158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2631 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2631  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0043  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.446566  hitchhiker  0.00000163601 
 
 
-
 
NC_006368  lppt42  tRNA-Leu  92.94 
 
 		 85 bp  121  3e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt42  tRNA-Leu  91.76 
 
 		 85 bp  113  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0048  tRNA-Leu  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.496608  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0013  tRNA-Leu  89.39 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356176  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0057  tRNA-Leu  93.62 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000344559  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0037  tRNA-Leu  93.62 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  9.5451e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0024  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.622642  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0026  tRNA-Leu  93.62 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000721197  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0034  tRNA-Leu  93.62 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0056  tRNA-Leu  93.62 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000684765  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0035  tRNA-Leu  93.62 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0047  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0137479 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0017  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.777785  hitchhiker  0.00241286 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0063  tRNA-Leu  86.57 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0544  tRNA-Leu  84.15 
 
 		 82 bp  60  0.00000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1619  tRNA-Leu  84.15 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0724475  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0013  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 82 bp  58  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0001  tRNA-Leu  89.8 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.285029 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0026  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000000599691  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0021  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000206459  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t14  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0016  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0115264  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0004  tRNA-Leu  89.58 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0035  tRNA-Leu  87.27 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0731523  normal  0.959271 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0046  tRNA-Leu  85.07 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00313005  normal  0.455942 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0046  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0041  tRNA-Leu  83.72 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.272755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0040  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0022  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.806101  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS03461  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0132208  normal  0.375056 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0030  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.247975  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0074  tRNA-Leu  87.76 
 
 		 84 bp  50.1  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0008  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0100798  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1434  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.354876  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2360  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0026  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.44875e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0020  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.012052 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0076  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 82 bp  50.1  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000606872  normal  0.134188 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_BR0006  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 82 bp  50.1  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0062  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1060  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00148501  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0068  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000344448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0047  tRNA-Leu  82.72 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.398541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0024  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000365355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0089  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.846262  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0013  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00398291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0610  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0041  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000000982654  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_R0076  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.243521  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0679  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 89 bp  50.1  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2790  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 89 bp  50.1  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000401538  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2793  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 89 bp  50.1  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000950853  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2796  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 89 bp  50.1  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000297688  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0677  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 89 bp  50.1  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2476  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 89 bp  50.1  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00963424  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2479  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 89 bp  50.1  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0100128  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2482  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 89 bp  50.1  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00028015  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0068  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.000000000144281  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_R0079  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0546464 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0066  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000299649  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_R0076  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.445287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_R0084  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0386736 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0068  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000478917  normal  0.0818589 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0010  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000141712  hitchhiker  0.00444268 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0023  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1129  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.157736  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0051  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0839  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0738  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0135197  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1289  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1149  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.416978  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1298  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.199566  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1064  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1805  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0412  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.56087  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0032  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0034  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0404979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0075  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 89 bp  50.1  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000629352  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_R0080  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0018  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000323651  normal  0.27333 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0024  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000298281  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0032  tRNA-Leu  90 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.979031  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0029  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0125936  normal  0.289894 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0018  tRNA-Leu  90 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0010  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000723961  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0017  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000127557  hitchhiker  0.00355692 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0786  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0032  tRNA-Leu  90 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00179393  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0025  tRNA-Leu  90 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.579684  normal  0.318502 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0022  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0600671  normal  0.0213265 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0082  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0001  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4891  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.762047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4835  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.80579 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0027  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000640555  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>