Gene MCAP_0498 details

Gene Information       Plasmid Coverage information       Fosmid Coverage information       Sequence       

Gene Information

Locus tagMCAP_0498 
Symbol 
ID3829116 
TypeCDS 
Is gene splicedNo 
Is pseudo geneNo 
Organism nameMycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343 
KingdomBacteria 
Replicon accessionNC_007633 
Strand
Start bp591477 
End bp595691 
Gene Length4215 bp 
Protein Length1404 aa 
Translation table
GC content21% 
IMG OID637823654 
Producthypothetical protein 
Protein accessionYP_424471 
Protein GI83319955 
COG category[U] Intracellular trafficking, secretion, and vesicular transport 
COG ID[COG0342] Preprotein translocase subunit SecD 
TIGRFAM ID 


Plasmid Coverage information

Num covering plasmid clones
Plasmid unclonability p-value
Plasmid hitchhikingNo 
Plasmid clonabilitynormal 
 

Fosmid Coverage information

Num covering fosmid clonesn/a 
Fosmid unclonability p-valuen/a 
Fosmid Hitchhikern/a 
Fosmid clonabilityn/a 
 

Sequence

Gene sequence
ATGAAAAATA GATTAGCTAG CTTTAAAAAA ATTCTACGTT TTATTATTAT GCTAATCCTT 
ATTTTAACTT TACTAACTGG AATTGGTTTT TCTAGTTATA AAATAGCTAA TAATACTTTG
TATGGTTCTA AGTTTGTTGG TGGTTATCAA GCTTTAGTTG GTGTTTATGA TAAAACTAAA
AATCAAGAAG AAGAAATTCC AAATGGTGAT GCTTTTAAAG GGGCTAAATC ATTAGAAAAA
AAACTATCTC CATTTTCTGA TAATACTATT GAAACTCAAC AAGCTGGTCT TTCACGTGTT
TTTATTAAGG CTTCAAAAAA AGCTTATTCT AATAATCAAG ATGATTTTAA AAACGCCATT
GAAAGAACTG GTGATTTGTT TATTTTAGAT AAAAATTATC AAGATATTTT CTTTAATGAA
GAATTAATGA AAATTATTGG AGTTGGTGAA GTTTATTCAA AAAACTCTTC TGATAAAAGA
ATTAATAAAA AACTTACTTT AGAAGAATTT TTAGGTGAAG CAAAAGCTGA ATCACTACAA
CCTGCTAACT TTTCAAATAA AAACTCTCCT TTTGTTAGTT TTAATTTAAA AAATGAGTAT
TTAAAAAATT TAATAGATCC TAAAAAAAAT AAAGACAGCA ATTCATTAAC TATGATTACT
TCAGTTGGTC ATGTTATTGA AACATTAAGA ACTTATTATA AAAAAGCAAA TTCAACTAAT
AAACAAGTTA TTGAAAAATA TTTAAATACC TATTTTAATC AAATTATTAA ACCAATTCAA
GATTATATTA GTAGTCATTC ATCAGATACT TTAGCAGTCA AAACTTTAAA AGATTTATTT
TCTATTGAAT ATAGTACAAC CACTACAGAA GGTACATCTG GAAATTTAGC TATTCAAAGA
ACTAGTTTAG TTGATTCTAA AATTAATAAA TGATGAAAAA GTAATCAAAC AGGTAAAATT
GAAAATACTA GTGATCTAAA ATATGTTTTG TTTGGAACTA ATAATTTAGA TAAAAAAAAT
GATAGACACA TTTTTAGATT TACAAATTCA GCTAATAAAT TTTTATATGA TGCTAATGCT
AGTGAAAAAG ACTTTATTAA AGATGATAAA GGTAATGTTG GTAAATATTA TAATAAGTTA
AAAATTAGTA GTGATAATAG TATTTCACAA GATGAAGAAT TAGATTATAT TGATAAAGTT
TCTAATAAAT TAATTTCAAT AATAATGACT GAAATTTTAT TTAAAAAAGA TACAACTGAT
AAAGATCATG TTGTTAATAG AAACTTAGAT CAAGCTTTAT TTAGAAATAA TGTTTTATTG
CACAATAATC AAATATCACC AGATAATACT AGAATAGTTA CAACTAATCC TGCTATTGTT
ACAGATAGAA AAACTCAAAC AACTAAACTT TATATTCCTG TATGAAGTAA TACAATGGCA
AAACAAGTTG AATCTGATAT TTTACAAACT TCATTAGGAT ATACTTTTAA AGTTTTATCA
ATTAAAGAAT TTAGTGCTGA TATTACTAAC ATAATGTTAA TTATTACTTT AGGATGTTTA
GTAATTTTAG CATTAGCAGT TTTAGTGTTT ATGGTATTTT CATATAGACT ATTAGGGTTA
