| Gene Information Plasmid Coverage information Fosmid Coverage information Sequence |
Gene Information |
| Locus tag | PsycPRwf_1051 |
|---|
| Symbol | |
|---|
| ID | 5205444 |
|---|
| Type | CDS |
|---|
| Is gene spliced | No |
|---|
| Is pseudo gene | No |
|---|
| Organism name | Psychrobacter sp. PRwf-1 |
|---|
| Kingdom | Bacteria |
|---|
| Replicon accession | NC_009524 |
|---|
| Strand | + |
|---|
| Start bp | 1259294 |
|---|
| End bp | 1272586 |
|---|
| Gene Length | 13293 bp |
|---|
| Protein Length | 4430 aa |
|---|
| Translation table | 11 |
|---|
| GC content | 50% |
|---|
| IMG OID | 640599272 |
|---|
| Product | hypothetical protein |
|---|
| Protein accession | YP_001279951 |
|---|
| Protein GI | 148652858 |
|---|
| COG category | |
|---|
| COG ID | |
|---|
| TIGRFAM ID | |
|---|
| 
|
Plasmid Coverage information |
| Num covering plasmid clones | 0 |
|---|
| Plasmid unclonability p-value | 1 |
|---|
| Plasmid hitchhiking | No |
|---|
| Plasmid clonability | normal |
|---|
| |
Fosmid Coverage information |
| Num covering fosmid clones | 34 |
|---|
| Fosmid unclonability p-value | 1 |
|---|
| Fosmid Hitchhiker | No |
|---|
| Fosmid clonability | normal |
|---|
| |
Sequence |
| Gene sequence | GTGATTGGTG AAACCACAAC CGATACAGAT GGCAACTATG AGGTTGAGGT GCCGGTTATT
GCAGATGGCG ATAAGGTTGA GATTACCGCT ACCGATAAAG CTGGCAACGA ATCAGATCCA
GTAGAGGCGA TGGGTGACAC CACAGCACCT GATGCGCCAA CAGCGACAGT AAGTCCAGAT
GGCACGACGG TTACTGGTAA AACTGAGCCA GGCGCCACCG TTGAGATTAA AGACAAAGCC
GGTAACGTAA TAGGTACTGC CACCGCTGAT GACAAGGGCG AGTATACTGC CGAGCTTGAC
GTGCCATTAA CCAATGGCGA AACAATCACT GCTGAAGCAA CTGATAAAGC GGGTAATGGA
CCAAGTACTG CGGTTAACGC CACAGCACCA GATACCACAG CACCTGATGC GCCAACAGCG
ACAGTAAGTC CAGATGGCAC GACGGTTACT GGTAAAACTG AGCCAGGCGC CACCGTTGAG
ATTAAAGACA AAGCCGGTAA CGTAATAGGT ACTGCCACCG CTGATGACAA GGGCGAGTAT
ACTGCCGAGC TTGACGTGCC ATTAACCAAT GGCGAAACAA TCACTGCAGA AGCAACTGAT
AAAGCGGGTA ATGGACCAAG TACTGCGGTT AACGCCACAG CACCAGACAC CACAGCACCT
GATGCGCCAA CGACAGCACC AGATATGACA GCTGCCACAG ATACGGGCAC CAGTGATACT
GACAACTTAA CTTCAGACAC CACGCCTGAC TTCACGGTAG CGACGCCAAC TGATGGCACA
CCTGTGCTTA TTGTTGACGG GGTAGAAGTA CCTGCTACTG TTAAAGACAA TGGTGATGGT
ACCTCAACGT TAACACCAAC TAAGCCATTA ACTGAAGGTG AGCATACGGT TGCCGTTGCG
ACCAAAGATC CTGCGGGTAA CGTAAGTGAT CCAAGTGCCG CTTTACCGGT GACTATTGAC
