20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1159 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1159  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141825  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0071  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.584885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0051  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00133482  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1633  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.372837  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1372  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.169608  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0044  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0708961  normal  0.218252 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNALeuVIMSS1309296  tRNA-Leu  85.25 
 
 		 82 bp  50.1  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0633499 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0043  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0222956  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0079  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0650166 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0008  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0024  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0057  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0001  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.761083  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0088  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0786  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0047  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0066  tRNA-Leu  87.23 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0822521 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0062  tRNA-Leu  87.23 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000163456  normal  0.0301786 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNALeuVIMSS1309198  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.439755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0026  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.247639  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>