| Gene Information Plasmid Coverage information Fosmid Coverage information Sequence |
Gene Information |
| Locus tag | MCAP_0384 |
|---|
| Symbol | pheT |
|---|
| ID | 3828897 |
|---|
| Type | CDS |
|---|
| Is gene spliced | No |
|---|
| Is pseudo gene | No |
|---|
| Organism name | Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343 |
|---|
| Kingdom | Bacteria |
|---|
| Replicon accession | NC_007633 |
|---|
| Strand | + |
|---|
| Start bp | 475544 |
|---|
| End bp | 477928 |
|---|
| Gene Length | 2385 bp |
|---|
| Protein Length | 794 aa |
|---|
| Translation table | 4 |
|---|
| GC content | 19% |
|---|
| IMG OID | 637823541 |
|---|
| Product | phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta |
|---|
| Protein accession | YP_424364 |
|---|
| Protein GI | 83319488 |
|---|
| COG category | [J] Translation, ribosomal structure and biogenesis |
|---|
| COG ID | [COG0072] Phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit |
|---|
| TIGRFAM ID | [TIGR00472] phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit, non-spirochete bacterial |
|---|
| 
|
Plasmid Coverage information |
| Num covering plasmid clones | 2 |
|---|
| Plasmid unclonability p-value | 0.0776436 |
|---|
| Plasmid hitchhiking | No |
|---|
| Plasmid clonability | normal |
|---|
| |
Fosmid Coverage information |
| Num covering fosmid clones | n/a |
|---|
| Fosmid unclonability p-value | n/a |
|---|
| Fosmid Hitchhiker | n/a |
|---|
| Fosmid clonability | n/a |
|---|
| |
Sequence |
| Gene sequence | ATGATTATTA CAAGAAATTG ATTAAAAAAA TATCTTAATT TAGATAACAT TTCAAATGAT
CAAATTAATG TTGCTTTAAA TTCTTTAGGA TTTGAAGTTG ATAATGTTTA TGATTTAAAC
TCATTAAATT CTGAACTAGT TTTAGGGTAT GTAGAACAAT CAAAACAAAT TCCAGACACT
CATTTAAAAT TAAACAAAGT TAATATAGGA ACTAAAAGTT TACAAATTGT TTGTGGAGCT
AGTAATGTTG ATGTTAATCA ATTTGTAATT GTTGCTCCAA TTAATGCAAC TATTGCAAAC
GGTTTAACTT TAACTAGTAA AAAAATTCAA AATTATGAAT CACAAGGAAT GATTTGTGCT
TTAAATGAAA TTGGTATCAA CCAATCTGTT ATTAATAAAG AAGATCAGTT AAAAATTTAT
AATGTTTTTG ATAAAAATCT AGATTTAAAA AAATATTTAG GAAAAGATGT TAAACAAATT
ATTGGTTTAG ATGATTATTT ATTTGAAATT GATCTAACTT TAAATAGAAG TGATTGTTTA
GCTAGTTTTC AAATTTTAAA AGAACTTGCA AATTATTTTG ATTTAGAAAT TAAAAACTAT
GATAATAAAT TTAATGATTT TAAAGAAAAT GATTTAGATT TAAAAATAAC AATTAGTAAG
AAAATTGAAG AACAAATAAA AACTATTAGT TATTCAAATT TTGTTCTAAA TAATCATTTA
AATAAATTAG ATTCAATTGA TGATATTTTT TTAAAATTAA ATCAAATTAG TTCAACTAAT
AATTTAATAA ATGATCTAAG TTTACTTTCA ACACTTTCAA CAGCTCAAAC TCATATTTTA
ATTGATCTAG ATAAGTTAAA AAGTTTTAAT TTAAAATTAG AATTAATTAA TCATAATGAT
