13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1155 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_1155  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.268031  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0067  tRNA-Arg  84.72 
 
 
76 bp  56  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.74464  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1260  tRNA-Arg  96.55 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.285329  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0023  tRNA-Arg  96.55 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0002  tRNA-Arg  96.55 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0106589  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0002  tRNA-Arg  96.55 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.318513  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0079  tRNA-Arg  96.55 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0023  tRNA-Arg  96.55 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.45343  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0045  tRNA-Arg  96.55 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1317  tRNA-Arg  96.3 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0566482  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0007  tRNA-Ser  96.15 
 
 
92 bp  44.1  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000441599  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0048  tRNA-Arg  96.15 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0048  tRNA-Arg  96.15 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>