TTTGCAATTG TTCTTGCTGC AATTTCAGCC TCACTAACAA TGTTAGTACC AATTATTTTT
AATATGGCAA TTGGTCCTGA AATCTTTATG ATAATGTTTG TTGGTATTGG TTTAATATTA
GATGCAAGTA TTATTTATTT TGAAAATCTA AAAACTCATA TTTATAAAGA AAAATTATCT
CCAGAATCTT CATTTAAGAT TAGTAATAAA GATACTTTAA CTATTTTATT AGATACATCA
TTTATTATTT TAATTCCAAA TATTTTATTA TTCATTTTTG GATCTGGAGC TTTAAAAAAT
CTAGCTACAA TTAGTGTTAT TAATATATTA ATAGTTATTT TATTTGTTAT TTTAGGTTTA
CGTTTATTAA CTTGAATAGT TTTAAAAGCC AAGCTATTTA CAAAATACCC TTGATTATTA
CCACTAAACA CTTTAAAAAA TTCTCAATCA AGTTGATCTA ATGATTTAAT GTTAAGTATT
TATTCATCAA GAATTGAAAA CTTAAACTCT AAATTAAAAC TAACTACTAA AGATTTAATT
AAGTTGAAAA AATTTAAAGA TAAATATAAT TTCTATTTAA ATAAACAACA ACAAATTATT
AAATCTAAAA AAGAAAATAG ACTAAAAAAA GATCAAATTA AATTAGAATC TGTAAATAAT
TCTTTATTAA AACTTGAAGA TAAAAGAGAA AAACTAACTA CTAAAGATTT AATTAAGTTG
AAAAAATTTA AAGATAAATA TAATTTCTAT TTAAATAAAC AACAACAAAT TATTAAATCT
AAAAAAGAAG AAACTAGAGA ATACAAAACT ATTCAAGCTA AATTAGAGTT ATTAAATAAA
CGCTTATTAA AATTTGAAAA CAAAATTTCA AAAAAAGCTA ATAGAAACTC TTTAATTAAA
TCATCAATAA AAAATAATTT AATAAAACAA GAATATTTAA AAGCTAGAAT TGATGAATTA
ACATCAAATC AAGTATTAGA AAGTTTAGAA AATAAAAACA ATCAAAGAAA GATTTTTAAA
GTTAATAAAA TATTTACAAT TATTTTTATA ATTTGTACTT TTTTAGGAGC GATTATTGGA
TTTACAATTG GTCCAAATTA TAGCTCAAGT TTTGGAAAAA GTCTTTCAGT TATTGCTTAT
GGTCAAAAAG TTAATGATAT TTATGATAAT TTAGATGAAT CAATAAGAAA CTATAAACAA
TTTGATAAAT CTACTAAAAG AGGTAAAGAA ATTGTTAAGA TGGGTGAGTA TCTTGAAAGA
GTTAAATCTA GTCAAGATGC TTATATGAAA TCAATATTAA ACAAAAGCTA TGCTGATTTA
GATAAAGTTA ATAAAAATCG ATGAGCTAGT TATGTTGTAG CTCAAATTTA TAAAGAAATT
GTTAATAAGA ATTATGTAAG TTTATGAAAA AACCCAGTTT CTTATAACAA ATATTTTAGA
GCTAGTGTTG ATGTTGATTA TGGTTATGAT TTTGTTGATA CTAATAATAA GGATCTTGAT
AATAAACAAT TAGCTTATGT AAGTTTTAGA ATAATTAATG CTAAAGATAA TAGAATTATT
AATATTTTTG AAAAATTATT TGTTAGAGAT AATTTACAAA ACCCAGATTT ATCTATTAGA
TATGATCATG ATGATAATAA TTCAGCTAGT GGTATTATTA ATTTAGTAAA TATACCAGTT
ACTGCATATG GTGAAATTAA AAATATAGCA ATTATATTTG CAATTACTTT ATTAGCATTA
TTGATTTACA TTTTAATTAG ATTTAAATGA ACTTATTTTG TAGCTTTAGC ATTAACATTG
ATTTTAACAA TAGTTTTAGT AAGTTCATTG GTAATTATTT TTAGAGTACC AGTTGGAATT
GAAATTTTAA GTGCTATTTT AGCTGTACTA AGCTTTACTA TTATTACTTG TGTGCTATTT
TTAGGAAAAG GTAAATCAAT TATTAAATCA AAAGATAATA AAACTTTTTC TGAAATTTTT
GAAAAAGAAA TACTTGCTTA TTCAAATAAA AAAGTTACTA GATATCAAGT AGATAATAAA
ATTCATAAAC TTAAAGTTGA ATATAAAAAT AATAAAAAGA ATTTAATTAA ACAACAATTA
GAATCAAAAA ATATTAAATC TATATTAGCT AAAATGTTTT TTAAACTAAA ACAAAACTTA
AAATTACGTT TTAATAAAAA TCACAATCAG TTATATAAAA ACTTAAAATT TGAAATTAAA
GAAAATAAAA AGATTTTAAA ACATCATAAA AAACATACTA AAATTGAAAT TGATTTAATT
GCTAATAATA ATCCTTTTTT AAAAGAAACT TTTATTAATG TTTTTAAATT TGGTATGAAT
AGAAGTTTTT TAGTAACAAT AATTTATATA GTTTATGCTT TAATAATTTC ATTTGGTATG
TATTCAATTA TTGGGATGGG ATTAACTATT AGTATTGGTA TTTTAATAGC TAGTTTAGTT
TCACTATTGA TTGCTTTACC TATTTGAATT TGATTAGAAA AAAAACGTAT GATACATGTT
TTAGGATATA GATACTATGT TCAAAACTTT AAAATAAATC AAGAAGAACA AATCATTAAT
GGAATTAATG ATTAG
 
