32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0870 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_0870  addiction module toxin, Txe/YoeB family  100 
 
 
87 aa  181  4.0000000000000006e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0995  addiction module toxin, Txe/YoeB family  100 
 
 
87 aa  181  4.0000000000000006e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000552996 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0045  addiction module toxin, Txe/YoeB family  81.61 
 
 
87 aa  153  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0074  addiction module toxin, Txe/YoeB family  72.41 
 
 
87 aa  143  9e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1786  addiction module antitoxin  67.82 
 
 
87 aa  136  8.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2607  addiction module antitoxin  62.35 
 
 
86 aa  122  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1444  addiction module antitoxin  59.77 
 
 
88 aa  121  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2963  addiction module antitoxin  82.93 
 
 
82 aa  117  7e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2262  addiction module antitoxin  56.32 
 
 
87 aa  114  5e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1792  addiction module toxin, Txe/YoeB family  49.41 
 
 
86 aa  101  4e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00863649  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1546  addiction module toxin, Txe/YoeB family  41.67 
 
 
83 aa  75.9  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2483  addiction module antitoxin  36.36 
 
 
88 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000373536  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2532  addiction module antitoxin  36.36 
 
 
88 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000423523  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1443  addiction module toxin, Txe/YoeB family  33.33 
 
 
92 aa  50.4  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.403552  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1069  addiction module antitoxin  54.76 
 
 
87 aa  47.4  0.00007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0150746  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0408  addiction module antitoxin  35 
 
 
86 aa  45.4  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2478  addiction module toxin, Txe/YoeB family  30.23 
 
 
84 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3630  addiction module toxin, Txe/YoeB family  30.23 
 
 
84 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1700  addiction module antitoxin  40.68 
 
 
88 aa  44.3  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0703  addiction module toxin, Txe/YoeB family  40.68 
 
 
233 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.564313  normal  0.609374 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1311  plasmid stabilization system protein  30.38 
 
 
93 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.648885  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1930  addiction module toxin, Txe/YoeB  34.72 
 
 
93 aa  43.5  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2586  addiction module toxin, Txe/YoeB family  29.89 
 
 
93 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2859  addiction module toxin, Txe/YoeB family  44.07 
 
 
86 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.141742 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1914  addiction module toxin, Txe/YoeB family  34.18 
 
 
97 aa  42.4  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.197828  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2939  hypothetical protein  34.94 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5886  addiction module antitoxin  37.29 
 
 
85 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5486  addiction module toxin, Txe/YoeB  37.29 
 
 
85 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.617612 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4647  addiction module toxin, Txe/YoeB family  39.66 
 
 
87 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00453645  normal  0.644511 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1844  hypothetical protein  39.66 
 
 
86 aa  41.2  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.891967  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1753  addiction module antitoxin  41.67 
 
 
88 aa  40.8  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.709667  normal  0.0794356 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13394  hypothetical protein  40.35 
 
 
85 aa  40  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0756561 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>