Gene Information Plasmid Coverage information Fosmid Coverage information Sequence |
Gene Information |
Locus tag | UUR10_0634 |
Symbol | |
ID | 6984164 |
Type | CDS |
Is gene spliced | No |
Is pseudo gene | No |
Organism name | Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699 |
Kingdom | Bacteria |
Replicon accession | NC_011374 |
Strand | + |
Start bp | 754192 |
End bp | 760983 |
Gene Length | 6792 bp |
Protein Length | 2263 aa |
Translation table | 4 |
GC content | 25% |
IMG OID | 643400186 |
Product | efflux ABC transporter, permease protein |
Protein accession | YP_002284990 |
Protein GI | 209554026 |
COG category | [M] Cell wall/membrane/envelope biogenesis |
COG ID | [COG4591] ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component |
TIGRFAM ID | |
|
|
Plasmid Coverage information |
Num covering plasmid clones | 0 |
Plasmid unclonability p-value | 1 |
Plasmid hitchhiking | No |
Plasmid clonability | normal |
| |
Fosmid Coverage information |
Num covering fosmid clones | n/a |
Fosmid unclonability p-value | n/a |
Fosmid Hitchhiker | n/a |
Fosmid clonability | n/a |
| |
Sequence |
Gene sequence | ATGAAAAAAA TGTTTTTATT AATGAAGAAT ATGATGCGTT TATTCTTCAA AAATAAAGCC TTAGTAACCC AACTTTCAAT TTTAATGATT GTTTCAACGG TTGTAATCGT TGCAACAACA ATTACAGTTC AACGTTTGCA AAAATCACAA AGTGACATTA AAAAAATTGG TTTACAGAGT GATTTTTTAG TCGACACAAA AGAACAAGAT AACATTAGTT TTAATGAAAT TGAAGTAAGT GATAATCTAG TTAAGCATAA TGAAAAACTA ACTCAGTTAA CAATTTTTAA TCAAAATATC TTAAAAAATT CTAATAATTA TTTACAACTA ATTGATCCGA CATTCAACAA CCACAATCTT TATTGACCTA CTAATAAAAA TAATCGACAA GTAGAAGTAT TAAATTTAGA AGGAAATATC GATTGAAATA AAATTAATCA ACTAAAATTA CAAACTGTTT TTTGATTTGA AACTCGTCAA GAAAGCAATC AAAATTTTGC TAATAATTAT GAAGATTTAG TTTATGAGTA TCGTAATTTT AAAAACCAGT TAGTTGGTTT TCAAAATTTA AGTGGAGGAC GTATTTTATT TCAATCACCT ACACTAAAAC AAACAAATAA TAATTATGAT TCAACATTTA AAGTTAATGC AGCAATCGTA CAAAAAAACA CGCCATTTAA AACCTTTTTT GATTTTAATA AACACGAAGA ATTAGGTTTT AAAAATAAAT CTTATTTTAC AAATCCAGTA TTAATTAGAA ATATTGATCT TAATTCAAAA CAAGTTATTC AAACAATAAA TGATCGTTCT AATCAAGCTA TTGATTTTAA AAATTATCAA AATACATTTC AAGCTATTGT TGATACATTA GAAGCAAACA CCATAAAAAA AGATTTTTAT AGCGTAAATT TACATGTTGA TTTTAGTACA TTATCAACAA AATATTTATT ATTTGCTAAT TATTTAAATA GTGAAGGAAT TGATAAAAAT