135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2959 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_2572  hypothetical protein  100 
 
 		 93 aa  196  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2959  hypothetical protein  100 
 
 		 93 aa  196  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.269424  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2696  hypothetical protein  71.26 
 
 		 88 aa  141  3e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62763 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2485  Fe(II) trafficking protein YggX  68.18 
 
 		 91 aa  139  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0570791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2944  hypothetical protein  68.54 
 
 		 90 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.807996  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2268  hypothetical protein  68.18 
 
 		 90 aa  137  3.9999999999999997e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5466  hypothetical protein  69.66 
 
 		 91 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5920  hypothetical protein  69.66 
 
 		 91 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2157  hypothetical protein  69.66 
 
 		 91 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220709  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2175  hypothetical protein  69.66 
 
 		 91 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2067  hypothetical protein  68.54 
 
 		 91 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1114  hypothetical protein  68.54 
 
 		 91 aa  133  8e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.158096  normal  0.927439 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0133  hypothetical protein  69.32 
 
 		 109 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1511  hypothetical protein  66.29 
 
 		 90 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.309754 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2194  hypothetical protein  67.42 
 
 		 91 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.609831  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2624  hypothetical protein  64.84 
 
 		 91 aa  131  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.804415 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1836  hypothetical protein  67.42 
 
 		 91 aa  131  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.703285  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2423  hypothetical protein  63.33 
 
 		 93 aa  131  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2071  hypothetical protein  68.18 
 
 		 114 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.152399  normal  0.926717 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1490  hypothetical protein  67.42 
 
 		 91 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0380307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1222  hypothetical protein  64.04 
 
 		 90 aa  129  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2067  hypothetical protein  67.05 
 
 		 90 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.436295  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2344  hypothetical protein  62.92 
 
 		 90 aa  128  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2229  hypothetical protein  65.17 
 
 		 90 aa  128  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0381  hypothetical protein  62.92 
 
 		 90 aa  128  3e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1077  hypothetical protein  67.05 
 
 		 91 aa  128  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1169  hypothetical protein  67.05 
 
 		 91 aa  128  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0980986  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1235  hypothetical protein  67.05 
 
 		 91 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1752  hypothetical protein  65.17 
 
 		 91 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2778  hypothetical protein  65.17 
 
 		 91 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2261  hypothetical protein  65.17 
 
 		 91 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.283774  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3058  hypothetical protein  65.17 
 
 		 91 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.141568  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2644  hypothetical protein  65.17 
 
 		 91 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2700  hypothetical protein  65.17 
 
 		 91 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0938348  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1533  hypothetical protein  65.17 
 
 		 91 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.795875  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2982  hypothetical protein  62.92 
 
 		 90 aa  127  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1142  hypothetical protein  64.37 
 
 		 90 aa  126  9.000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2102  hypothetical protein  61.8 
 
 		 90 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.183711  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1524  hypothetical protein  64.77 
 
 		 90 aa  125  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.384209  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3583  hypothetical protein  62.92 
 
 		 90 aa  125  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.507536 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1798  hypothetical protein  60.67 
 
 		 90 aa  124  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.716542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1924  hypothetical protein  60.67 
 
 		 90 aa  124  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.441849  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0687  hypothetical protein  62.5 
 
 		 91 aa  121  3e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.166712  normal  0.641044 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1372  hypothetical protein  60 
 
 		 91 aa  120  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3047  hypothetical protein  65.17 
 
 		 90 aa  120  7e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.45877  normal  0.0178408 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1263  hypothetical protein  60.67 
 
 		 90 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.339369  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1850  Fe(II) trafficking protein YggX  62.5 
 
 		 93 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.302914  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0856  hypothetical protein  59.09 
 
 		 90 aa  118  3e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3964  hypothetical protein  57.3 
 
 		 90 aa  118  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.82757  normal  0.502915 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1902  hypothetical protein  57.65 
 
 		 89 aa  117  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1132  hypothetical protein  59.3 
 
 		 90 aa  117  3.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0024  hypothetical protein  61.11 
 
