43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0269 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0269  RDD domain containing protein  100 
 
 		 333 aa  608  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00578779  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0258  RDD domain containing protein  94.01 
 
 		 334 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236349  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0248  RDD  84.02 
 
 		 341 aa  344  1e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0658172  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0269  RDD domain-containing protein  54.7 
 
 		 317 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.194271 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1148  RDD domain containing protein  49.23 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00101829  hitchhiker  0.000000000000525817 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3590  RDD domain containing protein  43.21 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0170  RDD domain-containing protein  41.27 
 
 		 145 aa  58.5  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000534855  decreased coverage  0.00967799 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0678  RDD domain-containing protein  42.55 
 
 		 157 aa  58.5  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.416032  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1706  RDD  30.14 
 
 		 170 aa  57.4  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.305495  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0075  RDD domain-containing protein  43.94 
 
 		 185 aa  53.9  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0306278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1223  RDD domain containing protein  46.97 
 
 		 202 aa  53.1  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4396  RDD  36.9 
 
 		 162 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327978 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1054  RDD  33.96 
 
 		 138 aa  52.4  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0171  RDD domain-containing protein  38.24 
 
 		 140 aa  52.4  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652856  decreased coverage  0.0096302 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0505  conserved hypothetical protein, RDD family  36.67 
 
 		 152 aa  51.2  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2503  hypothetical protein  37.5 
 
 		 264 aa  50.4  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2609  serine/threonine protein kinase  28.92 
 
 		 415 aa  50.4  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.101255 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3753  RDD domain containing protein  41 
 
 		 285 aa  50.1  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3524  RDD domain-containing protein  37.68 
 
 		 165 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.352555 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3843  RDD domain containing protein  41.58 
 
 		 229 aa  48.9  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0598  RDD domain containing protein  34.83 
 
 		 151 aa  48.1  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0277  RDD domain containing protein  30.82 
 
 		 217 aa  47  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.666159  normal  0.0986894 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14520  hypothetical protein  34.23 
 
 		 165 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0399  RDD domain-containing protein  30.53 
 
 		 278 aa  46.6  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0177068 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4234  RDD domain-containing protein  37.68 
 
 		 162 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0098  RDD domain containing protein  31.51 
 
 		 204 aa  46.2  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0984  RDD domain containing protein  29.73 
 
 		 162 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0396  RDD  30.33 
 
 		 196 aa  45.8  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.476249  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3078  hypothetical protein  38.82 
 
 		 406 aa  45.8  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0989  RDD domain-containing protein  29.73 
 
 		 162 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00320129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1422  RDD domain-containing protein  28.57 
 
 		 257 aa  45.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176176  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1021  RDD domain-containing protein  29.73 
 
 		 162 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.579963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1285  hypothetical protein  34.23 
 
 		 165 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0446  hypothetical protein  36.25 
 
 		 194 aa  44.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2772  RDD domain containing protein  45.71 
 
 		 184 aa  44.3  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.091609  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  28.97 
 
 		 270 aa  44.3  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4051  RDD domain containing protein  43.04 
 
 		 288 aa  44.3  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0425  RDD protein  32.14 
 
 		 149 aa  43.9  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0542  RDD family protein  30.49 
 
 		 216 aa  43.5  0.005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3583  MJ0042 family finger-like protein  26 
 
 		 295 aa  43.5  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040814  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11690  RDD domain-containing membrane protein  36.23 
 
 		 141 aa  43.1  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.270076  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4968  YxaI  38.46 
 
 		 77 aa  42.7  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3447  RDD domain-containing protein  38.04 
 
 		 254 aa  42.7  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>