CGTTATGCAG ACGAATTAAA AATTGATAAC TATAAACAAA AATATTTAGA TTTATTCCAA AATCAAGTTT TAATTCCAAA AGAATTAATT AATGATCCAA AAAAGTTTGA TGAAGTTCAA AAAATCATTA CCAAAGCAAA AGTATTGTTA CTAACAAAAA TTCGAGAAGA AACAAATATC TTTTATGAGA ATTCACAAAA ATTAGCTGAA GAAAACAGAG ATCAAATTAA AGATTATGAA GCGCAATTAA AACAAATAAA TATTGCTTTA CAAAATTCTA ATTATTCTAA TTTTGAACTT ATTCAATTAA AAAACCAACA AAAAGTATTG GCTGCTAATC TTGATCAAGC TAAATTTAAA CGTTTTTTAT ACAATGATTT AATCGCTCAA GATTTTCATT CTGTTTTAAA TAATTATGAT GTTTTCTATC GTAAACATGA ATCTGCTATT CATAACGATG TTAAAAGTGA TTCAAATTTT ATTGTTACTA ATGTAAGCAA CCCTACATAC GCACAAAATG GGGTTATCGC TCCAAAAAAT GAGTGAATCG ATAACATGGT GCAAATTGAT GAGAAAAATA AAAAAAGCCA AAATCCAAAC AAAAAATTTA AACGTATTTT TATAGATAAT CATAATTCAA ATAAAATTAA TGATTTCTAC AATCTTTACT CTAACTATAT TAAAGCGATT CGTACATTAG AAAAAAGCTA TGAAAAGGAT CCAAATACTG ATAAAGATTT ATTAGTTGAA CAACGTGATT ATAGTCCATG AGTTAATACA TCATTCATCA ATATTTATCA ATTGCCCCAA TTTTTTAATG TTTTATTTAA TGAATCAGAA TGGTTATTAT CAATACAATA TTTAAGAGAA ATGAATGAGT ATAAAAAATA CTTATATCAA ATCTTCGAAC CGTATAAAGA TAAAAACTGA ATTTTTAATT TAAATCATCA AAATTGAAAA GATGATCAAC AAGTTATTGC CATTTATAAA AATGCAAACA ACCCTAAAGA TCAAAAACAA TACTATTTTA ATGGATATAT AAAAAACCAT CAGGCTTACA TTGATGTTAA GTATGATAAA AATTTACCAA CACGTTTACA ATTAGTTAAT ATTGTTAAAA AAGATGAAGA AAATCAAAAA AATACCTTAA TTAATGTTTT AGAACGTGAT TTAAATGATT ATACAAACAT CATTAATTTC AAAAAAGGTA TTAAAGATAT TAATACAAAC CAGCAAGCAA TTTATGATCA ATGAGCTTTA TATAATCCAC AAGATTATGC ACAATTTAAG ATTTGAATGT CAAAAATTAT TAAACGTTAT AATTTTTTAC AACTTCAACA ATCACCTTAT GGTTATACAA TTCAAGCGCA AAATGTTTTG ACAAACGTTT TATTATTACC ATTTACAATC AATATTATTA ATCGAAGTTC AGATTTAGCA TATGTAAGTA CATCATATAT TAAAGCTAAT CAAAAAACAG CAAAAAATAC AAATAGTTAT AAAGAAGTTG GTAACTATGA AGACTTTTTA GAAGCTTTAA AATTACCATA TCGTGTTATT AATGATGAGC CAAACTATCG AGAAATTACT TTAGCAGATG GTTCTAAAAA AAGAATTGCA AAAGATTATT ATAGTTGAAT CAACTATGTT GTAAGTCCTG CTAATAAAGT TGAAATTAAT GGTCAATTCT TCTTTATTAT TGGAGCTGTT GATAGTCCAG AATTTTTATT CCCAGCTATT AATGATTCAG ATATTTTAAT TAATAAACAA AAGTCAACTG TTTTATATGT TAATGATTCA GGATTTGCTA AACTTAAAAC TATTGCTGCT AGTGTACCAA TTCTAGAGTA CTACACTCTA AAAGTTAATA CTAATAATTT TAATTTATTA CAAAAAAACA ATGTTTATAA TCAAATAAAA TCAGAGTTAT TAAGTGCTAA AAAAGGTAAT ATATACAAAA AAACAGATAA AGATAATCCT TATCGAATTT ATGTTAAACG AACACTTTTC TTAACACAAT