Gene Information Plasmid Coverage information Fosmid Coverage information Sequence |
Gene Information |
Locus tag | Mvan_2552 |
Symbol | |
ID | 4645433 |
Type | CDS |
Is gene spliced | No |
Is pseudo gene | No |
Organism name | Mycobacterium vanbaalenii PYR-1 |
Kingdom | Bacteria |
Replicon accession | NC_008726 |
Strand | + |
Start bp | 2691877 |
End bp | 2695344 |
Gene Length | 3468 bp |
Protein Length | 1155 aa |
Translation table | 11 |
GC content | 76% |
IMG OID | 639806036 |
Product | hypothetical protein |
Protein accession | YP_953368 |
Protein GI | 120403539 |
COG category | |
COG ID | |
TIGRFAM ID | |
|
|
Plasmid Coverage information |
Num covering plasmid clones | 6 |
Plasmid unclonability p-value | 0.160747 |
Plasmid hitchhiking | No |
Plasmid clonability | normal |
| |
Fosmid Coverage information |
Num covering fosmid clones | 29 |
Fosmid unclonability p-value | 1 |
Fosmid Hitchhiker | No |
Fosmid clonability | normal |
| |
Sequence |
Gene sequence | ATGTCACGGA CGAAAAAGAG CATCGTCGTT GTCATGATGG GCAGCGCGGG ATTGTTCTTG AGCGCCCCGC TGCTGGGCCC CTCCGCAAAC GCGACCCCCA CCCGGGGCGG CGTGCCCTGC GTGGGCATTC TTCAGCAGGT GATCTCGCGT CCGGGCGACA TCCCCCAGGC GCTGACCGAA ACGGCGCGGT CGTTCACCAA CCCGGGGCAG CCCGCTCCGC CGGTCGTGCG GCCGCCCGCC AGCAGCTCGT CGTCGGTCGG AACACCGCCG GTGCCGCCGA CCCCGCCTGG TTCGGTGGTC CGGCCGTCCT CGGGTGCCAC CCCGCCTGTT CCGCCGACAC CCGGGACACC GGCGTCGACA ACGACCGGAG TTGGGACACC GCCGGTTCCG CCCACGCCCC CCGGATCCAC GGTCAGGCCG GCAGCGGGCG CGACCCCGCC CGCGCCGCCC GTTCCGGGAG TCCCCGCGGG GACCCCGATC GGTGGTGGCA CTCCGCCGCT GCCACCGGTG CCGGGCGCCC CGGCAGGCAC CCCGGTGGCC AACGTGGCGC CGCCGTCGCC TCCAGTTCCG GGCGTCCCCG TCATCGGCGA CGGCGGGGCG GCGCTGCCTC CGCTGCCTCC GGTTCCCGGT GGACCCGCGG CGGTGCCCGC CGGTGTGGTG ACGCCGCCGG CTCCTCCGAT TCCCGGCGGG CCCGCGGCAA TGCCGGCTGG TGTGGCGGCG CCGCCGGCTC CTGCGCCGCC GGGCGCACCG ATCTTCGGTG AGGCCGGGGC GGTGCCGCCT CCGGGTGTGG GCGGCGCGCC GCTCGACGGC GCTTCCGGCG TCGCGGCACC GGGTGGGCCC GGTGGCGGAG CAGGTGCCCC GGGCGCGCCG GTGGCCGCAG CCGCAGGCAA CGCCGGCCCT CCTGCGCCGG GTGCCCCCGT CGGTGACCAG GCGGGTGTGG TGGCGCCGCC GGCTCCGCCC