Gene Mvan_2552 details

Gene Information       Plasmid Coverage information       Fosmid Coverage information       Sequence       

Gene Information

Locus tagMvan_2552 
Symbol 
ID4645433 
TypeCDS 
Is gene splicedNo 
Is pseudo geneNo 
Organism nameMycobacterium vanbaalenii PYR-1 
KingdomBacteria 
Replicon accessionNC_008726 
Strand
Start bp2691877 
End bp2695344 
Gene Length3468 bp 
Protein Length1155 aa 
Translation table11 
GC content76% 
IMG OID639806036 
Producthypothetical protein 
Protein accessionYP_953368 
Protein GI120403539 
COG category 
COG ID 
TIGRFAM ID 


Plasmid Coverage information

Num covering plasmid clones
Plasmid unclonability p-value0.160747 
Plasmid hitchhikingNo 
Plasmid clonabilitynormal 
 

Fosmid Coverage information

Num covering fosmid clones29 
Fosmid unclonability p-value
Fosmid HitchhikerNo 
Fosmid clonabilitynormal 
 

Sequence

Gene sequence
ATGTCACGGA CGAAAAAGAG CATCGTCGTT GTCATGATGG GCAGCGCGGG ATTGTTCTTG 
AGCGCCCCGC TGCTGGGCCC CTCCGCAAAC GCGACCCCCA CCCGGGGCGG CGTGCCCTGC
GTGGGCATTC TTCAGCAGGT GATCTCGCGT CCGGGCGACA TCCCCCAGGC GCTGACCGAA
ACGGCGCGGT CGTTCACCAA CCCGGGGCAG CCCGCTCCGC CGGTCGTGCG GCCGCCCGCC
AGCAGCTCGT CGTCGGTCGG AACACCGCCG GTGCCGCCGA CCCCGCCTGG TTCGGTGGTC
CGGCCGTCCT CGGGTGCCAC CCCGCCTGTT CCGCCGACAC CCGGGACACC GGCGTCGACA
ACGACCGGAG TTGGGACACC GCCGGTTCCG CCCACGCCCC CCGGATCCAC GGTCAGGCCG
GCAGCGGGCG CGACCCCGCC CGCGCCGCCC GTTCCGGGAG TCCCCGCGGG GACCCCGATC
GGTGGTGGCA CTCCGCCGCT GCCACCGGTG CCGGGCGCCC CGGCAGGCAC CCCGGTGGCC
AACGTGGCGC CGCCGTCGCC TCCAGTTCCG GGCGTCCCCG TCATCGGCGA CGGCGGGGCG
GCGCTGCCTC CGCTGCCTCC GGTTCCCGGT GGACCCGCGG CGGTGCCCGC CGGTGTGGTG
ACGCCGCCGG CTCCTCCGAT TCCCGGCGGG CCCGCGGCAA TGCCGGCTGG TGTGGCGGCG
CCGCCGGCTC CTGCGCCGCC GGGCGCACCG ATCTTCGGTG AGGCCGGGGC GGTGCCGCCT
CCGGGTGTGG GCGGCGCGCC GCTCGACGGC GCTTCCGGCG TCGCGGCACC GGGTGGGCCC
GGTGGCGGAG CAGGTGCCCC GGGCGCGCCG GTGGCCGCAG CCGCAGGCAA CGCCGGCCCT
CCTGCGCCGG GTGCCCCCGT CGGTGACCAG GCGGGTGTGG TGGCGCCGCC GGCTCCGCCC
GCGCCGGGTG CCCCCGTCGG TGACCAGGCA GGTCTCGTTG CGCCTCCCGG GCCGCCCGCG
CCGGGTGTGC CGGTGGTCGA CCAGGCGGGT GTGGTGGCGC CTCCCGGGCC GCCCGCGCCC
GGCGTGCCAG TCGTGGATGA GGCGGGTGTG GTGACGCCTC CGGGGCCGGG TGCTCCGGGT
GTGCCGGTGG TGGGCGAGGC GGGTGTGGTG ACGCCTCCGG GGCCGGGTGC TCCGGGTGTG
CCGGTGGTGG ATGAGGCGGG TGTGGTGACG CCTCCGGGGC CGGGTGCTCC GGGTGTTCCG
GTGGTGGATG AGGCGGGTGT GGTGACGCCT CCGGGGCCGG GTGCTCCGGG TGTTCCGGTG