TACGAAATTT AGTAATTGCT ATTGCAGTGG GATTAATTGT TTTAATTTTA TTATTGGGAA TTTATTTTGT TGCTTCAAGT ATTAAAAATA TGATCAACAA AAATAAAGTG ATGTTTGGTG CTATGCAAGC CCAAGGTGTA ACAAGATGAC AAGCATGATT ATCATTCGCT CCTTTTTATA CTATTCCTTC ATTAATTGTT CTAATTATTG GCTATAGCGT TGCATATGCT ATTCAACCTT TAATTATGCG TTTATTTAGT TCTTATTGAC TAATTCCTAT TCCAGAACAG TTTGTTAGTG TTGGATGAAT CTTTGCTATT CCAATTACAT TAGCACTAAT TTTAGGTTTT ATTTGTTGAA CATTAATCTT TTATATTTTA AAACAACCAA CAGCTGAAAC AATGAAGGGT GATGCTGGTT TTAAAATTAA TAAATTTATT ATTGGCACAA AAGCCATCTT TTTAAAATTT GGTGCGATTC GTGTTTTAAA AGCTACATAT GTTGTTGCTA ATTTAGCACG GATGTTAATT TTATTAGTAA TTGCTTCATC GTTCTCGATT ATTGCTTCAA TTATTGCTAC AACAAAAAAT AACTTTAGTC AATCAGCAAG CATTACTAAT GCTAAACGTG AATATGAATA CGCTGTTGAT TTATACTCAC CAACAGAACA AGGCGGATTT TATTACATTT CAAAATTTGA AGAAATGGGA GTTCCAAATG AATATTCCCC TTTAAAACAA ATTGTTCAAA ACGTTAAAAT TGAAGTTAAA ATCAAAAATT TAATTAATAA AAAAGTTAAT GTTGTTTATA TTAATAATCA AACAAAACAA AAAGTTATTA TTGAAGCAAT TATTAATGAA AAAGGATTAA TCAACTTTAA AACCGATCAA TTAATTAATG GTAGTTTTAT GTTTGAAGGA ATTTATGAAC AAGAAACAAA TAGATTATTA ATTGGTTCGC AAAATTTAAG TCCTTATTTA ATTAATATAA ATAATCAAAA AATTGGTCAT TTTAGTTGAT CAGATCACAA ACAATATATT CATTTACTAA AATCACATTT TAGTGATAAT GATGTGATTT TAGATTATGT TGATTCTAAT AATCAACACA CTTATTTAAA ACCAAAAATT CAAGATCAAA CTTTAGTATT TGATCTTTCA TTACTAAATC AAAAACAAAA ATATCGTTTA GTTAATGTAA TAAACACTAA AGGAAATCCA TTAGTTGATT TATCAAAAAT AAATGATGTT TTAAAAACAT TAGATTATTC TAAAAATGGT CGTTATTTAT ATGGATATTA TGGGCGTCTA CCATATTTAT ATTTCAATAA TTTACCACAA GAGTTAATTA ATCAAAAAGT TTATTTAACT TATACAATTA ATCAAACTAA TGAAATTCGC ATTTGTGGTG TTGTTAACGA ACAAAAAGAA GTTGTTTTTG ATTTAACAAA ACTAAAAATT AATCCTCAAC AAAGTTATCA ATTGCGTGAT ATGCGTATTG AAAAAACTAA CTTATTAGTT TATGATAGTA AACAACATGA ATTTAATGAT AATTTAATTT ATTTTGATAA TAATTATTAT GGATTAAATA ATCATGATAA AAACCAAATT AGCATTGATT ATTTAAGTGT AAATCGTAAT TTATATTTAA CACTAAAATC AATGCGCAAT GAATTTAATA ATAAAAATAA AGTACCTTTT ATAACAACTA AAGCAATTGC TCAATTAGTT GAACCAAATG TTGGTATCTT AGATTACAAT CAACTTGAAA AAGGTTATAT TTATCAAATT AGTAGCGCAA CATTAGAGGG TAGCGATACA AATCTATATT TAGATAATGT AAATGCTATT GATAAAACTA AAGATAGTGG TTTACCATAT TCATCACTAA AATATAATAA TGCAATGCGT GAAATTAAAG ATCTAGGAAC AGATCATCCA GTTTATGGCA AAATGTTATC AAATGTTTAT TATCCATCAA TTAGTACTCA ACCAGAAATT CTACAAAACA TTCGTTTCTT TGATAGTAAA