GCGCCGGGTG CCCCCGTCGG TGACCAGGCA GGTCTCGTTG CGCCTCCCGG GCCGCCCGCG CCGGGTGTGC CGGTGGTCGA CCAGGCGGGT GTGGTGGCGC CTCCCGGGCC GCCCGCGCCC GGCGTGCCAG TCGTGGATGA GGCGGGTGTG GTGACGCCTC CGGGGCCGGG TGCTCCGGGT GTGCCGGTGG TGGGCGAGGC GGGTGTGGTG ACGCCTCCGG GGCCGGGTGC TCCGGGTGTG CCGGTGGTGG ATGAGGCGGG TGTGGTGACG CCTCCGGGGC CGGGTGCTCC GGGTGTTCCG GTGGTGGATG AGGCGGGTGT GGTGACGCCT CCGGGGCCGG GTGCTCCGGG TGTTCCGGTG GTGGATGAGG CGGGTGTGGT GACGCCCCCG GCGCCGGGTG CACCTGGTGT TCCGGTCGAC GGTGGGGCCG AACTGGTCAC ACCTCCCGGC CCCGGCGCTC CTGGTACGCC GACAGTGAGC TCGGTTGAGA CGTTTTCACC GCCTGCCCCG CCCGCGCCGG GTACACCGTC GTCGGGCTCG ATCGAGACAT TCTCGCCGCC GGCGCCGCCG ACGCCCGGGA CACCGGCGAA TTCGTCAGTC GAGATCGTGA CGCCCCCGCC CCCAGGGGTG CCCGGCGTCC CGGGCGAGGG GTCAACGACC TACACGACTC CGCCGACTCC GGAAATCACT CTCAATCCGG CGAACTCGTC GATCGACGTG GCGACGCCGC CCGGCCCGGG CGTCCCGGGT GTCCCCGTGG AGGCGTCGGC GAATGTGTCG ACCCCGCCCG TTCCGGGTGT TCCTGGTGCG CCGGTGAATT CGTCCGTCGA GGTGGCGACC CCGGCCGAGG TGGGTGTCCC CGGAACCCCG ATCGAGAGGT CGACCACACT GACGACCCCG CCGACCCCCG GTGTTCCTGG TACGCCGGTG AATTCGTCGG TCGAGGTGGC GACCCCGCCG GCGCCGGGTG CTCCGGGTGT GCCGGTGGTG GATGAGGCGG GTGTGGTGAC GCCTCCGGGG CCGGGTGCTC CGGGTGTGCC GGTGGTGGGC GAGGCGGGTG TGGTGACGCC TCCGGGGCCG GGTGCTCCGG GTGTGCCGGT GGTGGATGAG GCGGGTGTGG TGACGCCTCC GGGGCCGGGT GCTCCGGGTG TGCCGGTGGT GGGCGAGGCG GGTGTGGTGA CGCCTCCGGG GCCGGGTGCT CCGGGTGTGC CGGTGGTGGA TGAGGCGGGT GTGGTGACGC CTCCGGGGCC GGGTGCTCCG GGTGTGCCGG TGGTGGGCGA GGCGGGTGTG GTGACGCCTC CGGGGCCGGG TGCTCCGGGT GTGCCGGTGG TGGATGAGGC GGGTGTGGTG ACGCCTCCGG GGCCGGGTGC TCCGGGTGTG CCGGTGGTGG ATGAGGCGGG TGTGGTGACG CCTCCGGGGC CGGGTGCTCC GGGTGTGCCG GTGGTGGATG AGGCGGGTGT GGTGACGCCT CCGGCGCCGC CCGCAGCGGC GCCGGGTGCT CCGATCGACG CCGCCGCCGC ATCGGTCGCT CCGTCCGGAC CGCCGGCTGC GCCCGTTCTC GGCGAGGCCG GTGTCGTGGC TCCGCCCGCG CCGCCCGGGG GAGGTGCTCC AGGTGGAGGT GCGCCCGGCG CAGGAGTCGG TACCGGCGCT CCGATCGAGG GCGCTGCCGG TGCCGGCGGC GTGCCTGCCG CGCCGCTGGC CGCCAATGCC GGTGCGGCCA CTCCGCCAGC CGCTGCTACT GGTGGTGCTG GTGCTCCGAT CGATGCGGCT GCCGGTGCGG CTGCGCCGCC GGCGCCGCCT GCCCCAGGTG CGCCCATCTT CGGCGAGGCC GGTGTGGCCG