More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_4198 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_4198  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  100 
 
 
260 aa  480  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00333421  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4171  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  98.46 
 
 
260 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4055  indole-3-glycerol phosphate synthase  95.77 
 
 
260 aa  350  2e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0373  indole-3-glycerol-phosphate synthase  84.44 
 
 
259 aa  292  3e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.21845 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2798  indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.21 
 
 
265 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.812151  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0754  indole-3-glycerol phosphate synthase  48.45 
 
 
265 aa  220  1.9999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.297551 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2966  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.15 
 
 
274 aa  218  5e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0215924  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2195  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.83 
 
 
273 aa  218  1e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3582  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  57.36 
 
 
263 aa  216  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.433048  normal  0.034535 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3397  indole-3-glycerol-phosphate synthase  55.65 
 
 
267 aa  214  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3236  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.81 
 
 
265 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1639  indole-3-glycerol phosphate synthase  48.64 
 
 
271 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2048  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.64 
 
 
266 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.09 
 
 
269 aa  212  3.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12880  indole-3-glycerol phosphate synthase  55.02 
 
 
273 aa  212  3.9999999999999995e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.315308  normal  0.0294244 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20750  indole-3-glycerol phosphate synthase  52.8 
 
 
270 aa  212  4.9999999999999996e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.600467  normal  0.621032 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1251  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.38 
 
 
270 aa  211  1e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0756  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.3 
 
 
266 aa  210  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2494  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.78 
 
 
266 aa  210  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.141997  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1339  indole-3-glycerol phosphate synthase  54.66 
 
 
259 aa  210  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.419917  normal  0.796071 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1252  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.94 
 
 
269 aa  206  3e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2466  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.97 
 
 
272 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00979183  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2858  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.81 
 
 
269 aa  205  5e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0174  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.39 
 
 
257 aa  205  6e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2567  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.86 
 
 
271 aa  205  7e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0720427  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3172  indole-3-glycerol-phosphate synthase  59.6 
 
 
286 aa  204  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.291676 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2829  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.36 
 
 
265 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.232078  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2247  indole-3-glycerol phosphate synthase  49.42 
 
 
267 aa  203  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.835264  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2939  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.38 
 
 
269 aa  203  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3173  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.69 
 
 
265 aa  203  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.568636 
 
 
-
 
NC_004310  BR1141  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.69 
 
 
268 aa  203  3e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1156  indole-3-glycerol phosphate synthase  48.25 
 
 
260 aa  203  3e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.721483  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2024  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.84 
 
 
262 aa  202  4e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2509  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  51 
 
 
269 aa  202  5e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1232  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.54 
 
 
270 aa  201  7e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0182595  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2048  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.25 
 
 
269 aa  201  7e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0288886  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3067  indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.82 
 
 
272 aa  201  7e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.285409  normal  0.207369 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3801  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.35 
 
 
295 aa  201  7e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3051  indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.82 
 
 
272 aa  201  7e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.82 
 
 
272 aa  201  7e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.475678  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3218  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  55.02 
 
 
269 aa  201  8e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0577102  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1100  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.3 
 
 
268 aa  201  9.999999999999999e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3076  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.72 
 
 
269 aa  201  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000445652  hitchhiker  0.0000898073 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2798  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.21 
 
 
265 aa  201  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.822714  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2139  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.06 
 
 
263 aa  201  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.248459  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1566  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.12 
 
 
263 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1409  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.19 
 
 
271 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.827257  normal  0.309445 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1986  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.4 
 
 
270 aa  198  6e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5702  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.75 
 
 
271 aa  198  6e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344478  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1254  Indole-3-glycerol phosphate synthase  46.33 
 
 
259 aa  198  7e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1931  indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.41 
 
 
268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.535725 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1274  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.35 
 
 
259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4375  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.81 
 
 
263 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.893043  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2990  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.9 
 
 
272 aa  197  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.508852  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1734  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.45 
 
 
268 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2497  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.15 
 
 
271 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0317819  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0733  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.39 
 
 
266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1306  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.84 
 
 
262 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3600  indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.41 
 
 
272 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1952  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.92 
 
 
261 aa  196  2.0000000000000003e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0048932  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1436  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.08 
 
 
258 aa  196  3e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.567597  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1215  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.2 
 
 
271 aa  196  3e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.783684  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1650  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.62 
 
 
262 aa  196  3e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3175  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.6 
 
 
268 aa  196  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504045  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.9 
 
 
266 aa  196  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1138  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.77 
 
 
269 aa  196  3e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.69839 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5135  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.9 
 
 
285 aa  196  3e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0596485 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2358  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.8 
 
 
268 aa  196  3e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2778  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.81 
 
 
262 aa  196  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000331448  hitchhiker  0.0000255859 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2300  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.81 
 
 
273 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0956436  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4483  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.08 
 
 
272 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.249423  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1499  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.21 
 
 
275 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0519  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.69 
 
 
258 aa  195  5.000000000000001e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1926  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.27 
 
 
296 aa  195  5.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4672  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.51 
 
 
285 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2587  indole-3-glycerol phosphate synthase  46.69 
 
 
265 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.804047  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0503  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.36 
 
 
276 aa  194  8.000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3845  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.7 
 
 
271 aa  195  8.000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0606  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.69 
 
 
258 aa  194  9e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.64209  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0870  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.59 
 
 
295 aa  194  9e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.474663  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.96 
 
 
259 aa  194  1e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5576  Indole-3-glycerol phosphate synthase  47.47 
 
 
288 aa  194  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513944  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1733  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.53 
 
 
281 aa  193  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.582058  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5212  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.9 
 
 
285 aa  192  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69886  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1877  indole-3-glycerol phosphate synthase  44.36 
 
 
266 aa  193  3e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.597244  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3169  indole-3-glycerol phosphate synthase  41.51 
 
 
297 aa  192  3e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.119969 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3718  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.67 
 
 
264 aa  193  3e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0881817  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2380  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.84 
 
 
266 aa  192  4e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.446118  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2079  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.42 
 
 
272 aa  192  4e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2816  indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.61 
 
 
272 aa  192  4e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.07226  normal  0.927217 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0269  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.47 
 
 
268 aa  192  5e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000502728  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0731  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.02 
 
 
263 aa  192  6e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.374579  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3027  indole-3-glycerol phosphate synthase  54.41 
 
 
260 aa  192  6e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3293  indole-3-glycerolphosphate synthase  41.7 
 
 
261 aa  191  7e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0358334 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3554  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.62 
 
 
266 aa  191  8e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2627  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.96 
 
 
293 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236975  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0594  indole-3-glycerol phosphate synthase  47.1 
 
 
278 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3489  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.96 
 
 
293 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2465  indole-3-glycerol phosphate synthase  46.4 
 
 
271 aa  191  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1063  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.77 
 
 
271 aa  190  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.493253  normal  0.0834035 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>