Protein sequence
MKNRLASFKK ILRFIIMLIL ILTLLTGIGF SSYKIANNTL YGSKFVGGYQ ALVGVYDKTK 
NQEEEIPNGD AFKGAKSLEK KLSPFSDNTI ETQQAGLSRV FIKASKKAYS NNQDDFKNAI
ERTGDLFILD KNYQDIFFNE ELMKIIGVGE VYSKNSSDKR INKKLTLEEF LGEAKAESLQ
PANFSNKNSP FVSFNLKNEY LKNLIDPKKN KDSNSLTMIT SVGHVIETLR TYYKKANSTN
KQVIEKYLNT YFNQIIKPIQ DYISSHSSDT LAVKTLKDLF SIEYSTTTTE GTSGNLAIQR
TSLVDSKINK WWKSNQTGKI ENTSDLKYVL FGTNNLDKKN DRHIFRFTNS ANKFLYDANA
SEKDFIKDDK GNVGKYYNKL KISSDNSISQ DEELDYIDKV SNKLISIIMT EILFKKDTTD
KDHVVNRNLD QALFRNNVLL HNNQISPDNT RIVTTNPAIV TDRKTQTTKL YIPVWSNTMA
KQVESDILQT SLGYTFKVLS IKEFSADITN IMLIITLGCL VILALAVLVF MVFSYRLLGL
FAIVLAAISA SLTMLVPIIF NMAIGPEIFM IMFVGIGLIL DASIIYFENL KTHIYKEKLS
PESSFKISNK DTLTILLDTS FIILIPNILL FIFGSGALKN LATISVINIL IVILFVILGL
RLLTWIVLKA KLFTKYPWLL PLNTLKNSQS SWSNDLMLSI YSSRIENLNS KLKLTTKDLI
KLKKFKDKYN FYLNKQQQII KSKKENRLKK DQIKLESVNN SLLKLEDKRE KLTTKDLIKL
KKFKDKYNFY LNKQQQIIKS KKEETREYKT IQAKLELLNK RLLKFENKIS KKANRNSLIK
SSIKNNLIKQ EYLKARIDEL TSNQVLESLE NKNNQRKIFK VNKIFTIIFI ICTFLGAIIG
FTIGPNYSSS FGKSLSVIAY GQKVNDIYDN LDESIRNYKQ FDKSTKRGKE IVKMGEYLER
VKSSQDAYMK SILNKSYADL DKVNKNRWAS YVVAQIYKEI VNKNYVSLWK NPVSYNKYFR
ASVDVDYGYD FVDTNNKDLD NKQLAYVSFR IINAKDNRII NIFEKLFVRD NLQNPDLSIR
YDHDDNNSAS GIINLVNIPV TAYGEIKNIA IIFAITLLAL LIYILIRFKW TYFVALALTL
ILTIVLVSSL VIIFRVPVGI EILSAILAVL SFTIITCVLF LGKGKSIIKS KDNKTFSEIF
EKEILAYSNK KVTRYQVDNK IHKLKVEYKN NKKNLIKQQL ESKNIKSILA KMFFKLKQNL
KLRFNKNHNQ LYKNLKFEIK ENKKILKHHK KHTKIEIDLI ANNNPFLKET FINVFKFGMN
RSFLVTIIYI VYALIISFGM YSIIGMGLTI SIGILIASLV SLLIALPIWI WLEKKRMIHV
LGYRYYVQNF KINQEEQIIN GIND