ACCAAACCAC CTGTGGCCCC AACGACAGCA CCAGATATGA CAGCTGCCAC AGATACGGGC
ACCAGTGATA CTGACAATTT AACTTCAGAC ACCACGCCTG ACTTCACGGT AGCGACGCCA
ACTGATGGCA CACCTGTACT TATTGTTGAC GGGGTAGAAG TACCTGCTAC TGTTAAAGAC
AATGGTGATG GTACCTCAAC GTTAACACCA ACTAAGCCAT TAACTGAAGG TGAGCATACG
GTTGCCGTTG CGACCAAAGA TCCTGCGGGT AACGTAAGTG ATCCAAGTGC CGCTTTACCG
GTGACTATTG ACACCAAACC ACCTGTGGCC CCAACGACAG CACCAGATAT GACAGCTGCC
ACAGATACGG GCACCAGTGA TACTGACAAC TTAACTTCAG ACACCACGCC TGACTTCACG
GTAGCGACGC CAACTGATGG CACACCTGTG CTTATTGTTG ACGGGGTAGA AGTACCTGCT
ACTGTTAAAG ACAATGGTGA TGGTACCTCA ACGTTAACAC CAACTAAGCC ATTAACTGAA
GGTGAGCATA CGGTTGCCGT TGCGACCAAA GATCCTGCGG GTAACGTAAG TGATCCAAGT
GCCGCTTTAC CGGTGACTAT TGACACCAAA CCACCTGTGG CCCCAACGAC AGCACCAGAT
ATGACAGCTG CCACAGATAC GGGCACCAGT GATACTGACA ACTTAACTTC AGACACCACG
CCTGACTTCA CGGTAGCGAC GCCAACTGAT GGCACACCTG TGCTTATTGT TGACGGGGTA
GAAGTACCTG CTACTGTTAA AGACAATGGT GATGGTACCT CAACGTTAAC ACCAACTAAG
CCATTAACTG AAGGTGAGCA TACGGTTGCC GTTGCGACCA AAGATCCTGC GGGTAACGTA
AGTGATCCAA GTGCCGCTTT ACCGGTGACT ATTGACACCA AACCACCTGT GGCCCCAACG
ACAGCACCAG ATATGACAGC TGCCACAGAT ACGGGCACCA GTGATACTGA CAATTTAACT
TCAGACACCA CGCCTGACTT CACGGTAGCG ACGCCAACTG ATGGCACACC TGTGCTTATT
GTTGACGGGG TAGAAGTACC TGCTACTGTT AAAGACAATG GTGATGGTAC CTCAACGTTA
ACACCAACTA AGCCATTAAC TGAAGGTGAG CATACGGTTG CCGTTGCGAC CAAAGATCCT
GCGGGTAACG TAAGTGATCC AAGTGCCGCT TTACCGGTGA CTATTGATAC CAAACCACCT
GTGGCCCCAA CGACAGCACC AGATATGACA GCTGCCACAG ATACGGGCAC CAGTGATACT
GACAACTTAA CTTCAGACAC CACGCCTGAC TTCACGGTAG CGACGCCAAC TGATGGCACA
CCTGTGCTTA TTGTTGACGG GGTAGAAGTA CCTGCTACTG TTAAAGACAA TGGTGATGGT
ACCTCAACAT TAACACCAAC TAAGCCATTA ACTGAAGGTG AGCATACGGT TGCCGTTGCG
ACCAAAGATC CTGCGGGTAA CGTAAGTGAT CCAAGTGCCG CTTTACCGGT GACTATTGAC
ACCAAACCAC CTGTGGCCCC AACGACAGCA CCAGATATGA CAGCTGCCAC AGATACGGGC
ACCAGTGATA CTGACAATTT AACTTCAGAC ACCACGCCTG ACTTCACGGT AGCGACGCCA
ACTGATGGCA CACCTGTGCT TATTGTTGAC GGGGTAGAAG TACCTGCTAC TGTTAAAGAC
AATGGTGATG GTACCTCAAC GTTAACACCA ACTAAGCCAT TAACTGAAGG TGAGCATACG
GTTGCCGTTG CGACCAAAGA TCCTGCGGGT AACGTAAGTG ATCCAAGTGC CGCTTTACCG
GTGACTATTG ACACCAAACC ACCTGTGGCC CCAACGACAG CACCAGATAT GACAGCTGCC
ACAGATACGG GCACCAGTGA TACTGACAAT TTAACTTCAG ACACCACGCC TGACTTCACG
GTAGCGACGC CAACTGATGG CACACCTGTG CTTATTGTTG ACGGGGTAGA AGTACCTGCT
