44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0472 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_0472  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 
79 aa  158  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000091739  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1068  transcriptional regulator, XRE family  46.67 
 
 
72 aa  61.2  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0135109  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0469  transcriptional regulator, XRE family  45 
 
 
71 aa  58.2  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000140129  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2430  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 
64 aa  47.4  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2711  XRE family transcriptional regulator  37.14 
 
 
112 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.256888  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0118  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 
81 aa  46.2  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0505  cryptic phage CTXphi transcriptional repressor RstR  31.34 
 
 
111 aa  45.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.451167  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1067  cryptic phage CTXphi transcriptional repressor RstR  31.34 
 
 
111 aa  45.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.745753  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1070  cryptic phage CTXphi transcriptional repressor RstR  31.34 
 
 
111 aa  45.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 
137 aa  44.7  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4855  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
73 aa  45.1  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5294  transcriptional regulator, XRE family  39.39 
 
 
194 aa  44.7  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4739  DNA-binding protein  30.67 
 
 
73 aa  44.3  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4758  DNA-binding protein  30.67 
 
 
73 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0571449  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2965  transcriptional regulator, XRE family  30.43 
 
 
224 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.598952  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5169  DNA-binding protein  31.15 
 
 
79 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5184  DNA-binding protein  31.67 
 
 
73 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5175  DNA-binding protein  31.67 
 
 
73 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0632  transcriptional regulator, XRE family  32.79 
 
 
71 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000285782  unclonable  0.0000000000746668 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5270  DNA-binding protein  29.33 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4210  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 
106 aa  42  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4895  DNA-binding protein  29.33 
 
 
73 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0703  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000971993  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2365  transcriptional regulator, XRE family  31.75 
 
 
63 aa  42.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.729391 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5139  DNA-binding protein  29.33 
 
 
73 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1714  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 
67 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000253714  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2210  putative DNA-binding protein  36.36 
 
 
61 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2790  helix-turn-helix domain protein  35.21 
 
 
393 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.783266 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2370  transcriptional regulator, XRE family  30.43 
 
 
72 aa  41.6  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3316  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 
60 aa  41.2  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000216063  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  32.79 
 
 
92 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1478  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 
72 aa  41.6  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0240  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
81 aa  41.6  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000370797  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3497  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 
263 aa  40.8  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.731852  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0766  helix-turn-helix domain protein  31.43 
 
 
182 aa  41.2  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494379  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0075  DNA-binding protein  30 
 
 
73 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0282  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 
82 aa  40.8  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0320229  normal  0.855022 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  36.76 
 
 
118 aa  40.8  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  32.79 
 
 
149 aa  40.4  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1276  transcriptional regulator, XRE family  39.29 
 
 
69 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  32.79 
 
 
149 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1207  transcriptional regulator, XRE family  39.29 
 
 
69 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12255  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1147  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 
69 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0888  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 
67 aa  40  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>