22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2093 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_2093  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  481  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.438808  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1749  hypothetical protein  100 
 
 
288 aa  483  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.167509 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2405  hypothetical protein  90.35 
 
 
166 aa  212  4.9999999999999996e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.116798  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2035  hypothetical protein  90 
 
 
117 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0470  hypothetical protein  57.25 
 
 
168 aa  167  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0435  hypothetical protein  57.25 
 
 
168 aa  167  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.4921  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2371  hypothetical protein  72.97 
 
 
79 aa  58.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0708019  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1368  transposase, IS4 family protein  25.53 
 
 
451 aa  56.6  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0476  transposase, IS4 family protein  24.87 
 
 
484 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00134081  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0296  transposase, IS4 family protein  24.87 
 
 
484 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.600478  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2637  transposase, IS4 family protein  24.87 
 
 
484 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.523228  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1994  transposase, IS4 family protein  24.87 
 
 
484 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00936602  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1930  transposase, IS4 family protein  24.87 
 
 
484 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.410575  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1331  transposase, IS4 family protein  24.87 
 
 
484 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000223882  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0873  transposase, IS4 family protein  24.87 
 
 
484 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.446345  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2248  transposase, IS4 family protein  24.47 
 
 
484 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2903  transposase, IS4 family protein  24.47 
 
 
484 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1775  transposase, IS4 family protein  24.47 
 
 
484 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0436  transposase, IS4 family protein  24.47 
 
 
484 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0321608  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0310  hypothetical protein  24.47 
 
 
253 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0334982  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0449  transposase, IS4 family protein  24.47 
 
 
484 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2289  transposase, IS4 family protein  24.47 
 
 
484 aa  42.7  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>