| Gene Information Plasmid Coverage information Fosmid Coverage information Sequence |
Gene Information |
| Locus tag | BbuZS7_0422 |
|---|
| Symbol | |
|---|
| ID | 7106369 |
|---|
| Type | CDS |
|---|
| Is gene spliced | No |
|---|
| Is pseudo gene | No |
|---|
| Organism name | Borrelia burgdorferi ZS7 |
|---|
| Kingdom | Bacteria |
|---|
| Replicon accession | NC_011728 |
|---|
| Strand | - |
|---|
| Start bp | 429959 |
|---|
| End bp | 434443 |
|---|
| Gene Length | 4485 bp |
|---|
| Protein Length | 1494 aa |
|---|
| Translation table | 11 |
|---|
| GC content | 26% |
|---|
| IMG OID | 643477844 |
|---|
| Product | putative sensory transduction histidine kinase |
|---|
| Protein accession | YP_002374934 |
|---|
| Protein GI | 218249593 |
|---|
| COG category | [T] Signal transduction mechanisms |
|---|
| COG ID | [COG0642] Signal transduction histidine kinase |
|---|
| TIGRFAM ID | |
|---|
| 
|
Plasmid Coverage information |
| Num covering plasmid clones | 6 |
|---|
| Plasmid unclonability p-value | 1 |
|---|
| Plasmid hitchhiking | No |
|---|
| Plasmid clonability | normal |
|---|
| |
Fosmid Coverage information |
| Num covering fosmid clones | n/a |
|---|
| Fosmid unclonability p-value | n/a |
|---|
| Fosmid Hitchhiker | n/a |
|---|
| Fosmid clonability | n/a |
|---|
| |
Sequence |
| Gene sequence | ATGAAAAAAG CAAACTTTTT AAGTACTAAT TTTTTAATTT TACTTTTGGT TTGCTTTGTC
AACGTCAATT TATTTTCTAA GGATATTTTC AAGTTTAAGC TTGTAGATCA ATTTTTTCCT
TTTTACTACA AGAATAATAA AGGAGAATAT GAAGGACTTA TTTTTTCTAT TTTAGATAAA
TGGGCAAAAG ATAATAATGC TGATATTATG GTTGAGCATA TTGATAATTT AAATGAAAGT
GAAATTGAAG ACGAAGCAAT ATATTTAGGA TTAACTTATA ATGTAAAATT AAATGATTTT
TTTTATTTTA AAAGTGAGCT TGCTAGGAGT ATTTCAATTT TATTTTTTAA AAACTCTAAT
AAAAAATATA AAAATACCCA TTCAACATTT TTATCCAATT TTAATATAGG AGTTATTAAA
AATACAATAT ATGAAGATAT CTTAAGGTTA AAAAACGTTA ACACCATTTT TTTGGCTGAT
AATTCTCAAG AGTTAGTATT GGCCTTAAAA AACGATAAAG TTGATTATAT ATATGGTGAT
TGCAAGACTT TACATTATAT TGCAAATAAC TTTTTAAGTG AAGATCTTGT GATTTTTACC
