40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0889 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0889  stability protein StbD, putative  100 
 
 		 84 aa  169  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1011  protein of unknown function DUF172  100 
 
 		 84 aa  169  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.164621  hitchhiker  0.000000000602107 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5383  prevent-host-death family protein  65 
 
 		 82 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.580876 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4837  prevent-host-death family protein  65 
 
 		 82 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4768  prevent-host-death family protein  63.1 
 
 		 82 aa  103  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3784  hypothetical protein  69.05 
 
 		 82 aa  103  7e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2257  prevent-host-death family protein  67.86 
 
 		 82 aa  103  7e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000344614  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3687  prevent-host-death family protein  70.24 
 
 		 82 aa  102  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0726516  normal  0.144685 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1587  hypothetical protein  57.14 
 
 		 82 aa  102  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0116  putative stability protein StbD  59.52 
 
 		 83 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000696013  normal  0.795005 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0154  prevent-host-death protein  57.5 
 
 		 82 aa  99.8  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.12289 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3850  prevent-host-death family protein  53.75 
 
 		 82 aa  94.4  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000226334 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0822  hypothetical protein  54.76 
 
 		 82 aa  94  6e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.556624  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4184  hypothetical protein  53.57 
 
 		 83 aa  90.5  7e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4315  hypothetical protein  60.87 
 
 		 83 aa  90.1  9e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.135355  hitchhiker  0.0025912 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0318  prevent-host-death family protein  51.19 
 
 		 84 aa  89.7  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.07108  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1722  putative stability protein StbD  53.57 
 
 		 82 aa  87.8  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.139428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1656  putative stability protein StbD  53.57 
 
 		 82 aa  87.8  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1618  putative stability protein StbD  53.57 
 
 		 82 aa  87.8  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.602129  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1470  hypothetical protein  53.57 
 
 		 82 aa  85.5  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.279233  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00612  hypothetical protein  51.32 
 
 		 74 aa  79.7  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.2401  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44990  Prevent-host-death family protein  50 
 
 		 81 aa  75.1  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0795  hypothetical protein  43.75 
 
 		 90 aa  73.9  0.0000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.56654  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0003  antitoxin of toxin-antitoxin stability system, StbD family  53.23 
 
 		 83 aa  73.6  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1120  prevent-host-death protein  41.25 
 
 		 83 aa  72.8  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0992738  normal  0.192067 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1265  StbD-like prevent host death protein  41.25 
 
 		 83 aa  72.8  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.130432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3832  prevent-host-death protein  46.25 
 
 		 81 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2438  prevent-host-death family protein  42.5 
 
 		 81 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0146525  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0090  hypothetical protein  44.59 
 
 		 83 aa  66.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.376643  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2747  prevent-host-death family protein  41.25 
 
 		 83 aa  59.7  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4547  prevent-host-death family protein  39.74 
 
 		 81 aa  58.2  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0245  prevent-host-death family protein  37.5 
 
 		 83 aa  56.2  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3375  prevent-host-death family protein  34.21 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1651  prevent-host-death protein  38.75 
 
 		 83 aa  52.4  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.490993 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0709  hypothetical protein  37.5 
 
 		 83 aa  52.8  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0955  protein of unknown function DUF172  36.25 
 
 		 83 aa  51.6  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2498  hypothetical protein  42.86 
 
 		 81 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4212  hypothetical protein  52.5 
 
 		 127 aa  47.8  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1554  prevent-host-death family protein  40.82 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.358539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0286  putative antitoxin of the YafO-YafN toxin-antitoxin system  33.33 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.906881  normal  0.323322 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>