  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0026  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0020  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0945602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0036  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.224199 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0003  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0001  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000193558  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0019  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0292581 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0044  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0235767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0042  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1323  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000340383  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0005  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0040  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0238659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0007  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0315655 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0024  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>