GGGGATGTTT TTTATAGTAT CAAAAATAGA GTGGCTATTA GTAGAAATGC TCCTGAGATA
GTAAAGAATT TGAATTTAGA TTTGTTTTCA TATTTAATGA AAATGCCTGA GGAACTTGTT
TTTTCTTTTT TAGATAGCAA TGCTAAGGGA AGTTTTGTTG ATGTTGGTTT ATATAATGAT
TATCCTCCTT TAAGTTTTAT TAATTCACAG GGAAAATTGT CTGGCATTTT AGTGGATTTG
TGGAATCTTC TCTCAAGACA ACATATCTTT AAACCTATTT TTAAGGGATT TTCCAAAGAG
GATATTAAGA AATCATTAGA TGGAAAATCA GTAGGTATTT TTGGAGGAAT TATTAGCAAT
GATAGTGTAT TGGAAAATGT TAATTATGTA GTAAGTAAGC CAATATATCC TCTTAATTTT
AAATTTTATT CTAAAGACCT AAGCAATGAT GCTGGTCCAA TAAATTCTCA GTTTATTGAT
TTTAATTTTA ATAATATTCA ATTAAATAAG AATAAAGATA TTGTTAATAA CTTTATAGAT
ATTGTTAATA ATTCATATGG GTTTATAGAA AATTCAATAA CAACAAAATA TTTGTTAAAA
TTAAATGGAT ATAACGGTAG ATTAAAATCT TACGATTCGA TTTTTAATAA AAATAGGTTT
TTAGTATTAG CCATTGATAA TAGGATTTAT AAGGTTATTA AATATATTCT CAATTCTATA
TTTGATGATA TTTCATTTGA ATCTTTGCTT CAAATAGATA AAAATTGGTT GGATAAAGAA
GAGATTAATA GTTCTAGAAT AAATAGTTAT AAAATTATGA ATAAGGTTAA ATTTAATATA
GAAGAAAAAA TTTGGTTATC AAAAAATAAT AAATTAAATC TTGCTGTTAA AAATTGGTAT
CCAATAGATT ATGTTGAGGC AAATAATTAT AAAGGAATAA ATCAATTTTT GCTTGATAAG
ATTAGAATGT TTTCAGGTTT GAGATTTAAC ATAATTAAAG TACACAGCAG TTTAGATCTT
AAAAAATTAA TCAAATCTGG AAAAATCGAT ATGCTAAATA CTAATGCAAC CGATTCAAAT
TTAGATAATG TTTTCAACAT AAAATTAAAT TCTCGAATTC CACTTTATAT TTTTTCAAAT
AAGAAAAGGG TGCTTCCATC TAGATCTTTA GAAAAGTTTG CTATACTTGA TTTTTTATAT
AGTAAAAATT TGGCTTCTAA TATTAAATCA AAGCTTATTC TGGTAAGCAG TTTTAATGAA
GCGTTGCTTC TTCTTTATAA GGGAAAGGTA GATGGGATTA TTAGCGATGA GTATACAGCT
GCTGCTGTTT TTGAGGAATT AAATATTGAT GATGTTGAAA AAATTCCTAC TTTTAGAGAT
TTGGCTTTTG ATTTGAGTCT TGCTATTTAT AATCAAGATT ATATCTTGAA AGAAATTATT
CAAAAAGTTG TTATGCGTTC AAATGTTGAC AGTCAGATGT ATTTAAATGA TTGGAAATTT
GATATTTATT ATAAATCCAG AAGTATCAGG TTTAAAAATT TCAAATTTTT AGTGATAACA
TTCATTATAT TTTATTTTAC TTTTTTAGGA TTTGTAATTA TATTTATGTT CAGATTATCA
TTTGAGCAGA AAAGAAGATA TTCTTTTGTG ATGAATGAAA AAAAGATTGC GGAAGCCGCT
AATGCTGCTA AAACCATTTT TATAGCCAAT GTCAGTCATG ATATTCGTAC CCCTATTAAC
GGAATAATGG CGGCTACTGA GCTTTTGGAT ACAACTATTC TTACAGATGT TCAAAAAGAT
