| Gene Information Plasmid Coverage information Fosmid Coverage information Sequence |
Gene Information |
| Locus tag | Mmcs_2996 |
|---|
| Symbol | |
|---|
| ID | 4111828 |
|---|
| Type | CDS |
|---|
| Is gene spliced | No |
|---|
| Is pseudo gene | No |
|---|
| Organism name | Mycobacterium sp. MCS |
|---|
| Kingdom | Bacteria |
|---|
| Replicon accession | NC_008146 |
|---|
| Strand | - |
|---|
| Start bp | 3164737 |
|---|
| End bp | 3167052 |
|---|
| Gene Length | 2316 bp |
|---|
| Protein Length | 771 aa |
|---|
| Translation table | 11 |
|---|
| GC content | 77% |
|---|
| IMG OID | 638032124 |
|---|
| Product | hypothetical protein |
|---|
| Protein accession | YP_640159 |
|---|
| Protein GI | 108799962 |
|---|
| COG category | |
|---|
| COG ID | |
|---|
| TIGRFAM ID | |
|---|
| 
|
Plasmid Coverage information |
| Num covering plasmid clones | 9 |
|---|
| Plasmid unclonability p-value | 0.438367 |
|---|
| Plasmid hitchhiking | No |
|---|
| Plasmid clonability | normal |
|---|
| |
Fosmid Coverage information |
| Num covering fosmid clones | n/a |
|---|
| Fosmid unclonability p-value | n/a |
|---|
| Fosmid Hitchhiker | n/a |
|---|
| Fosmid clonability | n/a |
|---|
| |
Sequence |
| Gene sequence | GTGCCCGCGG CGGGCGCCGG TGGCGGCGCG GTTCCTCCGG CGCCTGCTGC GCCGGGTGCG
CCGGTGGCCG CTTCGGGTGG AGTCGGCGCA CCGGCTGCTC CGCCTGCCGT GCCTGCCGGT
GTCGTCGACT CGTCGAGCGG TGTGACGCCG CCTGCGCCCG CAGCCCCGCC GGCTGGCGTG
GTTCAGCCTG CGGCCGGTGC GGTACCGCCC GCGCCAAGCG CGGTGGGTGC CCCGGCTGGT
GGTTCGGGCG GAGCGGGCGC TCCTGCTGCG CCTCCGGCTC CGCCTGCGGC GGTGGTTGAG
CCCGCCGCCG GTGCGACGCC GCCTGCTCCG CCGGCCCCGC CCGCGGCGGT GGTTGAGCCG
GCTTCGGGTG TGACGCCGCC TGCGCCTCCG GCGCCGGGTG GTCCGGCGGG TGGTTCGGGT
GGTGCGGTGA CGCCTCCGGG TCCGCCGGCT CCGCCTGCGG CGGTGGTTGA GCCGGCTTCG
GGTGTGACGC CGCCTGCGCC TCCGGCGCCG GGTGGTCCGG CGGGTGGTTC GGGTGGTGCG
GTGACGCCTC CGGGTCCGCC GGCTCCGCCT GCGGCGGTGG TTGAGCCCGC TGCCGGTGTG
ACGCCTCCGG GTCCGCCGGC TCCGGGTGGT CCGTCCGTGA GTTCGGTCGA GAACGTGTCG
CCTCCGGCTC CGCCGGCTCC GCCTGCGGCC ACCGTGGATT CCGCGAGTGG TGTGACGCCG
CCTGCGCCTC CGGCGCCGGG TGGTCCGTCC GTGAGTTCGG TGGAGAACGT GTCGCCTCCG
GCTCCGCCGG CTCCGGGTGG TGGTTCGTCG AGCACGGTGG AGCGGTTCTC GCCGCCGGCC
CCGCCTGCAC CAGCTGTACC GGCTGCGAAT TCTGTTGAGG CCGTTACGCC TCCGGCTCCT
CCGGCCCCAG GTGGTCCGTC CGTGAGTTCG GTGGAGAACG TGTCGCCTCC GGCTCCGCCG
GCTCCGGGTG GTGGTTCGTC GAGCACGGTG GAGCGGTTCT CGCCGCCGGC CCCGCCTGCA