ACTGTTAAAG ACAATGGTGA TGGTACCTCA ACGTTAACAC CAACTAAGCC ATTAACTGAA
GGTGAGCATA CGGTTGCCGT TGCGACCAAA GATCCTGCGG GTAACGTAAG TGATCCAAGT
GCCGCTTTAC CGGTGACTAT TGACACCAAA CCACCTGTGG CCCCAACGAC AGCACCAGAT
ATGACAGCTG CCACAGATAC GGGCACCAGT GATACTGACA ACTTAACTTC AGACACCACG
CCTGACTTCA CGGTAGCGAC GCCAACTGAT GGCACACCTG TGCTTATTGT TGACGGGGTA
GAAGTACCTG CTACTGTTAA AGACAATGGT GATGGTACCT CAACGTTAAC ACCAACTAAG
CCATTAACTG AAGGTGAGCA TACGGTTGCC GTTGCGACCA AAGATCCTGC GGGTAACGTA
AGTGATCCAA GTGCCGCTTT ACCGGTGACT ATTGACACCA AACCACCTGT GGCCCCAACG
ACAGCACCAG ATATGACAGC TGCCACAGAT ACGGGCACCA GTGATACTGA CAACTTAACT
TCAGACACCA CGCCTGACTT CACGGTAGCG ACGCCAACTG ATGGCACACC TGTACTTATT
GTTGACGGGG TAGAAGTACC TGCTACTGTT AAAGACAATG GTGATGGTAC CTCAACGTTA
ACACCAACTA AGCCATTAAC TGAAGGTGAG CATACGGTTG CCGTTGCGAC CAAAGATCCT
GCGGGTAACG TAAGTGATCC AAGTGCCGCT TTACCGGTGA CTATTGACAC CAAACCACCT
GTGGCCCCAA CGACAGCACC AGATATGACA GCTGCCACAG ATACGGGCAC CAGTGATACT
GACAATTTAA CTTCAGACAC CACGCCTGAC TTCACGGTAG CGACGCCAAC TGATGGCACA
CCTGTGCTTA TTGTTGACGG GGTAGAAGTA CCTGCTACTG TTAAAGACAA TGGTGATGGT
ACCTCAACGT TAACACCAAC TAAGCCATTA ACTGAAGGTG AGCATACGGT TGCCGTTGCG
ACCAAAGATC CTGCGGGTAA CGTAAGTGAT CCAAGTGCCG CTTTACCGGT GACTATTGAC
ACCAAACCAC CTGTGGCCCC AACGACAGCA CCAGATATGA CAGCTGCCAC AGATACGGGC
ACCAGTGATA CTGACAACTT AACTTCAGAC ACCACGCCTG ACTTCACGGT AGCGACGCCA
ACTGATGGCA CACCTGTGCT TATTGTTGAC GGGGTAGAAG TACCTGCTAC TGTTAAAGAC
AATGGTGATG GTACCTCAAC GTTAACACCA ACTAAGCCAT TAACTGAAGG TGAGCATACG
GTTGCCGTTG CGACCAAAGA TCCTGCGGGT AACGTAAGTG ATCCAAGTGC CGCTTTACCG
GTGACTATTG ACACCAAACC ACCTGTGGCC CCAACGACAG CACCAGATAT GACAGCTGCC
ACAGATACGG GCACCAGTGA TACTGACAAT TTAACTTCAG ACACCACGCC TGACTTCACG
GTAGCGACGC CAACTGATGG CACACCTGTG CTTATTGTTG ACGGGGTAGA AGTACCTGCT
ACTGTTAAAG ACAATGGTGA TGGTACCTCA ACGTTAACAC CAACTAAGCC ATTAACTGAA
GGTGAGCATA CGGTTGCCGT TGCGACCAAA GATCCTGCGG GTAACGTAAG TGATCCAAGT
GCCGCTTTAC CGGTGACTAT TGACACCAAA CCACCTGTGG CCCCAACGAC AGCACCAGAT
ATGACAGCTG CCACAGATAC GGGCACCAGT GATACTGACA ATTTAACTTC AGACAACACG
CCTGACTTCA CGGTAGCGAC GCCAACTGAT GGCACACCTG TGCTTATTGT TGACGGGGTA
GAAGTACCTG CTACTGTTAA AGACAATGGT GATGGTACCT CAACGTTAAC ACCAACTAAG
CCATTAACTG AAGGTGAGCA TACGGTTGCC GTTGCGACCA AAGATCCTGC GGGTAACGTA
AGTGATCCAA GTGCCGCTTT ACCGGTGACT ATTGATACCA AACCACCTGT GGCCCCAACG
