21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_R0023 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_R0023  tRNA-Arg  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0036  tRNA-Arg  86.3 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.957158  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0030  tRNA-Arg  86.3 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.54758  normal  0.411932 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0024  tRNA-Arg  86.3 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000167821  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0024  tRNA-Arg  86.3 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000092316  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0065  tRNA-Arg  87.3 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.68192e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0053  tRNA-Arg  84.93 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00902576 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0037  tRNA-Arg  87.5 
 
 
74 bp  56  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.261059  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0001  tRNA-Arg  88.24 
 
 
77 bp  54  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000193558  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0098  tRNA-Arg  83.56 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237653  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0030  tRNA-Lys  96.55 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0471674  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA24  tRNA-Arg  91.89 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0111791  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0036  tRNA-Arg  91.89 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.219616  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0048  tRNA-Arg  91.89 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.480879  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0033    91.89 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.465257  normal  0.162996 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0011  tRNA-Arg  93.75 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.836815 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Trp-1  tRNA-Trp  96.3 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000619868  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0016  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.448611  normal  0.584402 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0052  tRNA-Arg  93.33 
 
 
73 bp  44.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.483727  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0040  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4297  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.801361  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>