More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_3078 on replicon NC_013207
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013207  Aaci_3078  response regulator receiver protein  100 
 
 		 142 aa  286  8e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1651  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.05 
 
 		 218 aa  67.8  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000163278  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1273  response regulator receiver protein  29.79 
 
 		 430 aa  67.4  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1683  response regulator receiver protein  28.95 
 
 		 430 aa  65.5  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1392  sporulation transcriptional activator Spo0A  31.58 
 
 		 257 aa  64.3  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.664762  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10620  response regulator receiver protein  30.89 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00212992  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4502  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.58 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3375  two component LuxR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4612  response regulator receiver protein  30 
 
 		 417 aa  61.6  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.936503  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2298  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  29.91 
 
 		 338 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.981818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  29.03 
 
 		 412 aa  61.2  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00210  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  31.82 
 
 		 221 aa  60.8  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.133182 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30650  response regulator GacA  27.48 
 
 		 214 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700013 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2613  response regulator GacA  27.48 
 
 		 214 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.466832  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1122  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.5 
 
 		 234 aa  60.1  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.752968  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4099  DNA-binding response regulator GacA  28.7 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.427607  normal  0.0594882 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3672  two component LuxR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309643  hitchhiker  0.000000290511 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1765  two component LuxR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.456405  hitchhiker  0.00257365 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4503  two component LuxR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178457  normal  0.0169691 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1563  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.781509  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2711  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  32.11 
 
 		 347 aa  58.5  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1383  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  32.08 
 
 		 362 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0815  two component LuxR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0355  response regulator receiver protein  28.45 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13154  two component system transcriptional regulatory protein DevR  30.08 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0952  stage 0 sporulation protein A  26.92 
 
 		 276 aa  57.8  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.023849  hitchhiker  0.00211698 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1775  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.97 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.814588  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4282  stage 0 sporulation protein A  26.92 
 
 		 276 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3024  DNA-binding response regulator GacA  26.92 
 
 		 214 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26082  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2865  response regulator receiver protein  28.03 
 
 		 264 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1355  two component LuxR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 230 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4243  stage 0 sporulation protein A  26.92 
 
 		 276 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0766925  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3847  two component LuxR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 216 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.118356  decreased coverage  0.00872558 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2375  two component LuxR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 214 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.405291  normal  0.0506876 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4301  stage 0 sporulation protein A  26.92 
 
 		 276 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.794835  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2548  two component LuxR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 216 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.971783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4023  sporulation transcriptional activator Spo0A  27.69 
 
 		 288 aa  57.4  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0869765  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4394  stage 0 sporulation protein A  26.92 
 
 		 264 aa  57  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.206267  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 238 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0870  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  31.78 
 
 		 360 aa  57.4  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1056  two component LuxR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 219 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1083  two component LuxR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 219 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1072  two component LuxR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 219 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.562029  normal  0.0679961 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1369  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.97 
 
 		 218 aa  57  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.380225  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4076  stage 0 sporulation protein A  26.92 
 
 		 276 aa  57  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000149935  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3914  stage 0 sporulation protein A  26.92 
 
 		 276 aa  57  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000973306  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3925  stage 0 sporulation protein A  26.92 
 
 		 276 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.497663  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2897  LuxR response regulator receiver  26.92 
 
 		 222 aa  57  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.017691  normal  0.317002 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4192  stage 0 sporulation protein A  26.92 
 
 		 276 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17859e-22 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3209  response regulator receiver protein  30.7 
 
 		 416 aa  57  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.5486  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0988  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  30.36 
 
 		 350 aa  57  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00710031  normal  0.382594 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1436  response regulator  29.81 
 
 		 214 aa  57  0.00000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.794512  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  29.27 
 
 		 391 aa  57  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0765  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  33.94 
 
 		 367 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2474  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  31.13 
 
 		 362 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0236682  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1929  two component transcriptional regulator, LuxR family  24.41 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0772  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  30.48 
 
 		 353 aa  56.6  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.446886  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0791  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  33.94 
 
 		 367 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20270  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  27.73 
 
 		 339 aa  56.2  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0989  chemotaxis-specific methylesterase  28.85 
 
 		 390 aa  56.6  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699013 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1641  response regulator receiver protein  30.89 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.772734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2649  response regulator  28.85 
 
 		 214 aa  57  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2314  sporulation transcriptional activator Spo0A  27.27 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.453721  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3271  response regulator  25.78 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0222898  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1985  Protein-glutamate methylesterase  33.96 
 
 		 341 aa  55.8  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0052895  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03947  osmolarity response regulator  31.73 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2570  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  31.13 
 
 		 362 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1071  two component LuxR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1571  response regulator receiver domain-containing protein  30.19 
 
 		 369 aa  55.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.421164  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2141  response regulator  24.39 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.126922  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4126  two component LuxR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0500  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.46 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1614  response regulator  28.81 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000746753  normal  0.505035 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0973  two component LuxR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.255067  normal  0.404517 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4357  two component LuxR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.171113 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4201  two component LuxR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2677  response regulator  28.81 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0738952  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1782  response regulator  28.81 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0381154  hitchhiker  0.0000000750596 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2562  response regulator  28.81 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0171044  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5998  response regulator receiver protein  23.62 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0982  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 377 aa  55.1  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.537061  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1247  LuxR family DNA-binding response regulator  28.85 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32702  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2600  response regulator  28.81 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000388579  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1791  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  28.1 
 
 		 350 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4011  response regulator receiver protein  23.62 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  27.14 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1547  response regulator  28.81 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000288339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1179  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  31.43 
 
 		 368 aa  55.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.564706  normal  0.289977 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0931  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 430 aa  55.5  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3575  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.61 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.10936  normal  0.0183031 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4356  response regulator receiver protein  23.62 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0378  response regulator receiver protein  36.7 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5014  two component LuxR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.103708  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1608  response regulator  28.81 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000660452  normal  0.150334 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11642  two component system transcriptional regulator  31 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0378541  normal  0.634495 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0830  transcriptional regulator  25.95 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06590  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 262 aa  54.7  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232495  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26840  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  30.84 
 
 		 239 aa  54.7  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274056  normal  0.228776 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1358  two component LuxR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.110964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2109  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  28.36 
 
 		 515 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>