More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2685 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2685  OmpA family protein  100 
 
 		 183 aa  378  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125944  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2309  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 184 aa  378  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0306  OmpA family protein  57.6 
 
 		 217 aa  147  6e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000558154  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0482  OmpA/MotB domain protein  57.6 
 
 		 217 aa  147  6e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000816193  hitchhiker  0.00000930185 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0307  OmpA/MotB  34.58 
 
 		 533 aa  82.4  0.000000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  44.55 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0280  OmpA family outer membrane protein  33.64 
 
 		 533 aa  80.5  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  41.18 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  41.58 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  42.86 
 
 		 320 aa  78.6  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  38.58 
 
 		 445 aa  79  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  42.57 
 
 		 224 aa  78.6  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  40.57 
 
 		 261 aa  77.8  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  40.57 
 
 		 261 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0908  OmpA/MotB domain-containing protein  42.57 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.685511 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1654  OmpA/MotB domain-containing protein  36.36 
 
 		 344 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000122259  normal  0.141809 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  42.16 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  38.68 
 
 		 264 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  42.57 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0673  OmpA/MotB domain-containing protein  44.44 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.534007  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003729  outer membrane protein  39.22 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113552  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3969  OmpA family protein  41.58 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  40.22 
 
 		 454 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2405  OmpA/MotB domain protein  43 
 
 		 175 aa  75.5  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.741795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  31.9 
 
 		 537 aa  75.5  0.0000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1976  OmpA/MotB domain protein  34.42 
 
 		 331 aa  75.5  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0825703  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  43.56 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0708  OmpA/MotB domain-containing protein  41.58 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.808623  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41140  OmpA family protein  40.2 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  40.4 
 
 		 334 aa  75.1  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  42.57 
 
 		 209 aa  74.7  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  36.79 
 
 		 294 aa  74.3  0.0000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  27.54 
 
 		 490 aa  74.3  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  41.58 
 
 		 212 aa  74.3  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  38.53 
 
 		 261 aa  74.3  0.0000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  40.95 
 
 		 318 aa  74.3  0.0000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  31.36 
 
 		 506 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  48.65 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  39.39 
 
 		 330 aa  74.3  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3675  OmpA/MotB domain-containing protein  40.59 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000026276  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0709  OmpA/MotB domain-containing protein  40.59 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000940918  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0120  OmpA/MotB domain protein  38.38 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0700  OmpA/MotB domain protein  40.59 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0679  OmpA/MotB domain-containing protein  40.59 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0519812  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  36.94 
 
 		 319 aa  73.2  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  41.41 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  41.41 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  37.25 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  39.47 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0666  OmpA/MotB domain-containing protein  40.59 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000515803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3356  OmpA/MotB domain-containing protein  40.59 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000065492  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0763  OmpA/MotB domain-containing protein  39.42 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000067511  unclonable  1.30394e-19 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  37.25 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0665  OmpA/MotB domain-containing protein  40.59 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000180741  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  40.57 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5036  ompA family protein  38.61 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  30.77 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  41.58 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  41.58 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0587  OmpA family outer membrane protein  38.84 
 
 		 267 aa  72  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.512873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  38.61 
 
 		 218 aa  72  0.000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  35.94 
 
 		 367 aa  71.6  0.000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  39.47 
 
 		 230 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1004  OmpA/MotB domain protein  41.41 
 
 		 175 aa  71.6  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  39.47 
 
 		 230 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  41.58 
 
 		 294 aa  71.6  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  31.55 
 
 		 525 aa  71.6  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  38.32 
 
 		 223 aa  71.2  0.000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1782  OmpA/MotB domain-containing protein  35.85 
 
 		 288 aa  71.2  0.000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000133592  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  39.13 
 
 		 231 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10918  outer membrane protein A ompA  39.82 
 
 		 326 aa  71.2  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0114  outer membrane protein A  33.8 
 
 		 342 aa  71.2  0.000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.394411  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  40.38 
 
 		 243 aa  71.2  0.000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  39.6 
 
 		 217 aa  71.2  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1220  OmpA/MotB domain protein  37.82 
 
 		 168 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.936608 
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  40.38 
 
 		 220 aa  70.9  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0823  OmpA/MotB  41.58 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  30.26 
 
 		 468 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0644  OmpA/MotB domain protein  30.07 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  0.0953573 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  42.57 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  35.71 
 
 		 429 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0815  putative lipoprotein  39.22 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  29.61 
 
 		 466 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  28.39 
 
 		 388 aa  70.1  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  43.56 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  39.62 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  36.27 
 
 		 623 aa  70.1  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  39.66 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  35.71 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3624  OmpA/MotB domain-containing protein  38.61 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0928297  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4248  OmpA/MotB domain-containing protein  40.59 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000908263  unclonable  0.0000000127118 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  32.14 
 
 		 464 aa  68.9  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  34.4 
 
 		 352 aa  69.3  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  36 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  38.6 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  36.36 
 
 		 1313 aa  68.9  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02060  hypothetical protein  42.35 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  29.77 
 
 		 707 aa  69.3  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  40.59 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  32.56 
 
 		 542 aa  68.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>