GTTATTTCAA AAAGCTCATT AGATGGGAAT ATTAGTGTTA AAGCAACTGA CGTTAATATT GAATTTAACC CTTGAGTTTT TGCTAAAACT TTCTTACCAA TTACAGCTAT TGCACGTTCT GAGTTAAATG AAAAACATTT ATTAGATGAA GCATTTAAAA ACTTTGGATA TGAAATTATT GATGGTAAAA AAGTTAATAA ATTATATGAT GTACCTAATT TTGAAGATGA TGGTATTGTT CGTCAAGTTT CATTATGAAC TAAAACTGGT TTACCACCAA AAAGCGAAAA TGATGAAGAT GCTTTCTTTG TTAAAATTAA TGGTCAATGA AAAATTAATG AAAAACCAGG TGTACTAACA GAACAAGGCG CTGCTGAATT CTTACCTGAA TTCTTACGAT TAATCACACA AATGTACACA TTTAAATCAA CACGTTATCT ACAATATAAA GCAGGTTTAA AATTTGTTAA TATTGAAGAT GAAAAAACGC AACAACCATA TACTTATTTA TTAGGTCAAA TGCAAACAAA AACCAAGAAG TTTGGAAATG AAATTAAAAT CTTAGGAATT AATTACGAAA AAAACAAATT CATTGATGAT AAACCAAGTC CTACTACTCA ACTAAGTTTA ATAAATGACC AAGGTGTAAA TTTAATTGAT TTAATTAAAG ATGATAATGT TAACAATGAA GTTCATAATA TTATCATTAA TAAAGTTGTT GCTCAAAAAT ATCATTTAAA CATTAATGAT GTTTTTGAAT ACGAAATTAA CAATCATATC AAACGTTTAT CAAATAAATT TAATAACACA CCTCAAGTTT ACAAAACGAA ATTTAAAGTT GTTGGTATTA ATGATAGTTT AATGGATGAG CAATTAATTA TTAATCAAAA AATTGCTAAT AAATTAATTG GATTTGATGA TTATCGTGAA CGAATGCAAG TTGAAAATGG TCATCCAATA ATTGAAGCGC GTGAATTTAA TGGCTTTTTT ACAAAAGAAA AAAGCCCAAT CTTTTTCAAT AATATGGCTT CATTCTATTC ACCAAGTGGT CTATCACCTG CCATTGATTC ATGACCACAA AACTTATTAG AAAACATTGG TGGTAATGTT CAAAATATTA ATATTTATTG AATCTTCTAC TATAGTTGAG ATTTAGCTAA TTCAATTTTA AATGCTAGTT TTGATAAAAA TAAAATTAGT TGAGATTCTT TCTCTGAAGT TAATTTAGAT AAACTATTAA AAAAGATGAG TAAAATTTTT GGTAAAGAAG CTAACTTGCC ATCATTTAAA GCAGTTGATG CTAATATTGA AAATGAAATC TTTGCTTCAG TAATTGATAA AACATCGTTT ACATTGTTGT TAAATATTAT TATTGCGATT ATTCCATCGC TTGTGATTAT TATTATTTTA GTAGCTTCAA CATTAGCTAA TGAATCACGA CGTTTAATTG CGATTATGAA AGTCTTAGGA ATGCGTGATT TTAAAAATGT TAATAATTTC ATGTTTATAT ATCCAATTGT ATGGTTATTA AACATCTTAA TCGCTACACC ACTTTCATTT GGAATTATTC ATATTTATAA ATTAGCAATC TTTGCGGCTT TCAACATTGT TTTAGTAGCT TCTATTCCTT GATGAATCTT TGTTGTTAGT TTTGGTTTTG TTGGTCTTGT GTTATTATTT GCTTGATTAC AAATGTTATA TAAAACTAAA AAGCTAAACT TACCAAAAGC TTTAAACCAA TTTACAGATT AA
|
