Gene UUR10_0260 details

Gene Information       Plasmid Coverage information       Fosmid Coverage information       Sequence       

Gene Information

Locus tagUUR10_0260 
Symbol 
ID6983727 
TypeCDS 
Is gene splicedNo 
Is pseudo geneNo 
Organism nameUreaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699 
KingdomBacteria 
Replicon accessionNC_011374 
Strand
Start bp285340 
End bp288324 
Gene Length2985 bp 
Protein Length994 aa 
Translation table
GC content28% 
IMG OID643399834 
Productcalcium-translocating P-type ATPase, PMCA-type 
Protein accessionYP_002284664 
Protein GI209554004 
COG category[P] Inorganic ion transport and metabolism 
COG ID[COG0474] Cation transport ATPase 
TIGRFAM ID[TIGR01494] ATPase, P-type (transporting), HAD superfamily, subfamily IC
[TIGR01517] plasma-membrane calcium-translocating P-type ATPase
[TIGR01523] potassium and/or sodium efflux P-type ATPase, fungal-type 


Plasmid Coverage information

Num covering plasmid clones14 
Plasmid unclonability p-value
Plasmid hitchhikingNo 
Plasmid clonabilitynormal 
 

Fosmid Coverage information

Num covering fosmid clonesn/a 
Fosmid unclonability p-valuen/a 
Fosmid Hitchhikern/a 
Fosmid clonabilityn/a 
 

Sequence

Gene sequence
GTGAAAAAAA ATAATGAAGA TCAGACAGAC TCCTTTGTTT CGTTTGATCC ACAAAATACA 
GATCCATTAA CTGGTTTAAA TGACGAACAA GTTTTAAAAA GTCGTCAAAT TTATGGCTTT
AATGAAATCA AAAAGAAAAA GAAATCAAAT ATTCTTACAA AATTCTTTAA ACAATTTTTA
GATTTCATGG TTATTTTACT TGTAATTGCC GGAATTATTA CTTTAATTTT AGCAATTGTT
AAACCCCCGC ATGATATAAC AGAATTAATT GTCCAATATG TTGAAGTCGG GGTAATAGGC
TTCATTTTAT TTTTAAATGC AATTTTTGGA ACCATTCAAG AAGTTAAAGC AGAAAAAAAT
ACAGAAGCAT TATCTAAATT AACATCTCCT CAAGCTAAAG TATTACGAAA CAACCAAATT
TTAATTATTG ATTCAAGAGA GGTTGTAATA GGTGATATTC TAATTTTAGA AGCAGGAGAT
TGAATTCCCG CTGATGCTCT ATTAATAAAT AGTTCATCGC TTGAAGTTGA TGAAGCTGTT
TTAACAGGTG AGTCATTACC AGTTCAAAAA GATGCTAAAG CAATTGTTAA ACAAGGCGCA
GGGATTGGCG ATCGCTTAAA TCAAATTTTC TCTGGAACAT CTATTACTAA TGGTACTGCT
AAAGCAATCG TTACTAACAT TGGAATGAAT ACTGAAATAG GTAAAATTGC TAAATTAATT
AATGACCAAA AAGTTCAATT AACACCATTA CAACAAAAAA TTAATAAATT ATCAAAAATT
ATAGGTGCAT TTGCATCAGT TTTGTGTATA GCTGTTTTTA TTATTTATAT TTATTTAGTT
GGAGGTGGAA ATTGAGAAAT TAATTGACAT CCAGCTTTAG TAATGGCTAT TTCATTATCT
ATAGCTGCTA TTCCTGAAGG AATTGTTGCA ATTGTAACAA TTATCTTATC ATTTGGTGTT
AAACAAATGG CAAAAAAAAA TGCTTTAATT AAACGTTTAC CAGCTGTTGA AACATTAGGA
AGTGCTAATG TGATTTGTTC TGATAAAACT GGAACTCTAA CACAAAATAA AATGACTGTT
ACTAAAGTTT TTACTAATAT ATTAAAAACA ACAGATTTAA TTAATGAAAA AGATGTTTAT
GAATTAATTA AATGAGCTTC TATTGCAAAC AATGGTTCAA GAAATTTTAA TGATAAAAAA
CAAGAATATG AATTTATTGG CGATCCAACT GAAACTAGTA TTATTGAAGC AGCTCTTAAA
TTAAATATAG ATAAAAGTGA ACTAGATAAA GAATTTGTTA GAATTCATGA ATTTCCATTC
GACTCAACAC GAAAATTAAT GAGTGTAATT GTTAGGAATA ATGATAATTA TTACTTAGTT
ACTAAAGGAG CAATTGATGC TATTGAAAAA ATTGTTGTTG AACCAATTAC AAACGATGTT
TATAAAGCAA ATGATTTTTT AGGTAAACAA GCTTTAAGAG TTTTAGGTGT GGGAATTAAA
AAATTAGCAT TCTTGCCAAC TAATTTTAAT CAAGATGAAC TTGAAAGAGA ATTAGAATTT
ATTGGATTAG TTGGTATGAT TGATCCACCA CGTCCTGAAG CACAAGAAGC TGTTGAGATT
GCAATTAAAG CCGGAATTCG ACCTGTCATG ATTACAGGTG ATCATATTAA TACAGCATCT
GCAATTGCTA AACAAATTGG TATATTAAAT GAAGGGCAAG AAGTATTAAG TGGGCATGAA
TTAAGTTCCA TGAGTGATGA AGAATTAATT AATAATGTTG AGCGTTATAG CGTTTATGCA
CGTGTTTCAC CAACAGATAA AATTCGTATC GTTAAAGCTT GACAATCACA CGATAAAGTC
GTGAGCATGA CAGGTGATGG TGTTAATGAT GCTCCAGCAC TAAAAGCCGC TGATATTGGA
TGTGCCATGG GAATCACTGG TACAGATGTT TCAAAAGCTT CGAGTGATAT GATATTAACT
GATGATAACT TTGCAACAAT TATTAATGCT GTTAGTTTAG GTCGTTCAAT CATGGACAAC
ATTAAACGTA TCATTGTCTT ATTATTGATC ACTAATTTAG CTGGATTAAT TTCATTAATT
TTTGGAATCA TTATTTTGGG TATTAACCCA ATGTCTTCAT TACAAATTTT ATGAATTAAT
GTGATCGCTG AAACTCTACC AGGAATCGCA TTAGGTGTAC ATTTAGCAGA TGCTAATTTA
ATGCGTCATA AACCATTAAA GAAATCTGCT CCAATTGTTA ATAAAAAAAT GTGAATGACA
ATCTTTATTA ATGGTTTCTT TATTGGTTTA ATTTCTATTC TATTGTTTTA TTTAGGGGCA
TCATCACATT TTGACTTTGA TTTTATAGCA ATGAGAAACG AGTTTAAAGA ACTTGCTAAT
CTTGAAGCAA TATATCAAAA TGTGTGAAAT TGATTAGGCG AAAATCATGA AATTACTAAT
ATTGTTCATG AAAAAATTAT AGCGATAAAA ACACCAATTA TGGCCGGATC GTCATTGACA
TTTATTTTCA TGGGAATGAG TTTGGCTTTT AATGCATTAA GTTTAAGAAG TAATCACTCA
ATATTTATTA ATTTTTGAAA AAACTCTAAA TATATTGTTT ATTCAATAAT AATTTCTGTA
ATTATGATTA TTGTTATTAC TTATACTCCT CATTTAAATG AAGTATTTAA TATGAATCCA
TATAATATGA ATGGTTACGA GTGATTTAAT GTGTTTCCAT TTGTTTTATT TACAATTCCC
TTAGGTATTT TTGAAGTAAT AAAATATGTT AAATATTTAA AGCTACGCCG TAGTTTTGAT
TATAAAAATA AAACTTATGC TTCATTAAAT CAAGAAATAA AATCATTAAA TTTAAAAATT
AATAATACAA AAATTAACTA TGAAAAAGAA TACTATAAAG CACTATTAAA CAATTTAATT
GTTAAAAGAA AAATTTTAAT TAATAAGTGT CACAAAGAAA TATAA
 