 		 91 aa  117  6e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.828588  normal  0.104747 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1002  hypothetical protein  59.3 
 
 		 90 aa  116  7.999999999999999e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0880728  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1891  hypothetical protein  57.65 
 
 		 89 aa  116  9e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4642  hypothetical protein  60.67 
 
 		 90 aa  111  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.451223  hitchhiker  0.0000118597 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0121  hypothetical protein  55.81 
 
 		 90 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000208752  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2250  hypothetical protein  55.06 
 
 		 100 aa  105  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000276973 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00283  hypothetical protein  55.68 
 
 		 90 aa  104  4e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1443  hypothetical protein  54.55 
 
 		 92 aa  103  7e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1162  Fe(II) trafficking protein YggX  54.02 
 
 		 105 aa  103  9e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0908  hypothetical protein  51.76 
 
 		 95 aa  102  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.431969  hitchhiker  0.00353106 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2437  hypothetical protein  52.27 
 
 		 92 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117093  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2491  hypothetical protein  53.85 
 
 		 91 aa  101  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.427029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68000  hypothetical protein  51.69 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0291982  normal  0.0102639 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5885  hypothetical protein  51.69 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0336  hypothetical protein  53.41 
 
 		 90 aa  100  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.11522 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1426  hypothetical protein  51.14 
 
 		 92 aa  100  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0319  hypothetical protein  51.69 
 
 		 90 aa  100  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0490853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0075  hypothetical protein  54.55 
 
 		 90 aa  100  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.206235  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01429  hypothetical protein  59.21 
 
 		 88 aa  100  8e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.25922  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0285  hypothetical protein  50.56 
 
 		 90 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110357 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0305  hypothetical protein  50.56 
 
 		 90 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284678 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3771  hypothetical protein  50.59 
 
 		 95 aa  99.8  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.342346 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0310  hypothetical protein  50.56 
 
 		 90 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12691  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3369  hypothetical protein  50 
 
 		 92 aa  98.6  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3040  hypothetical protein  50 
 
 		 92 aa  98.6  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000474974  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2701  hypothetical protein  50 
 
 		 92 aa  98.6  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0665477  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3054  hypothetical protein  50 
 
 		 92 aa  98.6  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00037558  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1324  hypothetical protein  50 
 
 		 92 aa  98.6  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000513126  normal  0.0116062 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3197  hypothetical protein  50 
 
 		 92 aa  98.6  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000564871  normal  0.56493 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1521  hypothetical protein  50 
 
 		 113 aa  99  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.62203  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1544  hypothetical protein  51.69 
 
 		 89 aa  98.2  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.251513  normal  0.581544 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4923  hypothetical protein  48.31 
 
 		 90 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000436986 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1179  hypothetical protein  50 
 
 		 92 aa  96.3  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000882261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1250  hypothetical protein  50 
 
 		 92 aa  96.3  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00387926  normal  0.782101 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1180  hypothetical protein  50 
 
 		 92 aa  96.3  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000191738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04520  hypothetical protein  51.14 
 
 		 90 aa  96.3  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.683421  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0533  hypothetical protein  50.56 
 
 		 90 aa  95.1  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000920147  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4260  hypothetical protein  49.44 
 
 		 90 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221746  hitchhiker  0.00000000242965 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1057  hypothetical protein  47.73 
 
 		 105 aa  94  6e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.977359  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0938  hypothetical protein  47.73 
 
 		 90 aa  94  7e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5343  hypothetical protein  47.73 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4902  hypothetical protein  47.73 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2699  hypothetical protein  50.56 
 
 		 91 aa  92.4  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000360658  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1668  hypothetical protein  46.15 
 
 		 91 aa  92.8  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2874  hypothetical protein  49.44 
 
 		 92 aa  92.4  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429816  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0002  hypothetical protein  48.31 
 
 		 90 aa  92  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000338126  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4149  hypothetical protein  50.56 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.786111  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1107  hypothetical protein  51.72 
 
 		 92 aa  91.7  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000149514  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002445  hypothetical protein  48.31 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000631832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>