Gene Information Plasmid Coverage information Fosmid Coverage information Sequence |
Gene Information |
Locus tag | MCAP_0498 |
Symbol | |
ID | 3829116 |
Type | CDS |
Is gene spliced | No |
Is pseudo gene | No |
Organism name | Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343 |
Kingdom | Bacteria |
Replicon accession | NC_007633 |
Strand | - |
Start bp | 591477 |
End bp | 595691 |
Gene Length | 4215 bp |
Protein Length | 1404 aa |
Translation table | 4 |
GC content | 21% |
IMG OID | 637823654 |
Product | hypothetical protein |
Protein accession | YP_424471 |
Protein GI | 83319955 |
COG category | [U] Intracellular trafficking, secretion, and vesicular transport |
COG ID | [COG0342] Preprotein translocase subunit SecD |
TIGRFAM ID | |
|
|
Plasmid Coverage information |
Num covering plasmid clones | 3 |
Plasmid unclonability p-value | 1 |
Plasmid hitchhiking | No |
Plasmid clonability | normal |
| |
Fosmid Coverage information |
Num covering fosmid clones | n/a |
Fosmid unclonability p-value | n/a |
Fosmid Hitchhiker | n/a |
Fosmid clonability | n/a |
| |
Sequence |
Gene sequence | ATGAAAAATA GATTAGCTAG CTTTAAAAAA ATTCTACGTT TTATTATTAT GCTAATCCTT ATTTTAACTT TACTAACTGG AATTGGTTTT TCTAGTTATA AAATAGCTAA TAATACTTTG TATGGTTCTA AGTTTGTTGG TGGTTATCAA GCTTTAGTTG GTGTTTATGA TAAAACTAAA AATCAAGAAG AAGAAATTCC AAATGGTGAT GCTTTTAAAG GGGCTAAATC ATTAGAAAAA AAACTATCTC CATTTTCTGA TAATACTATT GAAACTCAAC AAGCTGGTCT TTCACGTGTT TTTATTAAGG CTTCAAAAAA AGCTTATTCT AATAATCAAG ATGATTTTAA AAACGCCATT GAAAGAACTG GTGATTTGTT TATTTTAGAT AAAAATTATC AAGATATTTT CTTTAATGAA GAATTAATGA AAATTATTGG AGTTGGTGAA GTTTATTCAA AAAACTCTTC TGATAAAAGA ATTAATAAAA AACTTACTTT AGAAGAATTT TTAGGTGAAG CAAAAGCTGA ATCACTACAA CCTGCTAACT TTTCAAATAA AAACTCTCCT TTTGTTAGTT TTAATTTAAA AAATGAGTAT TTAAAAAATT TAATAGATCC TAAAAAAAAT AAAGACAGCA ATTCATTAAC TATGATTACT TCAGTTGGTC ATGTTATTGA AACATTAAGA ACTTATTATA AAAAAGCAAA TTCAACTAAT AAACAAGTTA TTGAAAAATA TTTAAATACC TATTTTAATC AAATTATTAA ACCAATTCAA GATTATATTA GTAGTCATTC ATCAGATACT TTAGCAGTCA AAACTTTAAA AGATTTATTT TCTATTGAAT ATAGTACAAC CACTACAGAA GGTACATCTG GAAATTTAGC TATTCAAAGA ACTAGTTTAG TTGATTCTAA AATTAATAAA TGATGAAAAA GTAATCAAAC AGGTAAAATT GAAAATACTA GTGATCTAAA ATATGTTTTG TTTGGAACTA ATAATTTAGA TAAAAAAAAT GATAGACACA TTTTTAGATT TACAAATTCA GCTAATAAAT TTTTATATGA TGCTAATGCT AGTGAAAAAG ACTTTATTAA AGATGATAAA GGTAATGTTG GTAAATATTA TAATAAGTTA AAAATTAGTA GTGATAATAG TATTTCACAA GATGAAGAAT TAGATTATAT TGATAAAGTT TCTAATAAAT