Gene Information Plasmid Coverage information Fosmid Coverage information Sequence |
Gene Information |
Locus tag | UUR10_0501 |
Symbol | pheT |
ID | 6984257 |
Type | CDS |
Is gene spliced | No |
Is pseudo gene | No |
Organism name | Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699 |
Kingdom | Bacteria |
Replicon accession | NC_011374 |
Strand | - |
Start bp | 552285 |
End bp | 554603 |
Gene Length | 2319 bp |
Protein Length | 772 aa |
Translation table | 4 |
GC content | 24% |
IMG OID | 643400072 |
Product | phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta |
Protein accession | YP_002284892 |
Protein GI | 209554347 |
COG category | [J] Translation, ribosomal structure and biogenesis |
COG ID | [COG0072] Phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit |
TIGRFAM ID | [TIGR00472] phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit, non-spirochete bacterial |
|
|
Plasmid Coverage information |
Num covering plasmid clones | 10 |
Plasmid unclonability p-value | 1 |
Plasmid hitchhiking | No |
Plasmid clonability | normal |
| |
Fosmid Coverage information |
Num covering fosmid clones | n/a |
Fosmid unclonability p-value | n/a |
Fosmid Hitchhiker | n/a |
Fosmid clonability | n/a |
| |
Sequence |
Gene sequence | ATGATTTTAA GTTTAAATTT ATTGCATAAG ATTAGTCCAA AACTAAAAAA GATTTCTTTA AATGAATTAT GTACAGCTTT AATGGATTTA GGTTGTGAAG TTGAAACGAT TAATACCATT AAACCAAGTA CTAATTTAGT TTTTGCTAAA GTATTAGAAA AAACTAAACA TCCTAATGCT AATCATTTAA ATTTAGTTAA AGTTAAAGCA AATCAAGAAG TTTATGAAAT TGTTTGTGGT GCAGATAATT TTAATGTTAA CAATTGAGTT GTTTTAGCTA AGATAAATGC TGAATTAGCT AATGGTTTAA AAATTACACC ACGTGAACTA AGAGGGTATG TTTCAAATGG AATGTTGTGT GCTTATAGTG AAATTAATCC TGAAGTTGCT CATTTTTTAG GACAAACCGA TTTGGATGGA ATCTTAGTTT TACATGATAG TTATGATCAT TATAAAACAC CAAATCAAAT TTTTAATTTA GATGATGTTA TTTTAGATTT ATCAATTCCC TCAAATCGAA ATGATTTAAA TGGTTATTTT TGAATGGCTA AAGAACTATG TGCTTATTTT GATTTAGAAT ATGTAATTGA TGCGACAATT AACCATCGCT CACATAAAGA GATCGTTAAT GTAAGAATTT TATCTGATGA TGTTAATTCA TATGGAATGA TTGAAGTTAA AAATATTCAA AACTATACTT TAAAATGAAA TACTAAAAGT GTATTAGTTA ATAACCAAAT CAAAATTGTT AATAATTTCG CTGATAACAT GAATTTTTTA ACACTACTAA CTGCTAATCC TCTTCATGCT TTTGATGCAC ATAAGATTAG TGGTCAAATT ATTGTTAAAA ACGCTGAAGA AGATAGTATT TTATTAGGTT TAGATCAAAA AGAGTATGCA ATTAAAAAAG GTGATCTAAT TATTGTAGAT GATCAAAAGA TTTTAGCATT AGCTGGTATT ATTGGTTCAA ATGATTCTAA AATTGATAAT