TATGTTAGGA TGATAAATTA TTCATCTGAT TCTTTGCTTT CTTTAATTGA TGATATATTG
TATTTGTCTA AAATAGATGT CAATGAATTA TATGTTGAGA GTCAAGAGAT TGATTTAGAG
AGTGAAATGG AAATGGTTTT AAAAGCTTTT CAATCTCAAT GTGCAAAGAA AAATATTGAT
TTATTCTCTT ATTCTAAATC TATTTTTAAT AATTATATAA AGGGTGATAT TGTAAAAATT
AAACAAGTTT TAATTAATTT AATAGGAAAT GCTTTTAAGT TTACAGATGA TGGTGTTATT
GTTTTAAATT ATGAAGAAGT ATGTAGAACA AGAACTGATG GTAATAGGGT TTTGGTTACA
GTTGAATTTA AGGTAATAGA TACAGGCAAA GGGATTGAAA AAGAAAATTT TTCTAAGATA
TTTGAAATAT TTAAACAAGA GGATGATTCT TCTTCAAGGG TTCATGAAGG TGCAGGATTG
GGATTGTCAA TATCTAGAGA GCTTATAAGA CTAATGGGTG GTCTTGGTAT TGCTGTTGAT
AGCAAGGTGG GAGAGGGTAC AACTTTTTCA TTTATGTTGC CCTTTTTATT GGGTAGTGAG
CTTAAAAGTA AAAAATTGTC AATCAATAGA TTTCAATCAG TAAATGGTGA CAATAAAGTA
TTAAATGTGC TTTTAAGTCA AAAATCTATT AAAATTTTTG AGCACTGTTC GATTTTATTG
GGATGCTCTT CTAATGTGCG CTATGTAGCG TCTTTTGAGG ATGCTTATAA AGTCTTCAAG
AAATACCCTT CTTATAATTT TGTTTATATA AATGTAAATA ACGATAATAT TCAAGAGGGT
ATTCGACTTG CCAATAATAT TGAAAGACTA AATTCTGATG TACAAATTAT TTTTTTATTT
TATTATTTAG ATAATAAAGC TCTAAAAAAT TTAAAATATG GTTATGTTAA AAAGCCTTTA
ATGGGGCTTG GTATATGCTC TATTCTTTAT AAAAAAGAGT TTAACCCAGA AATGGATTTT
GAGGATTTGG TTCCAATAGA TAGTGCTTTA AGGATAAAAG AGCCCATTAA TGTTTTAATA
GCTGAAGATA ATCAGGTAAA TCAAAAAGTG TTGAAAGATA TTCTTGTTGT TATAGGCATT
AATGAAAATT TTATTGATGT TGTAGATGAT GGAGTAAAGG CTTTAAAATC TTTAAAAGAT
AAAAAATATA CTATCTCTTT TATTGATATA CGAATGCCAA GATATGATGG ATTTTCGGTG
GCTAAGGAAA TTAGAAAATT TGAAAAGGCA AAGAATTTAA AGCCTTGTGT TTTGGTTGCT
GTAACAGCGC ATGCTTTGCA AGAGTATAAA GACAAGTGTC TTGCAAGTGG TATGAATGAT
TATATCTCAA AACCAATACA CATAAGTTCA ATTAAAACTA TATTAAAAAA ATACTTACAG
TTTGAAGTTG ATGATATTGG GGAGAATGAA GATTTGAATC AACTTGTTAA GTTTCCTAAT
TTAGATGTTA ATAGGGCTTT AAAAGAATTA AATCTTTCAT ATGTATCATA TTCTGAATTA
TGTAGAGGGC TTGTTGATTT TATCTCTATT AATATTATTG ATTTGGAAAA AGCTTTTGAT
GAGGAAGATT TGTCTTTAAT TAAGGATATA TCTCATTCAA TATCTGGAGC TCTTTCTAAT
ATGCGTAGCG AATTGTATAA AGATTTTCAA AAAATTGAAA CAAGTAAAGA TTCAATTTCT
GAGTTGAAAA AAATGTATTC TTTTGTAAAA GATGATTTAT TTCAACTAAT AAGCGACATA