CCAGCTGTAC CGGCTGCCAA TTCTGTTGAG GCCGTTACGC CTCCGGCTCC TCCTGCGCCG
CCTGCTGCGG TGGTGGAGCC TGCTGGTGCG GTGACGCCTC CGGCGCCTCC TGCGCCGCCT
GCTGCGGTGG TGGAGCCTGC TGGTGCGGTG ACGCCTCCGG CGCCTCCCGC GCCGCCTGCT
GCGGTGGTGG AGCCTGCTGG TGCGGTGACG CCTCCGGCGC CTCCCGCGCC GCCTGCTGCG
GTGGTGGAAC CTGCTGGCGC AGCGACCCCT CCGGCTCCGG CTGGTCCTCC GGCGGGTGTG
GTTGAGCCTG CTGCGGGTGC TGTGCCTCCG GCTCCGGCTG GTCCTCCGGC GGGTGTGGTT
GAGCCTGCTG CGGGTGCTGT GCCTCCGGCT CCGGCTGGTC CTCCGGCGGG TGTGGTTGAG
CCTGCTGCGG GTGCTGTGCC TCCGGCTCCG GCTGGTCCTC CGGCGGGTGT GGTTGAGCCC
GCTGCAGGTG CTGCACCCGC CGCTGCGGCT GGTCCCGGCG CACCGGGTGG TGGCTCCGGC
GGAGTGGGCG CCCCGCCTGC ACCGCCCGCG CCGCCGGCCG CCGCGGTCCA GCCCGCCGCC
GCTGCAGTGC CTCCGGCTCC GCCTGCGCCG CCCGCTGCGG TAATGCAACC CGCCGCCGGG
GTCGCTCCGC CTGCACCTCC GGCCCCGCCG GCTGCCGTGG TTCAGCCTGC TGCCGCTGTC
GCGCCGCCGG CACCGCCTGC ACCGCCTGCC GCGGTGGTGG AACCGGCTGC CGCCGTCGCC
CCGCCGGCGC CCCCGGCCCC GGGTGTCCCG GCTGCCAGCT CGGTCCCCGC CGTGACGCCG
CCCGCTCCGC CCGCGCCTCC CGGCGGTGGT TCGGCCACGG TGAACGTGGG CACGCCGCCG
GCGCCTCCGG CACCGCCGGC AGGTGGGTCG ACTGCGGTGA ACATCCCGAC GCCGCCATAC
CCCGCCGCGC CCGGTGCGTC GGCCAGTGGT TCGGGCGTTA CGCCTCCCGG GGTGTTCCCG
CCGCTCGAGG GTGCAGCAGC GGTGTTCGAC CGCCTGCTGC CGGGGGCTCC GACACCCGGT
GCGCCGGGTG CCGCGGCCAA CGGTCCGTGG GACTTCATCC CAACGATCCA GGTTCCGCAG
ATCCCGGGTC TGCCGGTTCC GCTGCCCACG GAGATCGGGC CGCCCAGTGA CGGCATCTGC
GCCGGAACCG GTGGGCTGTG GTCGGCAAGC GCCGCTCCCG GGGCCACGCC GGCCACGGCA
CCGGCCAGCC CGGTCTCGGA CCGTCGCGAT TGGTGA
|
|---|
| Protein sequence | MPAAGAGGGA VPPAPAAPGA PVAASGGVGA PAAPPAVPAG VVDSSSGVTP PAPAAPPAGV
VQPAAGAVPP APSAVGAPAG GSGGAGAPAA PPAPPAAVVE PAAGATPPAP PAPPAAVVEP
ASGVTPPAPP APGGPAGGSG GAVTPPGPPA PPAAVVEPAS GVTPPAPPAP GGPAGGSGGA
VTPPGPPAPP AAVVEPAAGV TPPGPPAPGG PSVSSVENVS PPAPPAPPAA TVDSASGVTP
PAPPAPGGPS VSSVENVSPP APPAPGGGSS STVERFSPPA PPAPAVPAAN SVEAVTPPAP
PAPGGPSVSS VENVSPPAPP APGGGSSSTV ERFSPPAPPA PAVPAANSVE AVTPPAPPAP
PAAVVEPAGA VTPPAPPAPP AAVVEPAGAV TPPAPPAPPA AVVEPAGAVT PPAPPAPPAA
VVEPAGAATP PAPAGPPAGV VEPAAGAVPP APAGPPAGVV EPAAGAVPPA PAGPPAGVVE
PAAGAVPPAP AGPPAGVVEP AAGAAPAAAA GPGAPGGGSG GVGAPPAPPA PPAAAVQPAA
AAVPPAPPAP PAAVMQPAAG VAPPAPPAPP AAVVQPAAAV APPAPPAPPA AVVEPAAAVA
PPAPPAPGVP AASSVPAVTP PAPPAPPGGG SATVNVGTPP APPAPPAGGS TAVNIPTPPY
PAAPGASASG SGVTPPGVFP PLEGAAAVFD RLLPGAPTPG APGAAANGPW DFIPTIQVPQ
IPGLPVPLPT EIGPPSDGIC AGTGGLWSAS AAPGATPATA PASPVSDRRD W
|
|---|
| |