AATACAACAA CTGCTTATAT TGAATGCGCT AATTTTAATC CCTTATTAAT TGCAAACACT GCACGTCGTT TAAAAATTAA TACAACAGCA GCAATGCGTT TTAGTAAACC TTTAACTAAT TATGTTACTA AAGCTACTTT AAAAAAATTA TTAGCACATT TTAAATTAGA TGCAAAACTA ATTTGTTATT TCAAACATTT AGTTCATAAT GTTATTAAAA ATAAAATTGA TCAAGTAAGT GATTTTGTGG GTACAAAAAT TAATTTGGAC ACTGCACATA CTTTTTTAAA ACGTTTGGGC TATAAAATCA ATAAAACTAA TTTAATTACA CCAAGTCATC GATATGATGT TTTAAATGAG TTTGATGTTT ATGAAGATAT TATGAAAAAA TTTAGTATCC AACAAATTAA ACCCCAACCA ATTAATTTTG ATATTTTAAG TTTTAAAAAC AATATTGCTT ATGACTTTGA AAAAAAAGTT AGTGATTTTT TAGTTGATCA AGGATTGTTT GAATGTAAAA CTTATAATTT AAAAAGCCAA ACACAAGCTT ATGAAATTGA TTTCTTTAAT TTTCAACAAG CTTATGAAAT TAATAATCCA ATTTCAAATA TACGTTCACA TCTAAAACTA AATAATCTTA ATTCTTTACT TGAAGTATTA GAATACAATC AAAATCAAAA AAATGAATTA GAAAATATCT TTGAAATTTC AAAGATTAAT CCAATCAATT CAAATCAACA AACAATTTTA TCAATTGTTT TATGTAAACC ATTGATTAAT GCAAAACTTA ATGATTCAAT AGTAGTTAAT AATTTCGTAA CTACAAAAGC TTTATTACAC GTTTTATTAA CAAAATTAAA TATTAGTTAT GTATATGATA CAAATCATAT TGTTAATGAA CTATATGAAA ATAATCAATT AGCTTTAGTT AATGAAAACA AACAGGTTTT TGGTTTTATT GGTCAATTAA AAAATCAAAT CAAAAAAACA TATGGTTTAA ATAATGATAT TTTTGTTATT AATTTAAATT TAACTAGTTA TTTAAATCAA GAACAAGCAA TTACTAAAGT GATTAAACCA AGTGTATATC ATGATATAGT GCGTGATGTT AGTGTTAAAT TAGCTTCTAA TGTTGATTTA AATGATGTAA TGGATAATAT TGAAAAAATT AAAAATATTA GAAAAGTTGA AATTAGTGAT CTTTATGTAA AAGATGATGA AATCATTTAT ACTTTTAAAT ACTATATTAA TGATTACTCA TCTAATTTAA GTAGCGAGCA AATTGCAGTT ATTGAGCAAG AAGTTAATAA CTATTTAAAA CAATTCTAA
|
Protein sequence | MILSLNLLHK ISPKLKKISL NELCTALMDL GCEVETINTI KPSTNLVFAK VLEKTKHPNA NHLNLVKVKA NQEVYEIVCG ADNFNVNNWV VLAKINAELA NGLKITPREL RGYVSNGMLC AYSEINPEVA HFLGQTDLDG ILVLHDSYDH YKTPNQIFNL DDVILDLSIP SNRNDLNGYF WMAKELCAYF DLEYVIDATI NHRSHKEIVN VRILSDDVNS YGMIEVKNIQ NYTLKWNTKS VLVNNQIKIV NNFADNMNFL TLLTANPLHA FDAHKISGQI IVKNAEEDSI LLGLDQKEYA IKKGDLIIVD DQKILALAGI IGSNDSKIDN NTTTAYIECA NFNPLLIANT ARRLKINTTA AMRFSKPLTN YVTKATLKKL LAHFKLDAKL ICYFKHLVHN VIKNKIDQVS DFVGTKINLD TAHTFLKRLG YKINKTNLIT PSHRYDVLNE FDVYEDIMKK FSIQQIKPQP INFDILSFKN NIAYDFEKKV SDFLVDQGLF ECKTYNLKSQ TQAYEIDFFN FQQAYEINNP ISNIRSHLKL NNLNSLLEVL EYNQNQKNEL ENIFEISKIN PINSNQQTIL SIVLCKPLIN AKLNDSIVVN NFVTTKALLH VLLTKLNISY VYDTNHIVNE LYENNQLALV NENKQVFGFI GQLKNQIKKT YGLNNDIFVI NLNLTSYLNQ EQAITKVIKP SVYHDIVRDV SVKLASNVDL NDVMDNIEKI KNIRKVEISD LYVKDDEIIY TFKYYINDYS SNLSSEQIAV IEQEVNNYLK QF
|
| |