TAATTTCAAT AATAATGACT GAAATTTTAT TTAAAAAAGA TACAACTGAT AAAGATCATG TTGTTAATAG AAACTTAGAT CAAGCTTTAT TTAGAAATAA TGTTTTATTG CACAATAATC AAATATCACC AGATAATACT AGAATAGTTA CAACTAATCC TGCTATTGTT ACAGATAGAA AAACTCAAAC AACTAAACTT TATATTCCTG TATGAAGTAA TACAATGGCA AAACAAGTTG AATCTGATAT TTTACAAACT TCATTAGGAT ATACTTTTAA AGTTTTATCA ATTAAAGAAT TTAGTGCTGA TATTACTAAC ATAATGTTAA TTATTACTTT AGGATGTTTA GTAATTTTAG CATTAGCAGT TTTAGTGTTT ATGGTATTTT CATATAGACT ATTAGGGTTA TTTGCAATTG TTCTTGCTGC AATTTCAGCC TCACTAACAA TGTTAGTACC AATTATTTTT AATATGGCAA TTGGTCCTGA AATCTTTATG ATAATGTTTG TTGGTATTGG TTTAATATTA GATGCAAGTA TTATTTATTT TGAAAATCTA AAAACTCATA TTTATAAAGA AAAATTATCT CCAGAATCTT CATTTAAGAT TAGTAATAAA GATACTTTAA CTATTTTATT AGATACATCA TTTATTATTT TAATTCCAAA TATTTTATTA TTCATTTTTG GATCTGGAGC TTTAAAAAAT CTAGCTACAA TTAGTGTTAT TAATATATTA ATAGTTATTT TATTTGTTAT TTTAGGTTTA CGTTTATTAA CTTGAATAGT TTTAAAAGCC AAGCTATTTA CAAAATACCC TTGATTATTA CCACTAAACA CTTTAAAAAA TTCTCAATCA AGTTGATCTA ATGATTTAAT GTTAAGTATT TATTCATCAA GAATTGAAAA CTTAAACTCT AAATTAAAAC TAACTACTAA AGATTTAATT AAGTTGAAAA AATTTAAAGA TAAATATAAT TTCTATTTAA ATAAACAACA ACAAATTATT AAATCTAAAA AAGAAAATAG ACTAAAAAAA GATCAAATTA AATTAGAATC TGTAAATAAT TCTTTATTAA AACTTGAAGA TAAAAGAGAA AAACTAACTA CTAAAGATTT AATTAAGTTG AAAAAATTTA AAGATAAATA TAATTTCTAT TTAAATAAAC AACAACAAAT TATTAAATCT AAAAAAGAAG AAACTAGAGA ATACAAAACT ATTCAAGCTA AATTAGAGTT ATTAAATAAA CGCTTATTAA AATTTGAAAA CAAAATTTCA AAAAAAGCTA ATAGAAACTC TTTAATTAAA TCATCAATAA AAAATAATTT AATAAAACAA GAATATTTAA AAGCTAGAAT TGATGAATTA ACATCAAATC AAGTATTAGA AAGTTTAGAA AATAAAAACA ATCAAAGAAA GATTTTTAAA GTTAATAAAA TATTTACAAT TATTTTTATA ATTTGTACTT TTTTAGGAGC GATTATTGGA TTTACAATTG GTCCAAATTA TAGCTCAAGT TTTGGAAAAA GTCTTTCAGT TATTGCTTAT GGTCAAAAAG TTAATGATAT TTATGATAAT TTAGATGAAT CAATAAGAAA CTATAAACAA TTTGATAAAT CTACTAAAAG AGGTAAAGAA ATTGTTAAGA TGGGTGAGTA TCTTGAAAGA GTTAAATCTA GTCAAGATGC TTATATGAAA TCAATATTAA ACAAAAGCTA TGCTGATTTA GATAAAGTTA ATAAAAATCG ATGAGCTAGT TATGTTGTAG CTCAAATTTA TAAAGAAATT GTTAATAAGA ATTATGTAAG TTTATGAAAA AACCCAGTTT CTTATAACAA ATATTTTAGA GCTAGTGTTG ATGTTGATTA TGGTTATGAT TTTGTTGATA CTAATAATAA GGATCTTGAT AATAAACAAT TAGCTTATGT AAGTTTTAGA ATAATTAATG CTAAAGATAA TAGAATTATT AATATTTTTG AAAAATTATT TGTTAGAGAT AATTTACAAA ACCCAGATTT ATCTATTAGA TATGATCATG ATGATAATAA TTCAGCTAGT GGTATTATTA ATTTAGTAAA TATACCAGTT ACTGCATATG GTGAAATTAA AAATATAGCA ATTATATTTG CAATTACTTT ATTAGCATTA TTGATTTACA TTTTAATTAG ATTTAAATGA ACTTATTTTG TAGCTTTAGC ATTAACATTG ATTTTAACAA