AAAGAACTTT TATGTTTAAC TAGTGATAAT CAAATAGTTA ATATTATAGG CTTACAAACT
GAATCTAAAT TTAGTATTGA TAACAATTCT AAAAATGTTT TAAACATTAT GGTAAATATT
GAACCTAATT TAATGAGAAA ACAACAAAAA CTTTTAAATA CTTCTAATAT TAATTTACAA
AGATACATTA AACCGATTAA TCCTAATTTA TTTGATTTAG CTAATTTAAA CTTGACTAGT
TTATTAAATA GTTATAATTT AGTTAATAAA GCTTATAAAG TTAAAGTTTT AAAGCAAACT
TATAAAAATA AAACTGAATT TGAAATTAAA ATATCTGAAA TTAATGATTT ATTAGGTACT
AATTTAACTA TTGATCAAAT TAAAAGTTTA TTTAAAAAGT TAGATTTTAA AATTACTAAT
AAAAATGATT TATTAACTTT TAATATTGAT CCAAATAGAA TTGATATATC AAGCAAAAAT
GATTTGTGTG AAGAAGTTGC TAGATTATAT TCATATGATA ATATTCAAGA AGTTGCTTTA
AGTTTTACTA GTTTTAAAAA ACCTAAAAAC TTAAATTTAA AATTAGAAAA TAAATTAACT
AATTATTTAA TTGGTTTAGG GTTTAATAAC ACTAAAACTT ATTCTTTAAC AACTCAAATT
GATGCAAAAC ATTGAAATTT ATTTAATATT TCAGATTTTA TAAATTTATT ATCGCCATTA
TCAAATTTAA GACAAACTTA TAGAACTAGT TTAAGTAAAT CATTAATTGA TACTGCTATT
TATAATCATT CTATTAATAA TAAAGAATTA AAGCTATTTG AAATTGCAGA TATTTATAAT
TTAAATCAAT TAAAACAAAG ACATTTAGTA TTTCTAACAA GCCATCATAT TTATAAAAAT
GGCTTAACTC ATCAGTTAGT TGAAAATAAT TTTTACTATA ATAAAGAAAT TTTAGAAAGT
ATTTTTGATT TATATAATTT AGATTTTAGT CAAATTAAAT ATGTTAATAA TTTAGATGTT
ATTAAAGAAA TTCATCTTTA TATTAATGCA ACTATTTATT ATCAAAAACA ATTAGTTGGT
TTTATTTATC AGTTAAATCC TAAATTTGAA TCTGAAAATA AGTTGAATAA AACTTTTGTT
TGTGAGATTA ATTTAGATGT TTTAAATGAA TTAAAAAATA AAACTATAGA AGCAAAAACA
CTAAGTAAAT TTCAAAGTTC TTCAAGAGAT TTAACAATAG AAATTTCAAA TGATCTAATT
TATCAAGATG TTTTATTAAA AGCTATTAGT GATGTTAAAT ATATAACTAG TAGTAAAGTT
GTAGATTTAT ATTTAGATGA TAAACTAGCT AAAAATAATA CAAAAGCTTT AACTATTCAA
TTTATATTTA ATGATTTAGA TCATCAATTA ACTGAAGCTG AAATTAATAC AGAATTTGAA
AAAATTATTT CTAATGTTAA AAAAATGAAA GTAGTGATTA GGTAA
|
|---|
| Protein sequence | MIITRNWLKK YLNLDNISND QINVALNSLG FEVDNVYDLN SLNSELVLGY VEQSKQIPDT
HLKLNKVNIG TKSLQIVCGA SNVDVNQFVI VAPINATIAN GLTLTSKKIQ NYESQGMICA
LNEIGINQSV INKEDQLKIY NVFDKNLDLK KYLGKDVKQI IGLDDYLFEI DLTLNRSDCL
ASFQILKELA NYFDLEIKNY DNKFNDFKEN DLDLKITISK KIEEQIKTIS YSNFVLNNHL
NKLDSIDDIF LKLNQISSTN NLINDLSLLS TLSTAQTHIL IDLDKLKSFN LKLELINHND
KELLCLTSDN QIVNIIGLQT ESKFSIDNNS KNVLNIMVNI EPNLMRKQQK LLNTSNINLQ
RYIKPINPNL FDLANLNLTS LLNSYNLVNK AYKVKVLKQT YKNKTEFEIK ISEINDLLGT
NLTIDQIKSL FKKLDFKITN KNDLLTFNID PNRIDISSKN DLCEEVARLY SYDNIQEVAL
SFTSFKKPKN LNLKLENKLT NYLIGLGFNN TKTYSLTTQI DAKHWNLFNI SDFINLLSPL
SNLRQTYRTS LSKSLIDTAI YNHSINNKEL KLFEIADIYN LNQLKQRHLV FLTSHHIYKN
GLTHQLVENN FYYNKEILES IFDLYNLDFS QIKYVNNLDV IKEIHLYINA TIYYQKQLVG
FIYQLNPKFE SENKLNKTFV CEINLDVLNE LKNKTIEAKT LSKFQSSSRD LTIEISNDLI
YQDVLLKAIS DVKYITSSKV VDLYLDDKLA KNNTKALTIQ FIFNDLDHQL TEAEINTEFE
KIISNVKKMK VVIR
|
|---|
| |