Protein sequence | MKKMFLLMKN MMRLFFKNKA LVTQLSILMI VSTVVIVATT ITVQRLQKSQ SDIKKIGLQS DFLVDTKEQD NISFNEIEVS DNLVKHNEKL TQLTIFNQNI LKNSNNYLQL IDPTFNNHNL YWPTNKNNRQ VEVLNLEGNI DWNKINQLKL QTVFWFETRQ ESNQNFANNY EDLVYEYRNF KNQLVGFQNL SGGRILFQSP TLKQTNNNYD STFKVNAAIV QKNTPFKTFF DFNKHEELGF KNKSYFTNPV LIRNIDLNSK QVIQTINDRS NQAIDFKNYQ NTFQAIVDTL EANTIKKDFY SVNLHVDFST LSTKYLLFAN YLNSEGIDKN RYADELKIDN YKQKYLDLFQ NQVLIPKELI NDPKKFDEVQ KIITKAKVLL LTKIREETNI FYENSQKLAE ENRDQIKDYE AQLKQINIAL QNSNYSNFEL IQLKNQQKVL AANLDQAKFK RFLYNDLIAQ DFHSVLNNYD VFYRKHESAI HNDVKSDSNF IVTNVSNPTY AQNGVIAPKN EWIDNMVQID EKNKKSQNPN KKFKRIFIDN HNSNKINDFY NLYSNYIKAI RTLEKSYEKD PNTDKDLLVE QRDYSPWVNT SFINIYQLPQ FFNVLFNESE WLLSIQYLRE MNEYKKYLYQ IFEPYKDKNW IFNLNHQNWK DDQQVIAIYK NANNPKDQKQ YYFNGYIKNH QAYIDVKYDK NLPTRLQLVN IVKKDEENQK NTLINVLERD LNDYTNIINF KKGIKDINTN QQAIYDQWAL YNPQDYAQFK IWMSKIIKRY NFLQLQQSPY GYTIQAQNVL TNVLLLPFTI NIINRSSDLA YVSTSYIKAN QKTAKNTNSY KEVGNYEDFL EALKLPYRVI NDEPNYREIT LADGSKKRIA KDYYSWINYV VSPANKVEIN GQFFFIIGAV DSPEFLFPAI NDSDILINKQ KSTVLYVNDS GFAKLKTIAA SVPILEYYTL KVNTNNFNLL QKNNVYNQIK SELLSAKKGN IYKKTDKDNP YRIYVKRTLF LTQLRNLVIA IAVGLIVLIL LLGIYFVASS IKNMINKNKV MFGAMQAQGV TRWQAWLSFA PFYTIPSLIV LIIGYSVAYA IQPLIMRLFS SYWLIPIPEQ FVSVGWIFAI PITLALILGF ICWTLIFYIL KQPTAETMKG DAGFKINKFI IGTKAIFLKF GAIRVLKATY VVANLARMLI LLVIASSFSI IASIIATTKN NFSQSASITN AKREYEYAVD LYSPTEQGGF YYISKFEEMG VPNEYSPLKQ IVQNVKIEVK IKNLINKKVN VVYINNQTKQ KVIIEAIINE KGLINFKTDQ LINGSFMFEG IYEQETNRLL IGSQNLSPYL ININNQKIGH FSWSDHKQYI HLLKSHFSDN DVILDYVDSN NQHTYLKPKI QDQTLVFDLS LLNQKQKYRL VNVINTKGNP LVDLSKINDV LKTLDYSKNG RYLYGYYGRL PYLYFNNLPQ ELINQKVYLT YTINQTNEIR ICGVVNEQKE VVFDLTKLKI NPQQSYQLRD MRIEKTNLLV YDSKQHEFND NLIYFDNNYY GLNNHDKNQI SIDYLSVNRN LYLTLKSMRN EFNNKNKVPF ITTKAIAQLV EPNVGILDYN QLEKGYIYQI SSATLEGSDT NLYLDNVNAI DKTKDSGLPY SSLKYNNAMR EIKDLGTDHP VYGKMLSNVY YPSISTQPEI LQNIRFFDSK VISKSSLDGN ISVKATDVNI EFNPWVFAKT FLPITAIARS ELNEKHLLDE AFKNFGYEII DGKKVNKLYD VPNFEDDGIV RQVSLWTKTG LPPKSENDED AFFVKINGQW KINEKPGVLT EQGAAEFLPE FLRLITQMYT FKSTRYLQYK AGLKFVNIED EKTQQPYTYL LGQMQTKTKK FGNEIKILGI NYEKNKFIDD KPSPTTQLSL INDQGVNLID LIKDDNVNNE VHNIIINKVV AQKYHLNIND VFEYEINNHI KRLSNKFNNT PQVYKTKFKV VGINDSLMDE QLIINQKIAN KLIGFDDYRE RMQVENGHPI IEAREFNGFF TKEKSPIFFN NMASFYSPSG LSPAIDSWPQ NLLENIGGNV QNINIYWIFY YSWDLANSIL NASFDKNKIS WDSFSEVNLD KLLKKMSKIF GKEANLPSFK AVDANIENEI FASVIDKTSF TLLLNIIIAI IPSLVIIIIL VASTLANESR RLIAIMKVLG MRDFKNVNNF MFIYPIVWLL NILIATPLSF GIIHIYKLAI FAAFNIVLVA SIPWWIFVVS FGFVGLVLLF AWLQMLYKTK KLNLPKALNQ FTD
|
| |