More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1431 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_1431  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 
78 aa  160  5.0000000000000005e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1148  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 
78 aa  160  5.0000000000000005e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.62273  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2051  transcriptional regulator, MerR family  75.38 
 
 
158 aa  104  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2421  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  75.38 
 
 
158 aa  104  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.732276  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0478  MerR family transcriptional regulator  54.67 
 
 
146 aa  90.1  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05447  transcription regulator protein  54.79 
 
 
170 aa  84.3  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.015587 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1851  MerR family transcriptional regulator  54.79 
 
 
162 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.138506  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2831  MerR family transcriptional regulator  54.79 
 
 
175 aa  82.4  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.116752 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  52.63 
 
 
150 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4808  transcriptional regulator, MerR family  52.05 
 
 
160 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.820733 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3731  transcriptional regulator, MerR family  52.05 
 
 
160 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1678  MerR family transcriptional regulator  44.74 
 
 
132 aa  78.2  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5351  transcriptional regulator, MerR family  48 
 
 
144 aa  77.8  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0379309  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2325  MerR family transcriptional regulator  52.05 
 
 
135 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4323  MerR family transcriptional regulator  48 
 
 
146 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3461  transcriptional regulator, MerR family protein  48 
 
 
146 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  46.67 
 
 
148 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1449  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  50.68 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1657  putative transcriptional regulator  50.68 
 
 
159 aa  73.2  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00996367  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1816  transcriptional regulator, MerR family  46.67 
 
 
144 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.228936 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1402  MerR family transcriptional regulator  51.52 
 
 
133 aa  72  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4838  regulatory protein, MerR  46.67 
 
 
148 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2633  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  46.67 
 
 
162 aa  72  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1642  transcriptional regulator, MerR family  45.33 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349097  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1407  MerR family transcriptional regulator  51.52 
 
 
134 aa  72  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  46.58 
 
 
137 aa  72.8  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2809  putative transcriptional regulator, MerR family  47.95 
 
 
186 aa  72  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5283  transcriptional regulator, MerR family  45.33 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0831  MerR family transcriptional regulator  47.37 
 
 
145 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0853  MerR family transcriptional regulator  50.68 
 
 
146 aa  72  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5946  MerR family transcriptional regulator PbrR  46.58 
 
 
145 aa  72  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.543608 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1346  MerR family transcriptional regulator  42.47 
 
 
136 aa  71.2  0.000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3299  MerR family transcriptional regulator  48 
 
 
149 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16670  putative transcriptional regulator CadR  49.32 
 
 
156 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1241  MerR family transcriptional regulator  48.68 
 
 
144 aa  71.2  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2104  transcriptional regulator, MerR family  46.58 
 
 
151 aa  70.9  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2391  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  46.58 
 
 
151 aa  70.9  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0284263  normal  0.3053 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3456  MerR family transcriptional regulator  50.68 
 
 
149 aa  70.9  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5013  MerR family transcriptional regulator  46.58 
 
 
147 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5140  MerR family transcriptional regulator  46.58 
 
 
147 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3108  MerR family transcriptional regulator  45.21 
 
 
154 aa  70.1  0.000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5372  MerR family transcriptional regulator  46.67 
 
 
149 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5193  MerR family transcriptional regulator  46.58 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2173  regulatory protein, MerR  46.58 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  47.95 
 
 
137 aa  68.9  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0325  MerR family transcriptional regulator  46.58 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.634832 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46190  cadmium responsive transcriptional regulator, merR family  44 
 
 
152 aa  68.2  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.719382  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0230  MerR family transcriptional regulator  44.59 
 
 
154 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1973  MerR family transcriptional regulator  44.59 
 
 
154 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  47.22 
 
 
137 aa  68.6  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3133  MerR family transcriptional regulator  45.83 
 
 
139 aa  67.8  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.845727  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2144  MerR family transcriptional regulator  47.22 
 
 
129 aa  67.8  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000183728  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1103  MerR family transcriptional regulator  49.32 
 
 
135 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.394367  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1117  MerR family transcriptional regulator  49.32 
 
 
135 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0194  MerR family transcriptional regulator  49.32 
 
 
135 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2902  MerR family transcriptional regulator  49.32 
 
 
135 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1604  MerR family transcriptional regulator  49.32 
 
 
135 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2912  MerR family transcriptional regulator  49.32 
 
 
135 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0392  MerR family transcriptional regulator  49.32 
 
 
135 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0882  MerR family transcriptional regulator  49.32 
 
 
135 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.656142 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0220  MerR family transcriptional regulator  49.32 
 
 
135 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0894  MerR family transcriptional regulator  49.32 
 
 
135 aa  68.2  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2819  transcriptional regulator, MerR family protein  45.21 
 
 
129 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0802  transcriptional regulator, MerR family  49.3 
 
 
142 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0470  putative transcriptional regulator, MerR family  49.32 
 
 
133 aa  67.8  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4002  MerR family transcriptional regulator  49.32 
 
 
135 aa  67.8  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3676  transcriptional regulator, MerR family  47.22 
 
 
143 aa  67.4  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.511555  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0437  MerR family transcriptional regulator  49.32 
 
 
161 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  46.58 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1790  transcriptional regulator  49.32 
 
 
141 aa  66.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269282  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0178  MerR family transcriptional regulator  49.3 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0926305  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  46.58 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1336  MerR family transcriptional regulator  43.24 
 
 
146 aa  65.5  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.200551  normal  0.195494 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10060  Cu(I)-responsive transcriptional regulator, MerR family  46.58 
 
 
138 aa  65.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2256  MerR family transcriptional regulator  45.21 
 
 
144 aa  66.2  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2868  MerR family transcriptional regulator  47.76 
 
 
129 aa  65.9  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000311414  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3410  hypothetical protein  46.58 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
140 aa  65.1  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2170  transcriptional regulator, MerR family  43.06 
 
 
133 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000807108 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2343  MerR family transcriptional regulator  49.3 
 
 
146 aa  64.3  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264422  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2543  MerR family transcriptional regulator  46.38 
 
 
128 aa  63.9  0.0000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.212021  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0747  MerR family transcriptional regulator  47.89 
 
 
141 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3563  transcriptional regulator, MerR family  42.67 
 
 
157 aa  63.2  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0122  MerR family transcriptional regulator  42.47 
 
 
143 aa  62  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2470  MerR family transcriptional regulator  47.06 
 
 
138 aa  62.4  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0028  transcriptional regulator, MerR family  40.79 
 
 
143 aa  62  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.234521  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0123  MerR family transcriptional regulator  41.33 
 
 
143 aa  62  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329923  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02024  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  38.36 
 
 
138 aa  61.6  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.675487  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1155  transcriptional regulator, MerR family  46.27 
 
 
128 aa  62  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0258201  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2302  MerR family transcriptional regulator  40.79 
 
 
132 aa  62  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000169784  hitchhiker  0.000117286 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3389  MerR family transcriptional regulator  40.79 
 
 
132 aa  62  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.11439 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0113  MerR family transcriptional regulator  41.33 
 
 
143 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2538  MerR family transcriptional regulator  46.58 
 
 
157 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3303  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 
143 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1961  MerR family transcriptional regulator  43.84 
 
 
134 aa  61.6  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.778807  normal  0.944936 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0123  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 
143 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.169164  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4116  transcriptional regulator, MerR family  40.85 
 
 
133 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2149  transcriptional regulator, MerR family  39.73 
 
 
132 aa  61.2  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.705718  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2932  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 
143 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327003  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0151  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  41.1 
 
 
143 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.636208  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>