ACAGCACCAG ATATGACAGC TGCCACAGAT ACGGGCACCA GTGATACTGA CAACTTAACT
TCAGACACCA CGCCTGACTT CACGGTAGCG ACGCCAACTG ATGGCACACC TGTACTTATT
GTTGACGGGG TAGAAGTACC TGCTACTGTT AAAGACAATG GTGATGGTAC CTCAACGTTA
ACACCAACTA AGCCATTAAC TGAAGGTGAG CATACGGTTG CCGTTGCGAC CAAAGATCCT
GCGGGTAACG TAAGTGATCC AAGTGCCGCT TTACCGGTGA CTATTGATAC CAAACCACCT
GTGGCCCCAA CGACAGCACC AGATATGACA GCTGCCACAG ATACGGGCAC CAGTGATACT
GACAATTTAA CTTCAGACAC CACGCCTGAC TTCACGGTAG CGACGCCAAC TGATGGCACA
CCTGTGCTTA TTGTTGACGG GGTAGAAGTA CCTGCTACTG TTAAAGACAA TGGTGATGGT
ACCTCAACGT TAACACCAAC TAAGCCATTA ACTGAAGGTG AGCATACGGT TGCCGTTGCG
ACCAAAGATC CTGCGGGTAA CGTAAGTGAT CCAAGTGCCG CTTTACCGGT GACTATTGAC
ACCAAACCAC CTGTGGCCCC AACGACAGCA CCAGATATGA CAGCTGCCAC AGATACGGGC
ACCAGTGATA CTGACAACTT AACTTCAGAC ACCACGCCTG ACTTCACGGT AGCGACGCCA
ACTGATGGCA CACCTGTGCT TATTGTTGAC GGGGTAGAAG TACCTGCTAC TGTTAAAGAC
AATGGTGATG GTACCTCAAC GTTAACACCA ACTAAGCCAT TAACTGAAGG TGAGCATACG
GTTGCCGTTG CGACCAAAGA TCCTGCGGGT AACGTAAGTG ATCCAAGTGC CGCTTTACCG
GTGACTATTG ACACCAAACC ACCTGTGGCC CCAACGACAG CACCAGATAT GACAGCTGCC
ACAGATACGG GCACCAGTGA TACTGACAAC TTAACTTCAG ACACCACGCC TGACTTCACG
GTAGCGACGC CAACTGATGG CACACCTGTA CTTATTGTTG ACGGGGTAGA AGTACCTGCT
ACTGTTAAAG ACAATGGTGA TGGTACCTCA ACGTTAACAC CAACTAAGCC ATTAACTGAA
GGTGAGCATA CGGTTGCCGT TGCGACCAAA GATCCTGCGG GTAACGTAAG TGATCCAAGT
GCCGCTTTAC CGGTGACTAT TGATACCAAA CCACCTGTGG CCCCAACGAC AGCACCAGAT
ATGACAGCTG CCACAGATAC GGGCACCAGT GATACTGACA ATTTAACTTC AGACACCACG
CCTGACTTCA CGGTAGCGAC GCCAACTGAT GGCACACCTG TACTTATTGT TGACGGGGTA
GAAGTACCTG CTACTGTTAA AGACAATGGT GATGGTACCT CAACGTTAAC ACCAACTAAG
CCATTAACTG AAGGTGAGCA TACGGTTGCC GTTGCGACCA AAGATCCTGC GGGTAACGTA
AGTGATCCAA GTGCCGCTTT ACCGGTGACT ATTGATACCA AACCACCTGT GGCCCCAACG
ACAGCACCAG ATATGACAGC TGCCACAGAT ACGGGCACCA GTGATACTGA CAACTTAACT
TCAGACACCA CGCCTGACTT CACGGTAGCG ACGCCAACTG ATGGCACACC TGTGCTTATT
GTTGACGGGG TAGAAGTACC TGCTACTGTT AAAGACAATG GTGATGGTAC CTCAACGTTA
ACACCAACTA AGCCATTAAC TGAAGGTGAG CATACGGTTG CCGTTGCGAC CAAAGATCCT
GCGGGTAACG TAAGTGATCC AAGTGCCGCT TTACCGGTGA CTATTGACAC CAAACCACCT
GTGGCCCCAA CGACAGCACC AGATATGACA GCTGCCACAG ATACGGGCAC CAGTGATACT
GACAATTTAA CTTCAGACAC CACGCCTGAC TTCACGGTAG CGACGCCAAC TGATGGCACA
CCTGTGCTTA TTGTTGACGG GGTAGAAGTA CCTGCTACTG TTAAAGACAA TGGTGATGGT
