21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0634 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0634  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit IV  100 
 
 		 118 aa  238  1e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0937354  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0784  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  238  1e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00308528  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4049  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit IV  27.93 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.164785  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1785  ubiquinol oxidase, subunit IV  28.97 
 
 		 110 aa  47  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0600  ubiquinol oxidase, subunit IV  28.04 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2836  ubiquinol oxidase, subunit IV  28.04 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2414  ubiquinol oxidase, subunit IV  28.04 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.576225  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2876  ubiquinol oxidase, subunit IV  28.04 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.75136  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2717  ubiquinol oxidase, subunit IV  28.04 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.187776  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2775  ubiquinol oxidase, subunit IV  28.04 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.214236  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1726  ubiquinol oxidase, subunit IV  28.04 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.668264  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1741  cytochrome ubiquinol oxidase subunit IV  26.96 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.148517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3272  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit IV  28.57 
 
 		 110 aa  44.7  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1040  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit IV  28.57 
 
 		 110 aa  44.7  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0716905  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1093  hypothetical protein  38.39 
 
 		 122 aa  42.7  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3454  cytochrome C oxidase subunit IV  27.1 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3076  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit IV  26.79 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.137735  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4893  cytochrome C oxidase subunit IV  29.59 
 
 		 130 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1634  CyoD  27.03 
 
 		 110 aa  41.2  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0123557  normal  0.142512 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2885  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit IV  25.71 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5732  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit IV  26.92 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289896  hitchhiker  0.00723652 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>