TAGTTTTAGT AAGTTCATTG GTAATTATTT TTAGAGTACC AGTTGGAATT GAAATTTTAA GTGCTATTTT AGCTGTACTA AGCTTTACTA TTATTACTTG TGTGCTATTT TTAGGAAAAG GTAAATCAAT TATTAAATCA AAAGATAATA AAACTTTTTC TGAAATTTTT GAAAAAGAAA TACTTGCTTA TTCAAATAAA AAAGTTACTA GATATCAAGT AGATAATAAA ATTCATAAAC TTAAAGTTGA ATATAAAAAT AATAAAAAGA ATTTAATTAA ACAACAATTA GAATCAAAAA ATATTAAATC TATATTAGCT AAAATGTTTT TTAAACTAAA ACAAAACTTA AAATTACGTT TTAATAAAAA TCACAATCAG TTATATAAAA ACTTAAAATT TGAAATTAAA GAAAATAAAA AGATTTTAAA ACATCATAAA AAACATACTA AAATTGAAAT TGATTTAATT GCTAATAATA ATCCTTTTTT AAAAGAAACT TTTATTAATG TTTTTAAATT TGGTATGAAT AGAAGTTTTT TAGTAACAAT AATTTATATA GTTTATGCTT TAATAATTTC ATTTGGTATG TATTCAATTA TTGGGATGGG ATTAACTATT AGTATTGGTA TTTTAATAGC TAGTTTAGTT TCACTATTGA TTGCTTTACC TATTTGAATT TGATTAGAAA AAAAACGTAT GATACATGTT TTAGGATATA GATACTATGT TCAAAACTTT AAAATAAATC AAGAAGAACA AATCATTAAT GGAATTAATG ATTAG
|
Protein sequence | MKNRLASFKK ILRFIIMLIL ILTLLTGIGF SSYKIANNTL YGSKFVGGYQ ALVGVYDKTK NQEEEIPNGD AFKGAKSLEK KLSPFSDNTI ETQQAGLSRV FIKASKKAYS NNQDDFKNAI ERTGDLFILD KNYQDIFFNE ELMKIIGVGE VYSKNSSDKR INKKLTLEEF LGEAKAESLQ PANFSNKNSP FVSFNLKNEY LKNLIDPKKN KDSNSLTMIT SVGHVIETLR TYYKKANSTN KQVIEKYLNT YFNQIIKPIQ DYISSHSSDT LAVKTLKDLF SIEYSTTTTE GTSGNLAIQR TSLVDSKINK WWKSNQTGKI ENTSDLKYVL FGTNNLDKKN DRHIFRFTNS ANKFLYDANA SEKDFIKDDK GNVGKYYNKL KISSDNSISQ DEELDYIDKV SNKLISIIMT EILFKKDTTD KDHVVNRNLD QALFRNNVLL HNNQISPDNT RIVTTNPAIV TDRKTQTTKL YIPVWSNTMA KQVESDILQT SLGYTFKVLS IKEFSADITN IMLIITLGCL VILALAVLVF MVFSYRLLGL FAIVLAAISA SLTMLVPIIF NMAIGPEIFM IMFVGIGLIL DASIIYFENL KTHIYKEKLS PESSFKISNK DTLTILLDTS FIILIPNILL FIFGSGALKN LATISVINIL IVILFVILGL RLLTWIVLKA KLFTKYPWLL PLNTLKNSQS SWSNDLMLSI YSSRIENLNS KLKLTTKDLI KLKKFKDKYN FYLNKQQQII KSKKENRLKK DQIKLESVNN SLLKLEDKRE KLTTKDLIKL KKFKDKYNFY LNKQQQIIKS KKEETREYKT IQAKLELLNK RLLKFENKIS KKANRNSLIK SSIKNNLIKQ EYLKARIDEL TSNQVLESLE NKNNQRKIFK VNKIFTIIFI ICTFLGAIIG FTIGPNYSSS FGKSLSVIAY GQKVNDIYDN LDESIRNYKQ FDKSTKRGKE IVKMGEYLER VKSSQDAYMK SILNKSYADL DKVNKNRWAS YVVAQIYKEI VNKNYVSLWK NPVSYNKYFR ASVDVDYGYD FVDTNNKDLD NKQLAYVSFR IINAKDNRII NIFEKLFVRD NLQNPDLSIR YDHDDNNSAS GIINLVNIPV TAYGEIKNIA IIFAITLLAL LIYILIRFKW TYFVALALTL ILTIVLVSSL VIIFRVPVGI EILSAILAVL SFTIITCVLF LGKGKSIIKS KDNKTFSEIF EKEILAYSNK KVTRYQVDNK IHKLKVEYKN NKKNLIKQQL ESKNIKSILA KMFFKLKQNL KLRFNKNHNQ LYKNLKFEIK ENKKILKHHK KHTKIEIDLI ANNNPFLKET FINVFKFGMN RSFLVTIIYI VYALIISFGM YSIIGMGLTI SIGILIASLV SLLIALPIWI WLEKKRMIHV LGYRYYVQNF KINQEEQIIN GIND
|
| |