AAGGAAAATA TTTTGTTTGA GTCTGAGATT GTTAGTGAGA ACAAGCTATA TTTTAAAAAT
AATGATCAAT TTTTAAACCT TCTCAACAAA CTTTTAATTG GTATTAAGAC TAGAAAGCCA
AGAGAATACA AAGAAATTCT TGAGAGCATT AATAAATATG TTTTAGACGA TAATATTCAG
GTATTATTTA GTGATCTTCG CAGAAATTTA AGATTATATA GATTTGCTGA GAGCTCTAAG
ATTCTTGAAG AGATTATTGA AATGCTTAAT AATAAGAGAT ATTAG
|
|---|
| Protein sequence | MKKANFLSTN FLILLLVCFV NVNLFSKDIF KFKLVDQFFP FYYKNNKGEY EGLIFSILDK
WAKDNNADIM VEHIDNLNES EIEDEAIYLG LTYNVKLNDF FYFKSELARS ISILFFKNSN
KKYKNTHSTF LSNFNIGVIK NTIYEDILRL KNVNTIFLAD NSQELVLALK NDKVDYIYGD
CKTLHYIANN FLSEDLVIFT GDVFYSIKNR VAISRNAPEI VKNLNLDLFS YLMKMPEELV
FSFLDSNAKG SFVDVGLYND YPPLSFINSQ GKLSGILVDL WNLLSRQHIF KPIFKGFSKE
DIKKSLDGKS VGIFGGIISN DSVLENVNYV VSKPIYPLNF KFYSKDLSND AGPINSQFID
FNFNNIQLNK NKDIVNNFID IVNNSYGFIE NSITTKYLLK LNGYNGRLKS YDSIFNKNRF
LVLAIDNRIY KVIKYILNSI FDDISFESLL QIDKNWLDKE EINSSRINSY KIMNKVKFNI
EEKIWLSKNN KLNLAVKNWY PIDYVEANNY KGINQFLLDK IRMFSGLRFN IIKVHSSLDL
KKLIKSGKID MLNTNATDSN LDNVFNIKLN SRIPLYIFSN KKRVLPSRSL EKFAILDFLY
SKNLASNIKS KLILVSSFNE ALLLLYKGKV DGIISDEYTA AAVFEELNID DVEKIPTFRD
LAFDLSLAIY NQDYILKEII QKVVMRSNVD SQMYLNDWKF DIYYKSRSIR FKNFKFLVIT
FIIFYFTFLG FVIIFMFRLS FEQKRRYSFV MNEKKIAEAA NAAKTIFIAN VSHDIRTPIN
GIMAATELLD TTILTDVQKD YVRMINYSSD SLLSLIDDIL YLSKIDVNEL YVESQEIDLE
SEMEMVLKAF QSQCAKKNID LFSYSKSIFN NYIKGDIVKI KQVLINLIGN AFKFTDDGVI
VLNYEEVCRT RTDGNRVLVT VEFKVIDTGK GIEKENFSKI FEIFKQEDDS SSRVHEGAGL
GLSISRELIR LMGGLGIAVD SKVGEGTTFS FMLPFLLGSE LKSKKLSINR FQSVNGDNKV
LNVLLSQKSI KIFEHCSILL GCSSNVRYVA SFEDAYKVFK KYPSYNFVYI NVNNDNIQEG
IRLANNIERL NSDVQIIFLF YYLDNKALKN LKYGYVKKPL MGLGICSILY KKEFNPEMDF
EDLVPIDSAL RIKEPINVLI AEDNQVNQKV LKDILVVIGI NENFIDVVDD GVKALKSLKD
KKYTISFIDI RMPRYDGFSV AKEIRKFEKA KNLKPCVLVA VTAHALQEYK DKCLASGMND
YISKPIHISS IKTILKKYLQ FEVDDIGENE DLNQLVKFPN LDVNRALKEL NLSYVSYSEL
CRGLVDFISI NIIDLEKAFD EEDLSLIKDI SHSISGALSN MRSELYKDFQ KIETSKDSIS
ELKKMYSFVK DDLFQLISDI KENILFESEI VSENKLYFKN NDQFLNLLNK LLIGIKTRKP
REYKEILESI NKYVLDDNIQ VLFSDLRRNL RLYRFAESSK ILEEIIEMLN NKRY
|
|---|
| |