More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0108 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0108  histidine kinase  100 
 
 
472 aa  897    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.107508  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0090  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  88.79 
 
 
472 aa  701    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0097  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  98.31 
 
 
472 aa  882    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3100  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.07 
 
 
476 aa  123  9e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.718748 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 
810 aa  119  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1209  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 
475 aa  111  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.07 
 
 
885 aa  109  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5673  two-component regulatory system sensory histidine kinase  34.39 
 
 
462 aa  107  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5476  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 
782 aa  103  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1802  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 
456 aa  103  7e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43120  periplasmic sensory histidine protein kinase  30.38 
 
 
830 aa  102  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2486  histidine kinase  30.14 
 
 
347 aa  101  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0268  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 
764 aa  101  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0862951 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4311  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 
1291 aa  100  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4664  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.35 
 
 
413 aa  100  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.68 
 
 
1162 aa  100  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.19 
 
 
944 aa  100  8e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1560  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 
504 aa  99.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0452  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33 
 
 
477 aa  99.4  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6269  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 
504 aa  99.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.131733  normal  0.543189 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0488  transmembrane sensory transduction histidine kinase for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  34.6 
 
 
465 aa  99  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.637109  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2314  histidine kinase  32.21 
 
 
487 aa  98.6  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.421015  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2916  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 
576 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1010  histidine kinase  29.36 
 
 
572 aa  98.6  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0817847 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2503  two-component regulatory protein sensor kinase  33.33 
 
 
906 aa  98.6  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1928  histidine kinase  30.47 
 
 
357 aa  98.2  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1955  histidine kinase  30.47 
 
 
357 aa  98.2  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 
1010 aa  98.2  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0547  histidine kinase  32.34 
 
 
527 aa  97.4  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0737  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 
408 aa  97.8  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000118464  decreased coverage  0.00150782 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0956  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.02 
 
 
600 aa  97.4  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4250  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 
969 aa  97.4  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.356606  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1375  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 
490 aa  97.1  7e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1915  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  21.22 
 
 
463 aa  96.7  8e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000195525  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4693  histidine kinase  27.57 
 
 
561 aa  96.7  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.77 
 
 
597 aa  96.7  8e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6289  histidine kinase  27.25 
 
 
463 aa  96.7  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0135333  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 
592 aa  96.7  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.130733  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2621  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 
610 aa  96.3  9e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.272408  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0030  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 
460 aa  96.3  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.292632  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0219  histidine kinase  31.44 
 
 
1166 aa  96.3  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.803779  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5316  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.45 
 
 
1069 aa  96.3  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.72275  normal  0.481403 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2811  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 
829 aa  96.3  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3102  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29 
 
 
1211 aa  96.3  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3690  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.62 
 
 
833 aa  96.3  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0862317  normal  0.782884 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4555  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 
406 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.330139  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5118  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.08 
 
 
837 aa  95.9  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
458 aa  95.1  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1712  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.04 
 
 
1173 aa  95.5  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0980923  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3277  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  28.96 
 
 
741 aa  95.1  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72390  putative two-component sensor  34.09 
 
 
595 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2989  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 
585 aa  95.1  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.461641 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0612  sensor histidine kinase  34.39 
 
 
467 aa  94.7  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3793  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.31 
 
 
664 aa  95.1  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.191798 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3781  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 
592 aa  94.7  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233259  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3123  histidine kinase  32.89 
 
 
356 aa  94.7  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0149  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 
593 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3167  signal transduction histidine kinase-like protein  30.48 
 
 
1077 aa  94.7  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0540842 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0654  two component sensor histidine kinase transcription regulator protein  31.95 
 
 
466 aa  94.4  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.688778 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4744  sensor histidine kinase  28.45 
 
 
368 aa  94.4  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4582  sensor histidine kinase  28.45 
 
 
368 aa  94.4  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.24147  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 
584 aa  94.4  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5105  sensor histidine kinase  28.45 
 
 
368 aa  94.4  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4892  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.2 
 
 
700 aa  94.4  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.941332 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.82 
 
 
640 aa  94.4  5e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.1 
 
 
639 aa  94  6e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4258  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.31 
 
 
663 aa  93.6  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.267585 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 
584 aa  94  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0985  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.94 
 
 
597 aa  93.6  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0752971 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1037  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.71 
 
 
793 aa  93.6  8e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0839  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.88 
 
 
1207 aa  93.2  8e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1810  PAS sensor protein  27.23 
 
 
829 aa  93.2  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000473758 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 
396 aa  93.6  8e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3041  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.35 
 
 
873 aa  93.2  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616698  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1904  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.77 
 
 
932 aa  93.6  8e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.636099  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0102  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.32 
 
 
763 aa  93.2  9e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
471 aa  93.2  9e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 
597 aa  92.8  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0613  sensor histidine kinase  33.94 
 
 
467 aa  92.8  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.639539  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4312  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 
640 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4834  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 
770 aa  92.8  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1750  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  27.22 
 
 
463 aa  92.8  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2775  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 
431 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.163384  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 
634 aa  93.2  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.125308  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0336  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 
612 aa  92.8  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.84228  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2265  histidine kinase  31.6 
 
 
429 aa  92.8  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.19602  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0448  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 
536 aa  92.8  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.231273  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2939  histidine kinase  33.97 
 
 
447 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.012617 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4195  histidine kinase  27.57 
 
 
592 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.445902  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0196  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 
556 aa  93.2  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0666549 
 
 
-
 
NC_004310  BR0616  sensory box histidine kinase  26.29 
 
 
783 aa  92.4  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.260748  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6209  histidine kinase  32 
 
 
343 aa  91.7  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3284  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.54 
 
 
856 aa  92.4  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0250894  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5667  histidine kinase  29.57 
 
 
1140 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0615  sensory box histidine kinase  26.29 
 
 
783 aa  92.4  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5724  two-component regulatory system sensory histidine kinase  29.8 
 
 
784 aa  92.4  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1269  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
416 aa  92  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.906191  normal  0.151074 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1781  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 
465 aa  92  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.639681  normal  0.950825 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0660  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 
461 aa  92.4  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2149  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.58 
 
 
680 aa  92  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>