GTGGATGAGG CGGGTGTGGT GACGCCCCCG GCGCCGGGTG CACCTGGTGT TCCGGTCGAC
GGTGGGGCCG AACTGGTCAC ACCTCCCGGC CCCGGCGCTC CTGGTACGCC GACAGTGAGC
TCGGTTGAGA CGTTTTCACC GCCTGCCCCG CCCGCGCCGG GTACACCGTC GTCGGGCTCG
ATCGAGACAT TCTCGCCGCC GGCGCCGCCG ACGCCCGGGA CACCGGCGAA TTCGTCAGTC
GAGATCGTGA CGCCCCCGCC CCCAGGGGTG CCCGGCGTCC CGGGCGAGGG GTCAACGACC
TACACGACTC CGCCGACTCC GGAAATCACT CTCAATCCGG CGAACTCGTC GATCGACGTG
GCGACGCCGC CCGGCCCGGG CGTCCCGGGT GTCCCCGTGG AGGCGTCGGC GAATGTGTCG
ACCCCGCCCG TTCCGGGTGT TCCTGGTGCG CCGGTGAATT CGTCCGTCGA GGTGGCGACC
CCGGCCGAGG TGGGTGTCCC CGGAACCCCG ATCGAGAGGT CGACCACACT GACGACCCCG
CCGACCCCCG GTGTTCCTGG TACGCCGGTG AATTCGTCGG TCGAGGTGGC GACCCCGCCG
GCGCCGGGTG CTCCGGGTGT GCCGGTGGTG GATGAGGCGG GTGTGGTGAC GCCTCCGGGG
CCGGGTGCTC CGGGTGTGCC GGTGGTGGGC GAGGCGGGTG TGGTGACGCC TCCGGGGCCG
GGTGCTCCGG GTGTGCCGGT GGTGGATGAG GCGGGTGTGG TGACGCCTCC GGGGCCGGGT
GCTCCGGGTG TGCCGGTGGT GGGCGAGGCG GGTGTGGTGA CGCCTCCGGG GCCGGGTGCT
CCGGGTGTGC CGGTGGTGGA TGAGGCGGGT GTGGTGACGC CTCCGGGGCC GGGTGCTCCG
GGTGTGCCGG TGGTGGGCGA GGCGGGTGTG GTGACGCCTC CGGGGCCGGG TGCTCCGGGT
GTGCCGGTGG TGGATGAGGC GGGTGTGGTG ACGCCTCCGG GGCCGGGTGC TCCGGGTGTG
CCGGTGGTGG ATGAGGCGGG TGTGGTGACG CCTCCGGGGC CGGGTGCTCC GGGTGTGCCG
GTGGTGGATG AGGCGGGTGT GGTGACGCCT CCGGCGCCGC CCGCAGCGGC GCCGGGTGCT
CCGATCGACG CCGCCGCCGC ATCGGTCGCT CCGTCCGGAC CGCCGGCTGC GCCCGTTCTC
GGCGAGGCCG GTGTCGTGGC TCCGCCCGCG CCGCCCGGGG GAGGTGCTCC AGGTGGAGGT
GCGCCCGGCG CAGGAGTCGG TACCGGCGCT CCGATCGAGG GCGCTGCCGG TGCCGGCGGC
GTGCCTGCCG CGCCGCTGGC CGCCAATGCC GGTGCGGCCA CTCCGCCAGC CGCTGCTACT
GGTGGTGCTG GTGCTCCGAT CGATGCGGCT GCCGGTGCGG CTGCGCCGCC GGCGCCGCCT
GCCCCAGGTG CGCCCATCTT CGGCGAGGCC GGTGTGGCCG CCCCGCCGCT GCCGCCCGCG
CCCGGTGGTG CCGGTGCGGT GCCTGCCGGT GTGGTGACGC CTCCGGTTCC GGGTGTTCCC
GGTGGTGCCG GTGCGGTGCC TGCCGGAGCG GTGACGCCTC CGACGCCTCC GGTGCCCGGG
TCGTCGTCAG GCGGGTTTGT CAACTACCCG GCGCCGCCGG TGCCGCCGAC GCCACCGAAC
TCGGCGGGAG TCAACACCGG AACACCGGGG TCGCCGATCC CGGGAACTCC CGGCAGCACG
CTGACGATCT CCGATCTGCT CACGCCACCC GGTGTGGCGC GGACCGTGCA GAACACCGCC
TCGTCGGTGA TGAGCATCGC GCCCCCCGGA ACGCCGCCGG TGCCCGGCGG CGCCGGATCG
GTGAGCGTGG GTGTCCCTGC TCCGCCGAGC CCGCTGACCC CGCTGGCCGC GACGGGCCTG
TCCAACCTGG TGTCGCCGCC GTCGCTGACC ATCCCGTCGA TTCCGGGGTT GCCGGTGCCG
CTGCCCAACG AGGTACCGGT TCCGTCCGAC CTGCTGTGTG TCGGCACGGA TTGGTCGGCG
ACGCAAGGAG ATTCGGCGAC CACTCCGGTC AACGCCGAAA TTCCGCGGGC ACTGGTCACG
GGCGCGGCGC CGGTCGGTGA CCGGCGGGAC CGGTGGGACA CCAGGTAG
 