Protein sequence
MKKNNEDQTD SFVSFDPQNT DPLTGLNDEQ VLKSRQIYGF NEIKKKKKSN ILTKFFKQFL 
DFMVILLVIA GIITLILAIV KPPHDITELI VQYVEVGVIG FILFLNAIFG TIQEVKAEKN
TEALSKLTSP QAKVLRNNQI LIIDSREVVI GDILILEAGD WIPADALLIN SSSLEVDEAV
LTGESLPVQK DAKAIVKQGA GIGDRLNQIF SGTSITNGTA KAIVTNIGMN TEIGKIAKLI
NDQKVQLTPL QQKINKLSKI IGAFASVLCI AVFIIYIYLV GGGNWEINWH PALVMAISLS
IAAIPEGIVA IVTIILSFGV KQMAKKNALI KRLPAVETLG SANVICSDKT GTLTQNKMTV
TKVFTNILKT TDLINEKDVY ELIKWASIAN NGSRNFNDKK QEYEFIGDPT ETSIIEAALK
LNIDKSELDK EFVRIHEFPF DSTRKLMSVI VRNNDNYYLV TKGAIDAIEK IVVEPITNDV
YKANDFLGKQ ALRVLGVGIK KLAFLPTNFN QDELERELEF IGLVGMIDPP RPEAQEAVEI
AIKAGIRPVM ITGDHINTAS AIAKQIGILN EGQEVLSGHE LSSMSDEELI NNVERYSVYA
RVSPTDKIRI VKAWQSHDKV VSMTGDGVND APALKAADIG CAMGITGTDV SKASSDMILT
DDNFATIINA VSLGRSIMDN IKRIIVLLLI TNLAGLISLI FGIIILGINP MSSLQILWIN
VIAETLPGIA LGVHLADANL MRHKPLKKSA PIVNKKMWMT IFINGFFIGL ISILLFYLGA
SSHFDFDFIA MRNEFKELAN LEAIYQNVWN WLGENHEITN IVHEKIIAIK TPIMAGSSLT
FIFMGMSLAF NALSLRSNHS IFINFWKNSK YIVYSIIISV IMIIVITYTP HLNEVFNMNP
YNMNGYEWFN VFPFVLFTIP LGIFEVIKYV KYLKLRRSFD YKNKTYASLN QEIKSLNLKI
NNTKINYEKE YYKALLNNLI VKRKILINKC HKEI