141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1931 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2032  TPR repeat-containing protein  95.39 
 
 
695 aa  1097    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0472068  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1846  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  92.81 
 
 
695 aa  1095    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.112303  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1931  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 
695 aa  1281    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00441164  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1777  TPR repeat-containing protein  63 
 
 
710 aa  655    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.167464 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.51 
 
 
810 aa  78.2  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.2 
 
 
878 aa  73.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  38 
 
 
673 aa  71.2  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000776603  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0595  TPR repeat-containing protein  29.19 
 
 
795 aa  67.4  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  28.64 
 
 
725 aa  65.1  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.05 
 
 
632 aa  65.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  27.45 
 
 
847 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3198  TPR repeat-containing protein  28.63 
 
 
645 aa  60.8  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3927  cellulose synthase subunit BcsC  30.25 
 
 
1160 aa  60.5  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  31.44 
 
 
4079 aa  60.5  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  30 
 
 
397 aa  58.2  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  31.27 
 
 
1094 aa  57.8  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3718  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.04 
 
 
616 aa  56.6  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.12 
 
 
818 aa  55.8  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0599  TPR repeat-containing protein  34.36 
 
 
748 aa  55.8  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.709055 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3814  TPR repeat-containing protein  28.93 
 
 
615 aa  55.1  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  23.74 
 
 
561 aa  54.3  0.000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  23.74 
 
 
561 aa  54.3  0.000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  29.76 
 
 
792 aa  53.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  29.33 
 
 
643 aa  52.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  30.34 
 
 
1069 aa  52.8  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  29.54 
 
 
4489 aa  52.8  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  24.29 
 
 
1138 aa  52.4  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  27.19 
 
 
1694 aa  52  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.45 
 
 
639 aa  52.4  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.76 
 
 
784 aa  52  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4326  TPR repeat-containing protein  29.28 
 
 
790 aa  51.6  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  32.22 
 
 
626 aa  51.2  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2252  TPR repeat-containing protein  26.38 
 
 
954 aa  50.8  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  23.3 
 
 
1252 aa  50.8  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  23.3 
 
 
1252 aa  50.8  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03378  cellulose synthase subunit  28.05 
 
 
1157 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0183  cellulose synthase operon C domain protein  28.05 
 
 
1157 aa  50.4  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03331  hypothetical protein  28.05 
 
 
1157 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  31.11 
 
 
626 aa  50.4  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  28.65 
 
 
221 aa  50.1  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  36.81 
 
 
767 aa  50.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4895  cellulose synthase subunit BcsC  28.05 
 
 
1157 aa  50.4  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  22.74 
 
 
1486 aa  50.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  31.11 
 
 
614 aa  50.1  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  31.11 
 
 
614 aa  50.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 
614 aa  50.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  26.22 
 
 
615 aa  50.4  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4018  cellulose synthase subunit BcsC  28.05 
 
 
1140 aa  50.4  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0187  cellulose synthase subunit BcsC  28.05 
 
 
1157 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.865635  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3839  cellulose synthase subunit BcsC  28.05 
 
 
1157 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.503197 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
715 aa  50.4  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  31.11 
 
 
626 aa  49.7  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 
689 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 
614 aa  49.3  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 
614 aa  49.3  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0693  TPR repeat-containing protein  21.79 
 
 
395 aa  49.3  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0712051  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1011  TPR repeat-containing protein  32.28 
 
 
800 aa  49.7  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.926102  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  30.18 
 
 
615 aa  49.7  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  33.02 
 
 
828 aa  48.9  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  31.65 
 
 
3560 aa  48.9  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  27.3 
 
 
3035 aa  48.9  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  25.08 
 
 
622 aa  48.9  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  30.2 
 
 
764 aa  49.3  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  36.09 
 
 
766 aa  48.9  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 
594 aa  48.5  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  33.16 
 
 
1406 aa  48.5  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2812  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.59 
 
 
1838 aa  48.5  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.4844  normal  0.543205 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 
620 aa  48.5  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3772  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 
562 aa  48.9  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0484  TPR repeat-containing protein  25.13 
 
 
435 aa  48.1  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3992  cellulose synthase subunit BcsC  28.57 
 
 
1180 aa  48.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.416047 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  25.96 
 
 
1276 aa  47.8  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.88 
 
 
645 aa  48.1  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000607684  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  30.73 
 
 
566 aa  47.8  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  23.67 
 
 
3172 aa  47.8  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.96 
 
 
1056 aa  47.8  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  26.98 
 
 
827 aa  47.8  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  21.33 
 
 
927 aa  47.4  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  24.62 
 
 
576 aa  47.8  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  27.64 
 
 
587 aa  47.4  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0947  TPR repeat-containing protein  28.4 
 
 
556 aa  47.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4301  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.28 
 
 
363 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.124533 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  24.61 
 
 
1737 aa  47.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4239  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.28 
 
 
363 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  35.64 
 
 
632 aa  47.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2470  TPR repeat-containing protein  32.52 
 
 
581 aa  46.6  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.31 
 
 
836 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  23.53 
 
 
795 aa  46.2  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3811  cellulose synthase subunit BcsC  28.57 
 
 
1172 aa  46.2  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.805678 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  25.08 
 
 
486 aa  46.2  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  30.26 
 
 
686 aa  46.6  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3073  TPR repeat-containing protein  28.39 
 
 
886 aa  45.8  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0207  TPR repeat-containing protein  31.07 
 
 
796 aa  46.2  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.488535  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  27.08 
 
 
545 aa  46.2  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1823  TPR repeat-containing protein  32.61 
 
 
213 aa  46.6  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1273  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 
879 aa  46.6  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3932  cellulose synthase subunit BcsC  27.73 
 
 
1150 aa  46.2  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.903843  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0616  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.09 
 
 
647 aa  46.2  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.1691e-34 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3824  cellulose synthase subunit BcsC  28.57 
 
 
1150 aa  46.2  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.61 
 
 
557 aa  46.2  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>