ACCTCAACGT TAACACCAAC TAAGCCATTA ACTGAAGGTG AGCATACGGT TGCCGTTGCG
ACCAAAGATC CTGCGGGTAA CGTAAGTGAT CCAAGTGCCG CTTTACCGGT GACTATTGAC
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ACCAGTGATA CTGACAACTT AACTTCAGAC ACCACGCCTG ACTTCACGGT AGCGACGCCA
ACTGATGGCA CACCTGTGCT TATTGTTGAC GGGGTAGAAG TACCTGCTAC TGTTAAAGAC
AATGGTGATG GTACCTCAAC GTTAACACCA ACTAAGCCAT TAACTGAAGG TGAGCATACG
GTTGCCGTTG CGACCAAAGA TCCTGCGGGT AACGTAAGTG ATCCAAGTGC CGCTTTACCG
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ACAGATACGG GCACCAGTGA TACTGACAAT TTAACTTCAG ACACCACGCC TGACTTCACG
GTAGCGACGC CAACTGATGG CACACCTGTG CTTATTGTTG ACGGGGTAGA AGTACCTGCT
ACTGTTAAAG ACAATGGTGA TGGTACCTCA ACGTTAACAC CAACTAAGCC ATTAACTGAA
GGTGAGCATA CGGTTGCCGT TGCGACCAAA GATCCTGCGG GTAACGTAAG TGATCCAAGT
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ATGACAGCTG CCACAGATAC GGGCACCAGT GATACTGACA ATTTAACTTC AGACACCACG
CCTGACTTCA CGGTAGCGAC GCCAACTGAT GGCACACCTG TGCTTATTGT TGACGGGGTA
GAAGTACCTG CTACTGTTAA AGACAATGGT GATGGTACCT CAACGTTAAC ACCAACTAAG
CCATTAACTG AAGGTGAGCA TACGGTTGCC GTTGCGACCA AAGATCCTGC GGGTAACGTA
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GTTGACGGGG TAGAAGTACC TGCTACTGTT AAAGACAATG GTGATGGTAC CTCAACGTTA
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GCGGGTAACG TAAGTGATCC AAGTGCCGCT TTACCGGTGA CTATTGACAC CAAACCACCT
GTGGCCCCAA CGACAGCACC AGATATGACA GCTGCCACAG ATACGGGCAC CAGTGATACT
GACAATTTAA CTTCAGACAC CACGCCTGAC TTCACGGTAG CGACGCCAAC TGATGGCACA
CCTGTGCTTA TTGTTGACGG GGTAGAAGTA CCTGCTACTG TTAAAGACAA TGGTGATGGT
ACCTCAACGT TAACACCAAC TAAGCCATTA ACTGAAGGTG AGCATACGGT TGCCGTTGCG
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ACCAGTGATA CTGACAATTT AACTTCAGAC ACCACGCCTG ACTTCACGGT AGCGACGCCA
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AGTGATCCAA GTGCCGCTTT ACCGGTGACT ATTGACACCA AACCACCTGT GAGTGCGGCA
ACCGTTGCGC TTACTGCGGA TACCAACAAT GATGGCTTAT TAAGTACAGC AGAGTTAAAT
GGCGCAACGA CCACGCCAGT AGAAATCAGC ATTCCAAGCG ATGCCCAAGT CGGTGACGTG
ATTACGGTTA CAGACAATGC AGGTACAACC ATTGCCATTT ATACTGTAAG CGATGGCACC
GATGGCACTG TGACTGCCGG TAGCACCCAA ACTGCAACGG CCAACGTACC AGCAGATGGT
TCGACCTTAA CGGTGACCAG CACCATTACC GATGCTGCAG GCAACACCGG TCCAAATTCA
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|
|---|
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