CCCCGCCGCT GCCGCCCGCG CCCGGTGGTG CCGGTGCGGT GCCTGCCGGT GTGGTGACGC CTCCGGTTCC GGGTGTTCCC GGTGGTGCCG GTGCGGTGCC TGCCGGAGCG GTGACGCCTC CGACGCCTCC GGTGCCCGGG TCGTCGTCAG GCGGGTTTGT CAACTACCCG GCGCCGCCGG TGCCGCCGAC GCCACCGAAC TCGGCGGGAG TCAACACCGG AACACCGGGG TCGCCGATCC CGGGAACTCC CGGCAGCACG CTGACGATCT CCGATCTGCT CACGCCACCC GGTGTGGCGC GGACCGTGCA GAACACCGCC TCGTCGGTGA TGAGCATCGC GCCCCCCGGA ACGCCGCCGG TGCCCGGCGG CGCCGGATCG GTGAGCGTGG GTGTCCCTGC TCCGCCGAGC CCGCTGACCC CGCTGGCCGC GACGGGCCTG TCCAACCTGG TGTCGCCGCC GTCGCTGACC ATCCCGTCGA TTCCGGGGTT GCCGGTGCCG CTGCCCAACG AGGTACCGGT TCCGTCCGAC CTGCTGTGTG TCGGCACGGA TTGGTCGGCG ACGCAAGGAG ATTCGGCGAC CACTCCGGTC AACGCCGAAA TTCCGCGGGC ACTGGTCACG GGCGCGGCGC CGGTCGGTGA CCGGCGGGAC CGGTGGGACA CCAGGTAG
|
Protein sequence | MSRTKKSIVV VMMGSAGLFL SAPLLGPSAN ATPTRGGVPC VGILQQVISR PGDIPQALTE TARSFTNPGQ PAPPVVRPPA SSSSSVGTPP VPPTPPGSVV RPSSGATPPV PPTPGTPAST TTGVGTPPVP PTPPGSTVRP AAGATPPAPP VPGVPAGTPI GGGTPPLPPV PGAPAGTPVA NVAPPSPPVP GVPVIGDGGA ALPPLPPVPG GPAAVPAGVV TPPAPPIPGG PAAMPAGVAA PPAPAPPGAP IFGEAGAVPP PGVGGAPLDG ASGVAAPGGP GGGAGAPGAP VAAAAGNAGP PAPGAPVGDQ AGVVAPPAPP APGAPVGDQA GLVAPPGPPA PGVPVVDQAG VVAPPGPPAP GVPVVDEAGV VTPPGPGAPG VPVVGEAGVV TPPGPGAPGV PVVDEAGVVT PPGPGAPGVP VVDEAGVVTP PGPGAPGVPV VDEAGVVTPP APGAPGVPVD GGAELVTPPG PGAPGTPTVS SVETFSPPAP PAPGTPSSGS IETFSPPAPP TPGTPANSSV EIVTPPPPGV PGVPGEGSTT YTTPPTPEIT LNPANSSIDV ATPPGPGVPG VPVEASANVS TPPVPGVPGA PVNSSVEVAT PAEVGVPGTP IERSTTLTTP PTPGVPGTPV NSSVEVATPP APGAPGVPVV DEAGVVTPPG PGAPGVPVVG EAGVVTPPGP GAPGVPVVDE AGVVTPPGPG APGVPVVGEA GVVTPPGPGA PGVPVVDEAG VVTPPGPGAP GVPVVGEAGV VTPPGPGAPG VPVVDEAGVV TPPGPGAPGV PVVDEAGVVT PPGPGAPGVP VVDEAGVVTP PAPPAAAPGA PIDAAAASVA PSGPPAAPVL GEAGVVAPPA PPGGGAPGGG APGAGVGTGA PIEGAAGAGG VPAAPLAANA GAATPPAAAT GGAGAPIDAA AGAAAPPAPP APGAPIFGEA GVAAPPLPPA PGGAGAVPAG VVTPPVPGVP GGAGAVPAGA VTPPTPPVPG SSSGGFVNYP APPVPPTPPN SAGVNTGTPG SPIPGTPGST LTISDLLTPP GVARTVQNTA SSVMSIAPPG TPPVPGGAGS VSVGVPAPPS PLTPLAATGL SNLVSPPSLT IPSIPGLPVP LPNEVPVPSD LLCVGTDWSA TQGDSATTPV NAEIPRALVT GAAPVGDRRD RWDTR
|
| |