Gene Tery_3216 details

Gene Information       Plasmid Coverage information       Fosmid Coverage information       Sequence       

Gene Information

Locus tagTery_3216 
Symbol 
ID4243811 
TypeCDS 
Is gene splicedNo 
Is pseudo geneNo 
Organism nameTrichodesmium erythraeum IMS101 
KingdomBacteria 
Replicon accessionNC_008312 
Strand
Start bp4920861 
End bp4922648 
Gene Length1788 bp 
Protein Length595 aa 
Translation table11 
GC content43% 
IMG OID638108217 
Producthypothetical protein 
Protein accessionYP_722808 
Protein GI113476747 
COG category 
COG ID 
TIGRFAM ID 


Plasmid Coverage information

Num covering plasmid clones
Plasmid unclonability p-value0.00990527 
Plasmid hitchhikingNo 
Plasmid clonabilitydecreased coverage 
 

Fosmid Coverage information

Num covering fosmid clones
Fosmid unclonability p-value
Fosmid HitchhikerNo 
Fosmid clonabilitynormal 
 

Sequence

Gene sequence
ATGTCTAATA GCTATATTTA TGGTACTGGA GAAGACGATC TGCTATATGG TACCGGAGGA 
AACGATAAGG CGTATGGAAG CTCCGGAAAT GATATTATCG AAGGTAAAGG AGGTGATGAT
GAACTTTATG GTAATGGTGG GAATGACACA ATTAAAGGAG AAGAAGGCGA TGATACAGTT
TTAGGTCATC CTGGAGATGA CTCAATAGAA GGAAACGCAG GTGATGATAA GCTTTATGGT
GGTGATGGGG ATGACCTAGT CTCAGGGGGA GAAGGAAACG ATATGCAGAC TGGAGGAGGA
GGAAACGATA CCATAGAAGG AGGAGAAGGT GATGACAAAC TTTATGGAGG GCCTGATGAT
GACTTGATCA AGGGAGAAGA CGGTCAAGAT AAGCTTTATG GTAATGATGG GAATGACGCA
ATGGAAGGAG GTGCGGATGA TGACACAGTT TTAGGTCATG CTGGAGATGA CTCAATAGAA
GGAAATGCAG GTGATGATAA GCTTTATGGT GGTGATGGGG ATGACCTAGT CTCAGGGGGA
GAAGGAAACG ATATGCAGAC TGGAGGAGGA GGAAACGATA CCATAGAAGG AGGAGAAGGT
GATGACAAAC TTTATGGAGG CCCTGATGAT GACTTGATCA AGGGAGAAGA CGGTCAAGAT
AAGCTTTATG GTAATGATGG GAATGACGCA ATGGAAGGAG GTGCGGATGA TGACACAGTT
TTAGGTCATG CTGGAGATGA CTCAATAGAA GGAAATGCAG GTGATGATAA GCTTTATGGT
GGTGATGGGG ATGACCTAGT CTCAGGGGGA GAAGGAAACG ATATGCAGAC TGGAGGAGGA
GGAAACGATA CCATAGAAGG AGGAGAAGGT GATGACAAAC TTTATGGAGG GCCTGATGAT
GACTTGATCA AGGGAGAAGA CGGTCAAGAT GAGCTTTATG GTAATGATGG GAATGACGCA
ATGGAAGGAG GTGCGGATGA TGACACAGTT TTAGGTCATG CTGGAGATGA CTCAATAGAA
GGAAATGCAG GTGATGATTT ACTTTCTGGT GATTCTGGGG ATGACGTAGT CTCAGGCGGA
GAAGGAGAGG ATATACTGTA CGGAGGAGCA GGAAACGATG AACTTTATGG TGGTGATGAT
AATGATACCA TTGATGATGG TGGTGGGGAT GACATACTAG AAGGAAATAC GGGTAATGAT
ATACTTCGTG GTCGTGGAGG TCAAGACGAG CTCATAGGAG GTGATGGTGA TGACCTCATC
ATTAGTTATA GTGATGCAGG AGAACCTGAA ATTGCCCAAC AGACAAATGA ATCTAAGGTT
TATCCAGATC AACCCTTTTT TGAAGCTAAT GATACTTTAA CTGGAGGATC AGGGGCTGAT
ACTTTCCTAT TTAGACCGTT GATGAATGCC AAGCCTGAGA TTATTGAGAA ACACAATATG
CACAATATGC ACCAAGATAT GCATAATATG AACTTGCATA AACAAATCGC TGGCGAAAAT
GGTTCAGTCC ATGATCACTG GGTTGATAGT ATTGGTGATG ATATCATCCT TGACTTTAAT
AGAAGTGAAG GGGATAAAAT TGAGATTAAG GGTCATACAG TAAAAGTAGA AAAAATTGAA
GAGCTTGATG ATGGAAGTGG ATCTATTGTT CATTTAATTA GTGATCAAGG GGCTAATGGT
GGAGCCCACC ACCTAGATAA ACTAGGAACA ATTACTGTTT ATGGTGATCT GGTTACAGAA
TCAGATTTAA TAGCAGATAT CTTTGGGGAT GGTGCTGGTA TGGGTTGA
 
Protein sequence
MSNSYIYGTG EDDLLYGTGG NDKAYGSSGN DIIEGKGGDD ELYGNGGNDT IKGEEGDDTV 
LGHPGDDSIE GNAGDDKLYG GDGDDLVSGG EGNDMQTGGG GNDTIEGGEG DDKLYGGPDD
DLIKGEDGQD KLYGNDGNDA MEGGADDDTV LGHAGDDSIE GNAGDDKLYG GDGDDLVSGG
EGNDMQTGGG GNDTIEGGEG DDKLYGGPDD DLIKGEDGQD KLYGNDGNDA MEGGADDDTV
LGHAGDDSIE GNAGDDKLYG GDGDDLVSGG EGNDMQTGGG GNDTIEGGEG DDKLYGGPDD
DLIKGEDGQD ELYGNDGNDA MEGGADDDTV LGHAGDDSIE GNAGDDLLSG DSGDDVVSGG
EGEDILYGGA GNDELYGGDD NDTIDDGGGD DILEGNTGND ILRGRGGQDE LIGGDGDDLI
ISYSDAGEPE IAQQTNESKV YPDQPFFEAN DTLTGGSGAD TFLFRPLMNA KPEIIEKHNM
HNMHQDMHNM NLHKQIAGEN GSVHDHWVDS IGDDIILDFN RSEGDKIEIK GHTVKVEKIE
ELDDGSGSIV HLISDQGANG GAHHLDKLGT ITVYGDLVTE SDLIADIFGD GAGMG