Protein sequence
MSRTKKSIVV VMMGSAGLFL SAPLLGPSAN ATPTRGGVPC VGILQQVISR PGDIPQALTE 
TARSFTNPGQ PAPPVVRPPA SSSSSVGTPP VPPTPPGSVV RPSSGATPPV PPTPGTPAST
TTGVGTPPVP PTPPGSTVRP AAGATPPAPP VPGVPAGTPI GGGTPPLPPV PGAPAGTPVA
NVAPPSPPVP GVPVIGDGGA ALPPLPPVPG GPAAVPAGVV TPPAPPIPGG PAAMPAGVAA
PPAPAPPGAP IFGEAGAVPP PGVGGAPLDG ASGVAAPGGP GGGAGAPGAP VAAAAGNAGP
PAPGAPVGDQ AGVVAPPAPP APGAPVGDQA GLVAPPGPPA PGVPVVDQAG VVAPPGPPAP
GVPVVDEAGV VTPPGPGAPG VPVVGEAGVV TPPGPGAPGV PVVDEAGVVT PPGPGAPGVP
VVDEAGVVTP PGPGAPGVPV VDEAGVVTPP APGAPGVPVD GGAELVTPPG PGAPGTPTVS
SVETFSPPAP PAPGTPSSGS IETFSPPAPP TPGTPANSSV EIVTPPPPGV PGVPGEGSTT
YTTPPTPEIT LNPANSSIDV ATPPGPGVPG VPVEASANVS TPPVPGVPGA PVNSSVEVAT
PAEVGVPGTP IERSTTLTTP PTPGVPGTPV NSSVEVATPP APGAPGVPVV DEAGVVTPPG
PGAPGVPVVG EAGVVTPPGP GAPGVPVVDE AGVVTPPGPG APGVPVVGEA GVVTPPGPGA
PGVPVVDEAG VVTPPGPGAP GVPVVGEAGV VTPPGPGAPG VPVVDEAGVV TPPGPGAPGV
PVVDEAGVVT PPGPGAPGVP VVDEAGVVTP PAPPAAAPGA PIDAAAASVA PSGPPAAPVL
GEAGVVAPPA PPGGGAPGGG APGAGVGTGA PIEGAAGAGG VPAAPLAANA GAATPPAAAT
GGAGAPIDAA AGAAAPPAPP APGAPIFGEA GVAAPPLPPA PGGAGAVPAG VVTPPVPGVP
GGAGAVPAGA VTPPTPPVPG SSSGGFVNYP APPVPPTPPN SAGVNTGTPG SPIPGTPGST
LTISDLLTPP GVARTVQNTA SSVMSIAPPG TPPVPGGAGS VSVGVPAPPS PLTPLAATGL
SNLVSPPSLT IPSIPGLPVP LPNEVPVPSD LLCVGTDWSA TQGDSATTPV NAEIPRALVT
GAAPVGDRRD RWDTR